Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0Y550

Protein Details
Accession A0A6H0Y550    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-292ALKSEKPVEKEKKKMSKSEKMKKRKSRANVQSPTKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-284KAKELAAKVPAALKSEKPVEKEKKKMSKSEKMKKRKSRA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MPDPLDEQQWQRPEIAQWYVQHGAEQGFPWATQYMHENMLHRYFSESIFFDFTSKNGMPIDQSATDPGAWALTHNRRDFEEWLSQREGVEYVIVDSKDGVHVIRKQDRKKASKDELTTLGTYFLIGENMYQAPSVADIVGNRLMTATTALSDFIEQALVLPQWTPVGYTYTRRAESPPRSREGSVQSVVEQPASHTKALTVLKTMQFADEFMDENPIQGEPGHFTFSSSTAAVKKRKADEEAVALKAKELAAKVPAALKSEKPVEKEKKKMSKSEKMKKRKSRANVQSPTKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.33
4 0.3
5 0.35
6 0.37
7 0.35
8 0.32
9 0.28
10 0.25
11 0.22
12 0.2
13 0.17
14 0.14
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.13
20 0.16
21 0.16
22 0.2
23 0.22
24 0.22
25 0.25
26 0.29
27 0.29
28 0.25
29 0.26
30 0.23
31 0.22
32 0.24
33 0.21
34 0.19
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.17
39 0.17
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.16
44 0.17
45 0.16
46 0.18
47 0.22
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.16
53 0.15
54 0.13
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.15
59 0.22
60 0.29
61 0.3
62 0.32
63 0.33
64 0.37
65 0.38
66 0.35
67 0.37
68 0.32
69 0.35
70 0.35
71 0.34
72 0.3
73 0.29
74 0.24
75 0.15
76 0.13
77 0.09
78 0.07
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.14
89 0.21
90 0.29
91 0.36
92 0.4
93 0.48
94 0.57
95 0.6
96 0.63
97 0.66
98 0.66
99 0.66
100 0.64
101 0.6
102 0.55
103 0.5
104 0.43
105 0.34
106 0.26
107 0.18
108 0.15
109 0.12
110 0.08
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.08
154 0.09
155 0.12
156 0.18
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.26
161 0.31
162 0.4
163 0.47
164 0.47
165 0.46
166 0.49
167 0.49
168 0.5
169 0.47
170 0.43
171 0.34
172 0.3
173 0.27
174 0.27
175 0.26
176 0.22
177 0.16
178 0.12
179 0.18
180 0.2
181 0.18
182 0.16
183 0.16
184 0.21
185 0.23
186 0.22
187 0.18
188 0.2
189 0.21
190 0.23
191 0.23
192 0.18
193 0.16
194 0.16
195 0.15
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.11
207 0.09
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.14
216 0.15
217 0.17
218 0.25
219 0.29
220 0.32
221 0.38
222 0.42
223 0.47
224 0.49
225 0.48
226 0.46
227 0.49
228 0.49
229 0.45
230 0.41
231 0.35
232 0.31
233 0.29
234 0.25
235 0.19
236 0.15
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.19
242 0.2
243 0.22
244 0.24
245 0.23
246 0.26
247 0.34
248 0.37
249 0.37
250 0.46
251 0.53
252 0.6
253 0.68
254 0.73
255 0.75
256 0.78
257 0.84
258 0.83
259 0.83
260 0.85
261 0.86
262 0.86
263 0.87
264 0.91
265 0.92
266 0.93
267 0.92
268 0.91
269 0.91
270 0.92
271 0.92
272 0.91