Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XR58

Protein Details
Accession A0A6H0XR58    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
410-439KRRRENEVRKEERDRRNAERNDRRQSNKRA
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIISPVVEELPQELDNGDGTKTVLPVDARKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPANEEEMMIAVFEYTERVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAADKDKATAEYHAMLKASGRDAEIEGGEKPKKTWDSNAITPGTPFMNILAQSLRYWVSYKLSTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPTHDPNTRHVIYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFANDTKPGHCRKCNQPGHMADQCRGAPKPKPGEEVPEKPLKPFIWLHVGILREYLAVEMSVPAQKFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREDGIDTLIAIWRDNIPAMGGYVTKDGHVDLTRAQVILEGLAKQEDAIFKRRRENEVRKEERDRRNAERNDRRQSNKRARFSGGSSGFDESVIQRGAGGGIRKADDIAPDMNALPMFALKDAQTKNDPRYQAGLTHADVVGGTAVIDKANADNRSAAAALKDKLKNGTALGKRTASMREEADEVSTDPSTPGRNTPNIEISRGTSGALGGNSSEQDMMPEDTVKLWENGYQGRYYEQKFHVSPDDVEFRHKVARSYVEGLAWVLLYYMQGCPSWTWYYPYHYAPFGADFQDMDKQVIKFDKGGPFRPYEQLMGVMPAASNHTIPAVFHPLMTDEDSSIKEFYPVDFDVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKRLLDAMATKYPLLTEDEKRRNAFGEEALIFSTKHPLYPSVSASFFGKKAGDGKLKLNHKLSEGLHGKIVKNEEYIPGSSLDFPLPSTQEKYASLDEDGSVSVHYMMPVLPSLHQSMLLPGVKFGPPVLDYNDIQTTRSKAERSGRSHGGVRLSENGDRSDGRRINYAARDDMYGGNSTRGHDNGHNGRDDRHRGNQQQPWQNLPPGLAAQAAAHGFNQQGSHNGYNGPPQGYPPAQRGGYGYADQGGYASGYGGGHQGGYQGNYQNQGYNNSAGRGYEGGYNQGGYNQGYNGQQGGRNNYNNQGYGNGGHGGYGGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.66
4 0.68
5 0.65
6 0.62
7 0.59
8 0.53
9 0.46
10 0.42
11 0.35
12 0.32
13 0.27
14 0.2
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.12
20 0.09
21 0.1
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.14
26 0.15
27 0.21
28 0.29
29 0.37
30 0.4
31 0.47
32 0.51
33 0.55
34 0.56
35 0.54
36 0.5
37 0.44
38 0.45
39 0.41
40 0.4
41 0.33
42 0.3
43 0.26
44 0.22
45 0.18
46 0.12
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.31
58 0.39
59 0.45
60 0.53
61 0.53
62 0.53
63 0.53
64 0.53
65 0.44
66 0.38
67 0.32
68 0.24
69 0.21
70 0.15
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.1
81 0.16
82 0.26
83 0.33
84 0.36
85 0.37
86 0.39
87 0.41
88 0.41
89 0.39
90 0.32
91 0.29
92 0.26
93 0.24
94 0.24
95 0.21
96 0.2
97 0.18
98 0.15
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.36
104 0.45
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.82
110 0.78
111 0.76
112 0.75
113 0.73
114 0.7
115 0.7
116 0.65
117 0.62
118 0.64
119 0.57
120 0.47
121 0.42
122 0.36
123 0.28
124 0.26
125 0.23
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.2
130 0.19
131 0.19
132 0.2
133 0.19
134 0.16
135 0.15
136 0.15
137 0.16
138 0.18
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.19
143 0.21
144 0.2
145 0.2
146 0.26
147 0.31
148 0.33
149 0.39
150 0.42
151 0.47
152 0.52
153 0.58
154 0.53
155 0.48
156 0.45
157 0.39
158 0.3
159 0.23
160 0.17
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.14
172 0.15
173 0.18
174 0.19
175 0.21
176 0.23
177 0.27
178 0.26
179 0.3
180 0.32
181 0.34
182 0.35
183 0.34
184 0.31
185 0.3
186 0.35
187 0.3
188 0.29
189 0.24
190 0.21
191 0.24
192 0.24
193 0.21
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.13
203 0.14
204 0.16
205 0.18
206 0.22
207 0.3
208 0.31
209 0.33
210 0.36
211 0.4
212 0.46
213 0.5
214 0.55
215 0.56
216 0.6
217 0.63
218 0.62
219 0.66
220 0.58
221 0.52
222 0.42
223 0.34
224 0.28
225 0.27
226 0.21
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.06
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.13
243 0.14
244 0.18
245 0.2
246 0.21
247 0.22
248 0.23
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.2
253 0.2
254 0.19
255 0.18
256 0.22
257 0.29
258 0.32
259 0.37
260 0.43
261 0.5
262 0.6
263 0.67
264 0.66
265 0.67
266 0.64
267 0.66
268 0.65
269 0.57
270 0.47
271 0.44
272 0.41
273 0.36
274 0.33
275 0.29
276 0.28
277 0.35
278 0.42
279 0.41
280 0.45
281 0.43
282 0.51
283 0.54
284 0.55
285 0.52
286 0.51
287 0.48
288 0.43
289 0.47
290 0.38
291 0.35
292 0.31
293 0.29
294 0.28
295 0.28
296 0.29
297 0.27
298 0.27
299 0.23
300 0.22
301 0.18
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.14
317 0.18
318 0.16
319 0.2
320 0.22
321 0.24
322 0.25
323 0.27
324 0.24
325 0.19
326 0.18
327 0.14
328 0.11
329 0.08
330 0.08
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.07
353 0.05
354 0.05
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.07
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.12
379 0.13
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.07
392 0.09
393 0.11
394 0.19
395 0.25
396 0.28
397 0.36
398 0.4
399 0.46
400 0.53
401 0.61
402 0.63
403 0.69
404 0.73
405 0.71
406 0.76
407 0.79
408 0.77
409 0.76
410 0.71
411 0.67
412 0.7
413 0.71
414 0.72
415 0.73
416 0.73
417 0.74
418 0.76
419 0.75
420 0.74
421 0.78
422 0.79
423 0.77
424 0.74
425 0.69
426 0.65
427 0.61
428 0.55
429 0.53
430 0.45
431 0.37
432 0.33
433 0.3
434 0.26
435 0.23
436 0.21
437 0.12
438 0.12
439 0.09
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.09
445 0.09
446 0.07
447 0.08
448 0.09
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.08
453 0.1
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.07
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.11
468 0.11
469 0.14
470 0.18
471 0.21
472 0.25
473 0.29
474 0.3
475 0.25
476 0.28
477 0.27
478 0.24
479 0.24
480 0.23
481 0.18
482 0.19
483 0.18
484 0.14
485 0.13
486 0.11
487 0.07
488 0.05
489 0.04
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.04
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.11
502 0.12
503 0.11
504 0.08
505 0.1
506 0.1
507 0.16
508 0.17
509 0.17
510 0.18
511 0.19
512 0.18
513 0.17
514 0.24
515 0.21
516 0.23
517 0.25
518 0.23
519 0.23
520 0.24
521 0.25
522 0.18
523 0.17
524 0.15
525 0.14
526 0.14
527 0.14
528 0.13
529 0.11
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.08
534 0.07
535 0.08
536 0.09
537 0.09
538 0.12
539 0.14
540 0.17
541 0.18
542 0.2
543 0.27
544 0.26
545 0.27
546 0.24
547 0.23
548 0.21
549 0.2
550 0.18
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.08
555 0.07
556 0.05
557 0.06
558 0.05
559 0.06
560 0.06
561 0.04
562 0.05
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.07
573 0.09
574 0.1
575 0.13
576 0.14
577 0.13
578 0.13
579 0.15
580 0.18
581 0.17
582 0.22
583 0.22
584 0.26
585 0.25
586 0.28
587 0.29
588 0.27
589 0.27
590 0.24
591 0.27
592 0.22
593 0.25
594 0.23
595 0.21
596 0.23
597 0.23
598 0.21
599 0.18
600 0.22
601 0.22
602 0.25
603 0.25
604 0.2
605 0.2
606 0.19
607 0.16
608 0.12
609 0.09
610 0.05
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.1
620 0.13
621 0.12
622 0.16
623 0.17
624 0.22
625 0.25
626 0.28
627 0.26
628 0.24
629 0.24
630 0.2
631 0.21
632 0.17
633 0.15
634 0.12
635 0.1
636 0.11
637 0.14
638 0.14
639 0.13
640 0.15
641 0.14
642 0.16
643 0.18
644 0.17
645 0.15
646 0.2
647 0.26
648 0.26
649 0.32
650 0.32
651 0.33
652 0.35
653 0.36
654 0.33
655 0.27
656 0.24
657 0.21
658 0.18
659 0.16
660 0.13
661 0.1
662 0.08
663 0.07
664 0.08
665 0.07
666 0.07
667 0.06
668 0.07
669 0.07
670 0.07
671 0.1
672 0.14
673 0.13
674 0.13
675 0.13
676 0.14
677 0.16
678 0.17
679 0.15
680 0.09
681 0.11
682 0.12
683 0.13
684 0.13
685 0.11
686 0.11
687 0.11
688 0.1
689 0.13
690 0.13
691 0.14
692 0.13
693 0.13
694 0.14
695 0.17
696 0.17
697 0.14
698 0.14
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.12
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.14
707 0.16
708 0.15
709 0.14
710 0.13
711 0.12
712 0.12
713 0.12
714 0.09
715 0.07
716 0.11
717 0.11
718 0.11
719 0.1
720 0.15
721 0.17
722 0.2
723 0.2
724 0.17
725 0.17
726 0.17
727 0.17
728 0.17
729 0.18
730 0.22
731 0.31
732 0.39
733 0.44
734 0.45
735 0.45
736 0.42
737 0.4
738 0.35
739 0.26
740 0.23
741 0.19
742 0.19
743 0.19
744 0.17
745 0.16
746 0.14
747 0.2
748 0.14
749 0.15
750 0.15
751 0.17
752 0.2
753 0.23
754 0.26
755 0.23
756 0.24
757 0.23
758 0.24
759 0.25
760 0.21
761 0.19
762 0.16
763 0.14
764 0.17
765 0.23
766 0.27
767 0.27
768 0.33
769 0.39
770 0.45
771 0.5
772 0.5
773 0.45
774 0.41
775 0.45
776 0.39
777 0.41
778 0.39
779 0.34
780 0.33
781 0.34
782 0.33
783 0.31
784 0.33
785 0.25
786 0.23
787 0.24
788 0.23
789 0.22
790 0.23
791 0.2
792 0.18
793 0.18
794 0.17
795 0.17
796 0.14
797 0.11
798 0.11
799 0.12
800 0.14
801 0.15
802 0.18
803 0.18
804 0.2
805 0.21
806 0.25
807 0.24
808 0.24
809 0.22
810 0.19
811 0.18
812 0.16
813 0.15
814 0.11
815 0.09
816 0.08
817 0.08
818 0.07
819 0.07
820 0.07
821 0.06
822 0.07
823 0.08
824 0.09
825 0.09
826 0.11
827 0.13
828 0.13
829 0.14
830 0.13
831 0.13
832 0.18
833 0.2
834 0.18
835 0.16
836 0.19
837 0.19
838 0.18
839 0.17
840 0.14
841 0.13
842 0.15
843 0.18
844 0.2
845 0.2
846 0.23
847 0.29
848 0.26
849 0.26
850 0.27
851 0.26
852 0.26
853 0.3
854 0.28
855 0.28
856 0.38
857 0.46
858 0.5
859 0.54
860 0.55
861 0.55
862 0.58
863 0.55
864 0.51
865 0.44
866 0.39
867 0.37
868 0.36
869 0.35
870 0.32
871 0.3
872 0.26
873 0.26
874 0.26
875 0.3
876 0.3
877 0.29
878 0.33
879 0.34
880 0.38
881 0.43
882 0.44
883 0.38
884 0.36
885 0.35
886 0.32
887 0.31
888 0.26
889 0.23
890 0.2
891 0.2
892 0.2
893 0.2
894 0.22
895 0.21
896 0.23
897 0.23
898 0.32
899 0.36
900 0.4
901 0.43
902 0.41
903 0.45
904 0.5
905 0.54
906 0.51
907 0.52
908 0.57
909 0.59
910 0.68
911 0.71
912 0.72
913 0.74
914 0.71
915 0.7
916 0.65
917 0.61
918 0.53
919 0.46
920 0.39
921 0.3
922 0.27
923 0.2
924 0.16
925 0.12
926 0.14
927 0.13
928 0.11
929 0.1
930 0.11
931 0.11
932 0.12
933 0.13
934 0.11
935 0.15
936 0.2
937 0.22
938 0.22
939 0.23
940 0.23
941 0.28
942 0.31
943 0.29
944 0.23
945 0.24
946 0.3
947 0.32
948 0.34
949 0.32
950 0.35
951 0.33
952 0.33
953 0.34
954 0.31
955 0.31
956 0.28
957 0.25
958 0.21
959 0.2
960 0.19
961 0.17
962 0.13
963 0.09
964 0.08
965 0.07
966 0.06
967 0.06
968 0.07
969 0.08
970 0.08
971 0.08
972 0.08
973 0.1
974 0.1
975 0.12
976 0.16
977 0.19
978 0.21
979 0.25
980 0.26
981 0.27
982 0.28
983 0.31
984 0.31
985 0.31
986 0.31
987 0.29
988 0.29
989 0.25
990 0.25
991 0.21
992 0.19
993 0.19
994 0.18
995 0.2
996 0.2
997 0.21
998 0.19
999 0.2
1000 0.21
1001 0.17
1002 0.17
1003 0.15
1004 0.17
1005 0.18
1006 0.19
1007 0.2
1008 0.2
1009 0.22
1010 0.26
1011 0.33
1012 0.38
1013 0.42
1014 0.44
1015 0.49
1016 0.51
1017 0.49
1018 0.45
1019 0.38
1020 0.33
1021 0.29
1022 0.28
1023 0.22
1024 0.18
1025 0.16
1026 0.16