Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0Y1H8

Protein Details
Accession A0A6H0Y1H8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
416-437PGSPVRKSKSARPPSNRRMSNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-135KVPRPR
421-427RKSKSAR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MSASNAQTTSNLRPRTRRLISGLDEGDEVDFDPTTAPTRRIASPVPSLLDHRSASPIPPTHLPRPTSSYDRRLANTTDRGERGTGVRGLGPDSSTSLERLWGTSWTAIQGIASDLLGSSTHDGPPLAKGKVPRPRRSGEQLSKHRATVSAPPMTWGPRTPGEAPTINDVGTGTREEMEAALRARKMIDLLTAQDTSFIDSLGRYKRRTSDEAVAATTEADERNARDALVYLHHVQKGDTLAGITLRYSCTAEVVRRTNRMWPNDPVQSRTTILLPVDACGVKGRRVSGPEEVDLLGDENAPIPAGLAETSSSSLLTTNGDAQSRHRSNSNVTSTTAGRSSSVARSTTASEPAWQHDSWTLLPGTTKPTEIVRLLRQALGYFPPARRKSQTFSDMDSPKSSFDRPRSLVAEALNRPPGSPVRKSKSARPPSNRRMSNAGNGYFGSSMAGPGGVGTMDRTVRAPGPGQDSLNAYFAKHLPDVAPPRNQHALYQPDMPLFSDDITPTPSGTSTPSANKNLEHMGSAIESWMRRVASKAKEAATPAERHRAARASVGAPGKGAGGIGDLIEMTDEFEIGMDDEAEAAEDARGRSAIVGSGSSATATSHGVAPMRQRGIMKSGKAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.68
3 0.69
4 0.67
5 0.64
6 0.65
7 0.64
8 0.65
9 0.58
10 0.49
11 0.43
12 0.37
13 0.31
14 0.22
15 0.18
16 0.1
17 0.08
18 0.07
19 0.08
20 0.08
21 0.13
22 0.16
23 0.17
24 0.2
25 0.24
26 0.27
27 0.3
28 0.33
29 0.34
30 0.38
31 0.41
32 0.4
33 0.37
34 0.38
35 0.37
36 0.39
37 0.34
38 0.28
39 0.29
40 0.28
41 0.28
42 0.32
43 0.31
44 0.3
45 0.37
46 0.43
47 0.45
48 0.51
49 0.52
50 0.49
51 0.52
52 0.54
53 0.56
54 0.56
55 0.56
56 0.55
57 0.58
58 0.56
59 0.54
60 0.53
61 0.52
62 0.52
63 0.49
64 0.49
65 0.46
66 0.45
67 0.41
68 0.39
69 0.33
70 0.3
71 0.27
72 0.21
73 0.22
74 0.21
75 0.21
76 0.2
77 0.19
78 0.14
79 0.14
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.14
84 0.16
85 0.15
86 0.16
87 0.15
88 0.14
89 0.16
90 0.16
91 0.16
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.17
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.24
116 0.33
117 0.42
118 0.51
119 0.54
120 0.56
121 0.61
122 0.66
123 0.71
124 0.73
125 0.73
126 0.74
127 0.75
128 0.77
129 0.74
130 0.67
131 0.59
132 0.49
133 0.42
134 0.4
135 0.37
136 0.33
137 0.3
138 0.31
139 0.32
140 0.33
141 0.32
142 0.25
143 0.23
144 0.2
145 0.25
146 0.25
147 0.26
148 0.29
149 0.3
150 0.3
151 0.3
152 0.28
153 0.24
154 0.21
155 0.19
156 0.15
157 0.13
158 0.13
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.11
174 0.12
175 0.1
176 0.13
177 0.15
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.13
184 0.11
185 0.08
186 0.08
187 0.13
188 0.2
189 0.24
190 0.24
191 0.27
192 0.33
193 0.39
194 0.43
195 0.44
196 0.43
197 0.44
198 0.44
199 0.41
200 0.35
201 0.29
202 0.25
203 0.19
204 0.12
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.16
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.15
225 0.12
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.09
237 0.11
238 0.13
239 0.18
240 0.24
241 0.26
242 0.29
243 0.3
244 0.36
245 0.4
246 0.44
247 0.43
248 0.4
249 0.42
250 0.46
251 0.47
252 0.42
253 0.37
254 0.33
255 0.3
256 0.26
257 0.22
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.11
263 0.12
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.15
271 0.15
272 0.17
273 0.2
274 0.22
275 0.23
276 0.21
277 0.21
278 0.19
279 0.17
280 0.15
281 0.13
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.22
310 0.22
311 0.23
312 0.23
313 0.23
314 0.26
315 0.34
316 0.36
317 0.28
318 0.27
319 0.28
320 0.27
321 0.27
322 0.24
323 0.16
324 0.12
325 0.11
326 0.13
327 0.13
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.15
332 0.18
333 0.18
334 0.19
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.19
339 0.21
340 0.18
341 0.18
342 0.16
343 0.18
344 0.15
345 0.16
346 0.14
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.13
355 0.16
356 0.17
357 0.2
358 0.19
359 0.22
360 0.23
361 0.23
362 0.22
363 0.19
364 0.19
365 0.17
366 0.17
367 0.16
368 0.17
369 0.26
370 0.28
371 0.32
372 0.35
373 0.37
374 0.39
375 0.44
376 0.49
377 0.42
378 0.43
379 0.48
380 0.46
381 0.44
382 0.41
383 0.34
384 0.28
385 0.28
386 0.26
387 0.24
388 0.27
389 0.34
390 0.34
391 0.38
392 0.39
393 0.38
394 0.37
395 0.33
396 0.35
397 0.29
398 0.3
399 0.29
400 0.27
401 0.26
402 0.26
403 0.29
404 0.27
405 0.32
406 0.38
407 0.42
408 0.51
409 0.54
410 0.61
411 0.67
412 0.72
413 0.75
414 0.75
415 0.79
416 0.8
417 0.88
418 0.81
419 0.73
420 0.69
421 0.63
422 0.61
423 0.56
424 0.47
425 0.38
426 0.35
427 0.33
428 0.26
429 0.23
430 0.15
431 0.09
432 0.08
433 0.06
434 0.06
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.03
440 0.04
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.1
446 0.11
447 0.13
448 0.15
449 0.16
450 0.22
451 0.24
452 0.24
453 0.24
454 0.26
455 0.26
456 0.27
457 0.23
458 0.17
459 0.17
460 0.17
461 0.19
462 0.17
463 0.16
464 0.14
465 0.21
466 0.29
467 0.31
468 0.37
469 0.35
470 0.4
471 0.46
472 0.45
473 0.4
474 0.4
475 0.4
476 0.36
477 0.39
478 0.35
479 0.3
480 0.3
481 0.29
482 0.23
483 0.18
484 0.16
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.15
489 0.14
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.11
494 0.13
495 0.15
496 0.16
497 0.22
498 0.28
499 0.32
500 0.34
501 0.34
502 0.34
503 0.36
504 0.32
505 0.27
506 0.21
507 0.18
508 0.16
509 0.16
510 0.13
511 0.12
512 0.11
513 0.12
514 0.15
515 0.14
516 0.14
517 0.18
518 0.26
519 0.3
520 0.36
521 0.4
522 0.39
523 0.41
524 0.43
525 0.46
526 0.43
527 0.42
528 0.39
529 0.44
530 0.44
531 0.42
532 0.45
533 0.43
534 0.38
535 0.38
536 0.38
537 0.3
538 0.34
539 0.36
540 0.31
541 0.27
542 0.25
543 0.2
544 0.16
545 0.15
546 0.08
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.06
562 0.06
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.08
572 0.09
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.11
578 0.12
579 0.11
580 0.11
581 0.11
582 0.13
583 0.13
584 0.12
585 0.11
586 0.09
587 0.09
588 0.1
589 0.1
590 0.11
591 0.13
592 0.14
593 0.17
594 0.23
595 0.3
596 0.31
597 0.33
598 0.33
599 0.34
600 0.41
601 0.45