FuNGI

A0A6H0Y1A6

Protein Details

Accession

A0A6H0Y1A6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1033-1054	IKFALLSKKGNRQQQRIKNLVL	Hydrophilic
1073-1096	ARLDKSGNTRSKQRARKLQLGDID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MERQRKRELKDLNDRAWNGDKDVFTTQSPLDSNLKKNTAFIKRLRTAINPAGVSTFLQDVRTLSLHKYLTEIISACFEGICRLKTPGEVAAGVEVVSALHQRFRPEEFTCYLGWLIGRGLSTPDKTQLKQLSPEVREKEEKERLARQRVLLRVATDLWLVGVLRSLEDISRPDDAAKTAKNEVTTKSKSNQKADNGEPEPFPLEVLKDLLGHDREHVNLPLVVLFAKTFAWDILGYQSQKIDQQPGDDSAVVNNGNEYASTDEDEPVPQDDSPLTARDMQQRFKNILIRYFDDLKTHIVRDNKQIAAQGKRNAEAYVKSGEVFEDRQANHDKALKAQEKLISSAQTLAEILDAEMPDLAEKETSSAGVDGGIGLVKTGEYLRGHGDGAGIWEDEDERRFYENLIDLKDRVPGILLEDGKKKKTDEDEVGKKTDTVASKPVENDASTAIANKTVGAQVDTLLTRLLDLANKDQVDQFATEFCFLNSKASRNRLVKAVQEVPKGRTDLLPLYARLIATLGRYLKDVSQGMIDYLDDEFRSLQRRKSKDFLGQVRMVNIRYIAELTKFGVVPEHVIFHCLKVSLDDFSRMNIEIIASLLENCGRYLFRNPETSPRMASFLETLQRKKTAQHLGQQERMLVENAVYYVNPPERAAIQQKERTPLDLYVRKLIYVDLSKKILEKVTKQLRKLHWEEPEVVECLGKVFIKPGKIKFSNIHLLAVMLGTLYRHHTDFAVSVLDEVLERITVGLETNEFKYNQRRIAEVKYLGELYIYRMVDSTLIFDTLFKLLNHGHQPYPEPGKICPIDLPDDYFRVRLVCALLETCGVYFEKGPAKKKLDFFLAYFQYYINVKDPLPMDIDFVIQDTFNMLRPNWTLITADLAEATKTFAAAVKQNSSDTLTSKTVPEEAEADIDDLDVDAVNSDDAQLETEDAEDVDSADEALPEPEDDAEDQAESEDEHIVVTRPEEYRDPAADAEFDRELAKLMADSVESRKFERKPVFDVPLPMRRAVRETAPPAEDSDGDSRPHTPINYPGTIKFALLSKKGNRQQQRIKNLVLNYDLTDEQETAIDATYGPARLDKSGNTRSKQRARKLQLGDIDWT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.68
3	0.66
4	0.58
5	0.5
6	0.47
7	0.4
8	0.36
9	0.39
10	0.36
11	0.28
12	0.3
13	0.26
14	0.26
15	0.26
16	0.27
17	0.31
18	0.34
19	0.4
20	0.44
21	0.49
22	0.44
23	0.47
24	0.53
25	0.54
26	0.56
27	0.56
28	0.59
29	0.59
30	0.64
31	0.63
32	0.59
33	0.58
34	0.57
35	0.57
36	0.47
37	0.42
38	0.38
39	0.35
40	0.31
41	0.24
42	0.21
43	0.15
44	0.15
45	0.15
46	0.15
47	0.18
48	0.19
49	0.2
50	0.18
51	0.24
52	0.24
53	0.24
54	0.25
55	0.24
56	0.23
57	0.25
58	0.24
59	0.18
60	0.19
61	0.19
62	0.17
63	0.14
64	0.13
65	0.15
66	0.18
67	0.19
68	0.18
69	0.21
70	0.22
71	0.24
72	0.26
73	0.25
74	0.24
75	0.22
76	0.21
77	0.19
78	0.18
79	0.16
80	0.13
81	0.09
82	0.06
83	0.06
84	0.08
85	0.08
86	0.12
87	0.15
88	0.18
89	0.21
90	0.25
91	0.3
92	0.3
93	0.35
94	0.33
95	0.34
96	0.31
97	0.3
98	0.27
99	0.21
100	0.18
101	0.14
102	0.12
103	0.11
104	0.11
105	0.1
106	0.13
107	0.16
108	0.19
109	0.2
110	0.28
111	0.31
112	0.32
113	0.4
114	0.44
115	0.44
116	0.48
117	0.53
118	0.55
119	0.54
120	0.62
121	0.58
122	0.56
123	0.58
124	0.56
125	0.58
126	0.57
127	0.58
128	0.56
129	0.62
130	0.65
131	0.68
132	0.68
133	0.65
134	0.64
135	0.62
136	0.61
137	0.53
138	0.46
139	0.39
140	0.35
141	0.3
142	0.23
143	0.18
144	0.13
145	0.11
146	0.1
147	0.07
148	0.09
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.09
153	0.08
154	0.1
155	0.12
156	0.13
157	0.14
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.18
162	0.21
163	0.22
164	0.24
165	0.26
166	0.28
167	0.31
168	0.32
169	0.34
170	0.38
171	0.4
172	0.41
173	0.44
174	0.51
175	0.55
176	0.59
177	0.62
178	0.61
179	0.63
180	0.63
181	0.66
182	0.59
183	0.54
184	0.48
185	0.42
186	0.36
187	0.28
188	0.24
189	0.15
190	0.14
191	0.12
192	0.13
193	0.12
194	0.11
195	0.12
196	0.17
197	0.18
198	0.17
199	0.18
200	0.19
201	0.2
202	0.22
203	0.22
204	0.19
205	0.18
206	0.17
207	0.15
208	0.14
209	0.12
210	0.1
211	0.09
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.08
218	0.07
219	0.08
220	0.11
221	0.16
222	0.17
223	0.17
224	0.18
225	0.17
226	0.21
227	0.22
228	0.24
229	0.2
230	0.22
231	0.24
232	0.26
233	0.27
234	0.24
235	0.22
236	0.16
237	0.18
238	0.16
239	0.13
240	0.1
241	0.09
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.08
246	0.09
247	0.11
248	0.12
249	0.12
250	0.13
251	0.13
252	0.13
253	0.12
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.12
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.15
263	0.19
264	0.27
265	0.31
266	0.34
267	0.38
268	0.41
269	0.42
270	0.43
271	0.46
272	0.39
273	0.41
274	0.41
275	0.39
276	0.39
277	0.42
278	0.38
279	0.33
280	0.32
281	0.31
282	0.29
283	0.27
284	0.26
285	0.27
286	0.29
287	0.35
288	0.4
289	0.37
290	0.35
291	0.39
292	0.4
293	0.42
294	0.45
295	0.43
296	0.39
297	0.39
298	0.39
299	0.35
300	0.32
301	0.26
302	0.22
303	0.19
304	0.17
305	0.16
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.17
312	0.17
313	0.21
314	0.26
315	0.26
316	0.26
317	0.31
318	0.29
319	0.27
320	0.36
321	0.36
322	0.32
323	0.35
324	0.36
325	0.32
326	0.34
327	0.32
328	0.24
329	0.21
330	0.22
331	0.19
332	0.15
333	0.14
334	0.11
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.04
347	0.04
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.04
364	0.04
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.12
373	0.09
374	0.1
375	0.09
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.09
382	0.08
383	0.08
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.14
388	0.18
389	0.19
390	0.21
391	0.21
392	0.2
393	0.21
394	0.23
395	0.2
396	0.15
397	0.13
398	0.1
399	0.11
400	0.14
401	0.15
402	0.15
403	0.22
404	0.25
405	0.26
406	0.27
407	0.26
408	0.26
409	0.29
410	0.33
411	0.34
412	0.41
413	0.48
414	0.5
415	0.51
416	0.47
417	0.42
418	0.36
419	0.32
420	0.24
421	0.18
422	0.2
423	0.19
424	0.21
425	0.21
426	0.23
427	0.2
428	0.18
429	0.17
430	0.12
431	0.12
432	0.1
433	0.11
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.07
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.07
448	0.07
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.09
455	0.13
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.14
460	0.14
461	0.13
462	0.11
463	0.09
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.09
468	0.1
469	0.1
470	0.15
471	0.15
472	0.19
473	0.23
474	0.27
475	0.34
476	0.35
477	0.36
478	0.35
479	0.36
480	0.34
481	0.35
482	0.38
483	0.35
484	0.37
485	0.38
486	0.36
487	0.36
488	0.34
489	0.29
490	0.22
491	0.2
492	0.17
493	0.18
494	0.18
495	0.15
496	0.16
497	0.16
498	0.15
499	0.13
500	0.12
501	0.09
502	0.07
503	0.1
504	0.09
505	0.09
506	0.1
507	0.1
508	0.1
509	0.13
510	0.13
511	0.1
512	0.11
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.09
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.13
525	0.15
526	0.2
527	0.28
528	0.32
529	0.36
530	0.4
531	0.43
532	0.44
533	0.5
534	0.5
535	0.48
536	0.48
537	0.44
538	0.42
539	0.39
540	0.32
541	0.25
542	0.19
543	0.13
544	0.1
545	0.1
546	0.08
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.09
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.09
556	0.09
557	0.1
558	0.09
559	0.1
560	0.11
561	0.1
562	0.11
563	0.09
564	0.09
565	0.08
566	0.09
567	0.09
568	0.09
569	0.11
570	0.11
571	0.11
572	0.12
573	0.11
574	0.1
575	0.09
576	0.08
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.06
588	0.07
589	0.12
590	0.17
591	0.19
592	0.24
593	0.25
594	0.33
595	0.37
596	0.37
597	0.34
598	0.29
599	0.29
600	0.24
601	0.23
602	0.16
603	0.14
604	0.19
605	0.2
606	0.2
607	0.2
608	0.23
609	0.23
610	0.23
611	0.29
612	0.33
613	0.34
614	0.4
615	0.47
616	0.5
617	0.54
618	0.52
619	0.45
620	0.36
621	0.33
622	0.27
623	0.17
624	0.12
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.06
629	0.06
630	0.08
631	0.09
632	0.1
633	0.09
634	0.1
635	0.11
636	0.14
637	0.2
638	0.22
639	0.27
640	0.32
641	0.34
642	0.39
643	0.38
644	0.37
645	0.34
646	0.32
647	0.34
648	0.33
649	0.33
650	0.33
651	0.33
652	0.3
653	0.28
654	0.26
655	0.21
656	0.21
657	0.22
658	0.19
659	0.21
660	0.21
661	0.22
662	0.23
663	0.24
664	0.22
665	0.22
666	0.29
667	0.38
668	0.43
669	0.45
670	0.52
671	0.53
672	0.58
673	0.59
674	0.56
675	0.52
676	0.49
677	0.49
678	0.44
679	0.41
680	0.33
681	0.28
682	0.22
683	0.15
684	0.13
685	0.12
686	0.09
687	0.07
688	0.09
689	0.12
690	0.18
691	0.22
692	0.26
693	0.34
694	0.35
695	0.39
696	0.38
697	0.42
698	0.44
699	0.4
700	0.37
701	0.28
702	0.26
703	0.23
704	0.2
705	0.13
706	0.05
707	0.04
708	0.03
709	0.04
710	0.06
711	0.08
712	0.08
713	0.09
714	0.09
715	0.1
716	0.11
717	0.11
718	0.1
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.07
723	0.06
724	0.06
725	0.05
726	0.04
727	0.04
728	0.03
729	0.04
730	0.04
731	0.04
732	0.04
733	0.06
734	0.07
735	0.1
736	0.12
737	0.13
738	0.16
739	0.24
740	0.28
741	0.33
742	0.32
743	0.33
744	0.35
745	0.4
746	0.44
747	0.38
748	0.34
749	0.3
750	0.29
751	0.26
752	0.23
753	0.17
754	0.14
755	0.17
756	0.16
757	0.14
758	0.14
759	0.14
760	0.15
761	0.14
762	0.13
763	0.08
764	0.08
765	0.08
766	0.08
767	0.1
768	0.1
769	0.12
770	0.1
771	0.12
772	0.12
773	0.18
774	0.22
775	0.24
776	0.24
777	0.23
778	0.27
779	0.3
780	0.36
781	0.32
782	0.29
783	0.27
784	0.33
785	0.32
786	0.3
787	0.27
788	0.23
789	0.25
790	0.24
791	0.28
792	0.22
793	0.24
794	0.24
795	0.22
796	0.2
797	0.17
798	0.16
799	0.13
800	0.12
801	0.1
802	0.1
803	0.1
804	0.1
805	0.1
806	0.1
807	0.08
808	0.09
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.11
813	0.18
814	0.23
815	0.28
816	0.35
817	0.41
818	0.46
819	0.49
820	0.5
821	0.49
822	0.47
823	0.43
824	0.44
825	0.41
826	0.36
827	0.33
828	0.28
829	0.24
830	0.22
831	0.22
832	0.17
833	0.16
834	0.15
835	0.19
836	0.19
837	0.18
838	0.2
839	0.18
840	0.18
841	0.16
842	0.17
843	0.12
844	0.13
845	0.11
846	0.08
847	0.08
848	0.08
849	0.08
850	0.1
851	0.12
852	0.12
853	0.14
854	0.16
855	0.2
856	0.18
857	0.19
858	0.17
859	0.15
860	0.19
861	0.16
862	0.15
863	0.13
864	0.12
865	0.11
866	0.11
867	0.12
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.08
872	0.1
873	0.15
874	0.19
875	0.21
876	0.23
877	0.23
878	0.25
879	0.26
880	0.25
881	0.22
882	0.23
883	0.21
884	0.21
885	0.22
886	0.22
887	0.21
888	0.2
889	0.19
890	0.16
891	0.15
892	0.15
893	0.14
894	0.13
895	0.11
896	0.1
897	0.09
898	0.07
899	0.06
900	0.05
901	0.04
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.04
906	0.04
907	0.05
908	0.05
909	0.06
910	0.06
911	0.07
912	0.07
913	0.07
914	0.07
915	0.07
916	0.07
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.05
921	0.06
922	0.06
923	0.06
924	0.06
925	0.07
926	0.07
927	0.06
928	0.07
929	0.07
930	0.08
931	0.08
932	0.09
933	0.09
934	0.09
935	0.09
936	0.08
937	0.08
938	0.07
939	0.08
940	0.07
941	0.07
942	0.07
943	0.07
944	0.08
945	0.08
946	0.09
947	0.12
948	0.13
949	0.16
950	0.18
951	0.22
952	0.26
953	0.27
954	0.29
955	0.26
956	0.26
957	0.25
958	0.23
959	0.23
960	0.19
961	0.17
962	0.15
963	0.14
964	0.15
965	0.13
966	0.12
967	0.08
968	0.08
969	0.09
970	0.09
971	0.11
972	0.15
973	0.21
974	0.22
975	0.26
976	0.33
977	0.34
978	0.42
979	0.49
980	0.49
981	0.5
982	0.57
983	0.6
984	0.56
985	0.61
986	0.6
987	0.59
988	0.57
989	0.53
990	0.47
991	0.42
992	0.43
993	0.38
994	0.37
995	0.37
996	0.4
997	0.43
998	0.42
999	0.41
1000	0.39
1001	0.38
1002	0.33
1003	0.28
1004	0.28
1005	0.24
1006	0.23
1007	0.24
1008	0.24
1009	0.24
1010	0.27
1011	0.24
1012	0.23
1013	0.28
1014	0.34
1015	0.38
1016	0.39
1017	0.38
1018	0.4
1019	0.39
1020	0.36
1021	0.29
1022	0.27
1023	0.28
1024	0.29
1025	0.36
1026	0.38
1027	0.48
1028	0.55
1029	0.63
1030	0.67
1031	0.72
1032	0.79
1033	0.81
1034	0.84
1035	0.8
1036	0.78
1037	0.75
1038	0.68
1039	0.63
1040	0.55
1041	0.47
1042	0.39
1043	0.36
1044	0.3
1045	0.26
1046	0.25
1047	0.2
1048	0.17
1049	0.16
1050	0.14
1051	0.11
1052	0.11
1053	0.09
1054	0.07
1055	0.09
1056	0.11
1057	0.12
1058	0.12
1059	0.14
1060	0.15
1061	0.18
1062	0.21
1063	0.25
1064	0.31
1065	0.4
1066	0.48
1067	0.5
1068	0.58
1069	0.66
1070	0.74
1071	0.78
1072	0.8
1073	0.81
1074	0.81
1075	0.86
1076	0.83
1077	0.81
1078	0.78

A0A6H0Y1A6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer