Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XSM4

Protein Details
Accession A0A6H0XSM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-348SSNHNKRKAKHEAQNTPTSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-243KKKLPKQIKIR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.833, cyto 9, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MASGNVVSFPPYAILSSHRGPVPHDMIELAQHHDHFQVSLRDGISGRIEDTSRRIPYSSDKRDFLARTGRDAFEVYEYEFRLPEDRSKAHQVMWDYENGLVRITPFFKACHYSKTTPKKALEANGVLQSELSHSVTGGAVGAQGYWTPYACARALCITFCYPIRWALTPIFGPSFVQECLLPNDPGFGKFKIDSQLIEDAQAEAEEWRRAAVSYKTHASSTPQHTAQRRATDKKKLPKQIKIRKTTSRSTVESQVYGYGPDSPPVSPKTVPHKSQYNGRTDAWIPINRADDSAASDMSGTSPHSGTITPLSLPGPIIPPALLTDGLPQSSNHNKRKAKHEAQNTPTSFPAAVILEDDQGDSDDGDDRAIGDYIVRSPASVLSIPPPKRTKQNEHGSGHEDQHSAHKDVVAEAGLTKLNQAEMSAVSGLLKLVGNDRKCTLHLEHI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.21
4 0.26
5 0.26
6 0.27
7 0.29
8 0.36
9 0.37
10 0.33
11 0.31
12 0.27
13 0.25
14 0.3
15 0.29
16 0.25
17 0.22
18 0.21
19 0.22
20 0.22
21 0.22
22 0.18
23 0.21
24 0.22
25 0.21
26 0.25
27 0.24
28 0.25
29 0.25
30 0.26
31 0.25
32 0.2
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.18
37 0.24
38 0.29
39 0.29
40 0.3
41 0.3
42 0.29
43 0.39
44 0.48
45 0.53
46 0.51
47 0.5
48 0.5
49 0.57
50 0.56
51 0.52
52 0.5
53 0.41
54 0.41
55 0.44
56 0.43
57 0.37
58 0.36
59 0.31
60 0.24
61 0.24
62 0.2
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.23
71 0.26
72 0.28
73 0.33
74 0.41
75 0.42
76 0.41
77 0.43
78 0.39
79 0.37
80 0.36
81 0.33
82 0.25
83 0.26
84 0.26
85 0.22
86 0.19
87 0.14
88 0.13
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.16
95 0.23
96 0.23
97 0.28
98 0.34
99 0.38
100 0.46
101 0.56
102 0.62
103 0.63
104 0.64
105 0.62
106 0.59
107 0.59
108 0.56
109 0.48
110 0.43
111 0.4
112 0.38
113 0.32
114 0.27
115 0.22
116 0.16
117 0.15
118 0.13
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.07
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.17
148 0.15
149 0.17
150 0.19
151 0.17
152 0.19
153 0.18
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.1
166 0.13
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.15
171 0.15
172 0.16
173 0.17
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.16
178 0.18
179 0.18
180 0.16
181 0.17
182 0.2
183 0.18
184 0.19
185 0.17
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.09
190 0.05
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.09
198 0.12
199 0.14
200 0.17
201 0.2
202 0.2
203 0.21
204 0.21
205 0.22
206 0.25
207 0.27
208 0.29
209 0.29
210 0.33
211 0.36
212 0.42
213 0.42
214 0.43
215 0.43
216 0.46
217 0.5
218 0.55
219 0.6
220 0.64
221 0.68
222 0.7
223 0.71
224 0.72
225 0.77
226 0.78
227 0.79
228 0.78
229 0.77
230 0.76
231 0.75
232 0.71
233 0.68
234 0.63
235 0.57
236 0.52
237 0.52
238 0.45
239 0.39
240 0.34
241 0.28
242 0.22
243 0.19
244 0.15
245 0.12
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.1
250 0.13
251 0.15
252 0.18
253 0.15
254 0.2
255 0.29
256 0.35
257 0.38
258 0.4
259 0.45
260 0.44
261 0.52
262 0.53
263 0.5
264 0.47
265 0.44
266 0.43
267 0.36
268 0.39
269 0.36
270 0.33
271 0.28
272 0.27
273 0.29
274 0.26
275 0.26
276 0.21
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.12
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.17
316 0.27
317 0.37
318 0.4
319 0.48
320 0.54
321 0.59
322 0.68
323 0.73
324 0.72
325 0.72
326 0.75
327 0.76
328 0.77
329 0.81
330 0.73
331 0.65
332 0.55
333 0.48
334 0.37
335 0.27
336 0.23
337 0.14
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.11
364 0.12
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.18
369 0.28
370 0.3
371 0.37
372 0.42
373 0.43
374 0.52
375 0.6
376 0.64
377 0.65
378 0.74
379 0.76
380 0.74
381 0.75
382 0.7
383 0.64
384 0.58
385 0.52
386 0.41
387 0.32
388 0.37
389 0.37
390 0.34
391 0.31
392 0.29
393 0.26
394 0.26
395 0.27
396 0.19
397 0.14
398 0.12
399 0.13
400 0.12
401 0.11
402 0.12
403 0.1
404 0.11
405 0.1
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.13
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.08
418 0.16
419 0.23
420 0.26
421 0.29
422 0.32
423 0.34
424 0.34
425 0.4