Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XRS3

Protein Details
Accession A0A6H0XRS3    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-127DEDDGKGKKRKRSYKARDPNAPKRPLTBasic
302-323GDDATPKKKRGRPSNADKLLREBasic
337-360SSSEEEQPKKEKKEKPKKKKTAEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-124KGKKRKRSYKARDPNAPKR
243-246KVKK
295-315KKRKAAAGDDATPKKKRGRPS
344-358PKKEKKEKPKKKKTA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.833, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAPEKKRVTVDVDEFVRTRDALTTAFLSLSSSVDKAVKAYIEHTNAVLAGDASLNVSYLTQPFNVLGAAAGVVHQTGEALAKSTAKAVEPPAADAATGGADEDDGKGKKRKRSYKARDPNAPKRPLTAYFRYLSEMRPLLTIELAKNIGTHKPGELSQVATERWRKLSEDEKKPYHDAYKAAKDVYDQDVQDYKARTGQLVADDDDEEDDIAVAPAVIIAHEDENDSDDEASSDESPPPPPPKVKKSSSPEAVKKTPKAAAATAAVDKTPKTTSKKATATPMFNSINPAPAGTDKKRKAAAGDDATPKKKRGRPSNADKLLREQAAAAAAAKDNDDSSSEEEQPKKEKKEKPKKKKTAEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.39
3 0.35
4 0.27
5 0.23
6 0.18
7 0.17
8 0.14
9 0.17
10 0.17
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.14
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.17
27 0.23
28 0.25
29 0.25
30 0.24
31 0.23
32 0.21
33 0.2
34 0.17
35 0.1
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.03
63 0.04
64 0.05
65 0.05
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.12
72 0.11
73 0.13
74 0.14
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.15
82 0.13
83 0.07
84 0.07
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.09
91 0.1
92 0.14
93 0.21
94 0.27
95 0.35
96 0.44
97 0.54
98 0.59
99 0.7
100 0.77
101 0.82
102 0.87
103 0.88
104 0.88
105 0.88
106 0.88
107 0.87
108 0.82
109 0.71
110 0.64
111 0.59
112 0.55
113 0.52
114 0.46
115 0.41
116 0.37
117 0.37
118 0.37
119 0.34
120 0.29
121 0.27
122 0.22
123 0.18
124 0.17
125 0.17
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.09
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.17
148 0.2
149 0.19
150 0.2
151 0.2
152 0.2
153 0.21
154 0.3
155 0.36
156 0.43
157 0.48
158 0.49
159 0.51
160 0.51
161 0.5
162 0.43
163 0.36
164 0.31
165 0.3
166 0.32
167 0.31
168 0.29
169 0.27
170 0.25
171 0.25
172 0.24
173 0.22
174 0.16
175 0.16
176 0.18
177 0.19
178 0.22
179 0.2
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.07
195 0.05
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.02
202 0.03
203 0.03
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.15
225 0.19
226 0.21
227 0.28
228 0.34
229 0.42
230 0.49
231 0.53
232 0.59
233 0.63
234 0.68
235 0.7
236 0.71
237 0.7
238 0.69
239 0.72
240 0.69
241 0.64
242 0.59
243 0.53
244 0.48
245 0.43
246 0.36
247 0.32
248 0.27
249 0.27
250 0.25
251 0.21
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.16
257 0.2
258 0.25
259 0.32
260 0.39
261 0.48
262 0.53
263 0.55
264 0.61
265 0.62
266 0.59
267 0.54
268 0.55
269 0.48
270 0.42
271 0.44
272 0.35
273 0.32
274 0.27
275 0.25
276 0.18
277 0.21
278 0.28
279 0.29
280 0.39
281 0.38
282 0.44
283 0.47
284 0.47
285 0.46
286 0.45
287 0.48
288 0.45
289 0.48
290 0.51
291 0.55
292 0.59
293 0.59
294 0.57
295 0.57
296 0.56
297 0.59
298 0.61
299 0.66
300 0.7
301 0.78
302 0.85
303 0.85
304 0.87
305 0.78
306 0.74
307 0.7
308 0.6
309 0.5
310 0.39
311 0.3
312 0.26
313 0.24
314 0.18
315 0.12
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.17
325 0.21
326 0.25
327 0.32
328 0.35
329 0.39
330 0.46
331 0.52
332 0.56
333 0.61
334 0.66
335 0.71
336 0.79
337 0.86
338 0.88
339 0.91
340 0.93