Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0Y630

Protein Details
Accession A0A6H0Y630    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-368LEVAAKRRRRQNVQKLQRATEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MASSVPRASMDSTRTPVTPRGQHTGYPFPSQESPYRQPSYIRPVKRRGSAASFQSVSSIGGSLDIQGRRNTTLREAGENAISTLLQAPIVRTGLLPHTPASAAAATGYRAPTTRDIPPVTLTNIPQVPAENFQHYLDTIGPLVETFERGRLEEQEQQAKKEKELDQTDRFTQALDGKLARDGPASPTLSRRASATVLSPPETPGSPQLRRKGSSQYRRNRNEPTPLSTIPVVYFDDDFHLEDPRTFDIVSERAEIIRQTPGNRSENGSTEAPRKNLASNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASSGFFAALGSLKELQTEAEESVAKIQSLREDLRRLDKEVAVGGLEVAAKRRRRQNVQKLQRATEQVGQIVEAVKRTDQLVDDGKYDEAADEMDIVGRLVRGEASTSHDGSPAIDLSSLKALQGLQAGAQELQYRIGAGFAHRFTTILMTDLRQHVDRVPSSETLKRWSRQRGIPPTYMETTDDFRSDLLANLSGLARCGHTAPAVAGYREAAMREMKNIIRRYLPSSSDDDADSMVSTSTRGGKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.37
3 0.4
4 0.43
5 0.46
6 0.45
7 0.49
8 0.49
9 0.52
10 0.55
11 0.58
12 0.53
13 0.52
14 0.47
15 0.43
16 0.45
17 0.45
18 0.46
19 0.44
20 0.47
21 0.5
22 0.53
23 0.5
24 0.51
25 0.54
26 0.57
27 0.58
28 0.61
29 0.61
30 0.67
31 0.73
32 0.76
33 0.74
34 0.7
35 0.69
36 0.67
37 0.63
38 0.62
39 0.54
40 0.47
41 0.43
42 0.37
43 0.29
44 0.22
45 0.17
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.15
51 0.17
52 0.19
53 0.21
54 0.23
55 0.26
56 0.29
57 0.29
58 0.28
59 0.34
60 0.34
61 0.36
62 0.37
63 0.35
64 0.34
65 0.32
66 0.27
67 0.2
68 0.18
69 0.13
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.12
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.13
80 0.16
81 0.18
82 0.18
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.13
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.11
94 0.12
95 0.1
96 0.11
97 0.14
98 0.17
99 0.2
100 0.24
101 0.28
102 0.29
103 0.3
104 0.33
105 0.32
106 0.31
107 0.31
108 0.27
109 0.27
110 0.26
111 0.25
112 0.22
113 0.21
114 0.2
115 0.22
116 0.24
117 0.21
118 0.22
119 0.21
120 0.22
121 0.2
122 0.2
123 0.15
124 0.13
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.09
130 0.07
131 0.09
132 0.08
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.15
137 0.17
138 0.21
139 0.25
140 0.29
141 0.36
142 0.36
143 0.39
144 0.47
145 0.44
146 0.41
147 0.43
148 0.43
149 0.42
150 0.48
151 0.52
152 0.49
153 0.52
154 0.53
155 0.47
156 0.42
157 0.34
158 0.28
159 0.24
160 0.2
161 0.19
162 0.17
163 0.16
164 0.17
165 0.18
166 0.16
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.18
171 0.19
172 0.18
173 0.21
174 0.25
175 0.26
176 0.25
177 0.23
178 0.2
179 0.19
180 0.19
181 0.18
182 0.18
183 0.19
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.19
188 0.18
189 0.16
190 0.19
191 0.24
192 0.28
193 0.34
194 0.41
195 0.44
196 0.46
197 0.47
198 0.51
199 0.54
200 0.59
201 0.63
202 0.65
203 0.71
204 0.76
205 0.79
206 0.76
207 0.7
208 0.69
209 0.63
210 0.59
211 0.54
212 0.48
213 0.44
214 0.37
215 0.33
216 0.23
217 0.21
218 0.15
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.1
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.17
247 0.22
248 0.24
249 0.25
250 0.26
251 0.24
252 0.25
253 0.27
254 0.24
255 0.2
256 0.24
257 0.25
258 0.24
259 0.23
260 0.22
261 0.19
262 0.2
263 0.21
264 0.16
265 0.16
266 0.18
267 0.18
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.13
272 0.13
273 0.11
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.14
319 0.16
320 0.17
321 0.2
322 0.22
323 0.3
324 0.32
325 0.33
326 0.32
327 0.3
328 0.27
329 0.25
330 0.23
331 0.14
332 0.12
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.09
338 0.14
339 0.18
340 0.23
341 0.31
342 0.38
343 0.48
344 0.59
345 0.67
346 0.72
347 0.8
348 0.84
349 0.8
350 0.76
351 0.71
352 0.63
353 0.55
354 0.49
355 0.39
356 0.32
357 0.27
358 0.23
359 0.19
360 0.18
361 0.15
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.1
369 0.13
370 0.18
371 0.18
372 0.19
373 0.2
374 0.19
375 0.18
376 0.17
377 0.13
378 0.08
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.13
395 0.17
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.19
400 0.18
401 0.19
402 0.13
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.13
408 0.13
409 0.11
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.13
414 0.12
415 0.09
416 0.1
417 0.11
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.1
427 0.09
428 0.1
429 0.15
430 0.14
431 0.16
432 0.16
433 0.16
434 0.15
435 0.18
436 0.16
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.17
441 0.2
442 0.22
443 0.2
444 0.21
445 0.23
446 0.28
447 0.29
448 0.28
449 0.29
450 0.3
451 0.33
452 0.38
453 0.36
454 0.36
455 0.42
456 0.44
457 0.49
458 0.55
459 0.59
460 0.62
461 0.71
462 0.74
463 0.74
464 0.74
465 0.7
466 0.66
467 0.61
468 0.54
469 0.45
470 0.37
471 0.34
472 0.3
473 0.26
474 0.21
475 0.18
476 0.19
477 0.17
478 0.17
479 0.15
480 0.14
481 0.13
482 0.14
483 0.16
484 0.14
485 0.14
486 0.13
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.19
495 0.2
496 0.2
497 0.19
498 0.18
499 0.19
500 0.19
501 0.19
502 0.14
503 0.17
504 0.18
505 0.2
506 0.25
507 0.28
508 0.35
509 0.39
510 0.4
511 0.41
512 0.43
513 0.47
514 0.48
515 0.47
516 0.43
517 0.45
518 0.44
519 0.39
520 0.37
521 0.31
522 0.25
523 0.22
524 0.18
525 0.13
526 0.11
527 0.09
528 0.08
529 0.1