Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PDS5

Protein Details
Accession F4PDS5    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-291EAAAKKKNPARKTQNQRSRRARHIEYKRRLKMQHydrophilic
386-408EAYVPVTKKRRYQPKFTESHDYKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-104AKRKKG
262-288AKKKNPARKTQNQRSRRARHIEYKRRL
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MEQDLDDIRAQERLGGRVTEMPSESLFFTDTKGDQNIRKELRLKPLYMDQLLKSDSAIPGLLSRRFIKKTTKVVDPDGQLTTKSCVVSKSAAKKIETLAKRKKGLGLSIGSDAEKKEAERRKQQDMVQRAKGGFDLWGSDAVQSNAVKDKYLARTLPPYIAKYTTSDYRPKLIPAVRISHPGTSYNPKGDDHQAAILIAADIEFKKIAQEEEAEKQLSYPKELDLLDDNDYFDDTDDEEDSQAEDSAAEGETAETLQDEAAAKKKNPARKTQNQRSRRARHIEYKRRLKMQHERNEFFEQINGVDAINESMEKQAEAMQLNQAKRQALRETLKETKPARVGKYSFQAAPFEIQLKDELSGSLRTLKPEGNIFRDRFKSLQERNIIEAYVPVTKKRRYQPKFTESHDYKRFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.23
4 0.27
5 0.29
6 0.28
7 0.27
8 0.26
9 0.23
10 0.24
11 0.23
12 0.17
13 0.17
14 0.13
15 0.14
16 0.16
17 0.16
18 0.19
19 0.23
20 0.27
21 0.31
22 0.37
23 0.46
24 0.46
25 0.51
26 0.53
27 0.54
28 0.6
29 0.6
30 0.55
31 0.5
32 0.54
33 0.54
34 0.52
35 0.5
36 0.4
37 0.39
38 0.39
39 0.34
40 0.27
41 0.23
42 0.2
43 0.17
44 0.16
45 0.11
46 0.15
47 0.19
48 0.21
49 0.21
50 0.25
51 0.31
52 0.34
53 0.38
54 0.43
55 0.48
56 0.56
57 0.57
58 0.62
59 0.59
60 0.62
61 0.65
62 0.58
63 0.52
64 0.45
65 0.4
66 0.32
67 0.29
68 0.26
69 0.22
70 0.2
71 0.18
72 0.16
73 0.18
74 0.23
75 0.29
76 0.35
77 0.39
78 0.43
79 0.43
80 0.44
81 0.46
82 0.5
83 0.49
84 0.5
85 0.53
86 0.57
87 0.59
88 0.59
89 0.6
90 0.54
91 0.51
92 0.47
93 0.4
94 0.34
95 0.33
96 0.32
97 0.27
98 0.24
99 0.21
100 0.16
101 0.14
102 0.13
103 0.19
104 0.27
105 0.34
106 0.43
107 0.48
108 0.55
109 0.6
110 0.64
111 0.64
112 0.65
113 0.65
114 0.6
115 0.58
116 0.51
117 0.45
118 0.4
119 0.31
120 0.23
121 0.15
122 0.12
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.1
129 0.13
130 0.11
131 0.12
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.2
137 0.21
138 0.25
139 0.25
140 0.22
141 0.26
142 0.28
143 0.32
144 0.29
145 0.27
146 0.25
147 0.26
148 0.25
149 0.22
150 0.24
151 0.23
152 0.25
153 0.29
154 0.28
155 0.31
156 0.31
157 0.29
158 0.32
159 0.3
160 0.32
161 0.29
162 0.33
163 0.3
164 0.35
165 0.35
166 0.31
167 0.29
168 0.25
169 0.25
170 0.25
171 0.26
172 0.23
173 0.24
174 0.22
175 0.24
176 0.26
177 0.25
178 0.2
179 0.18
180 0.16
181 0.14
182 0.13
183 0.11
184 0.07
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.08
197 0.1
198 0.13
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.18
204 0.17
205 0.16
206 0.14
207 0.12
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.14
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.09
220 0.07
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.11
248 0.15
249 0.15
250 0.22
251 0.27
252 0.33
253 0.37
254 0.47
255 0.52
256 0.6
257 0.71
258 0.75
259 0.81
260 0.82
261 0.88
262 0.88
263 0.86
264 0.84
265 0.81
266 0.77
267 0.77
268 0.8
269 0.8
270 0.8
271 0.83
272 0.81
273 0.8
274 0.76
275 0.75
276 0.74
277 0.74
278 0.73
279 0.72
280 0.68
281 0.66
282 0.68
283 0.6
284 0.5
285 0.41
286 0.31
287 0.22
288 0.2
289 0.15
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.1
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.2
306 0.25
307 0.26
308 0.29
309 0.28
310 0.28
311 0.28
312 0.32
313 0.3
314 0.33
315 0.38
316 0.4
317 0.45
318 0.51
319 0.52
320 0.55
321 0.53
322 0.51
323 0.53
324 0.55
325 0.52
326 0.52
327 0.52
328 0.5
329 0.56
330 0.53
331 0.48
332 0.43
333 0.41
334 0.33
335 0.33
336 0.29
337 0.24
338 0.2
339 0.19
340 0.18
341 0.17
342 0.17
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.14
348 0.21
349 0.21
350 0.23
351 0.25
352 0.26
353 0.27
354 0.34
355 0.39
356 0.38
357 0.45
358 0.45
359 0.5
360 0.52
361 0.53
362 0.46
363 0.48
364 0.51
365 0.5
366 0.56
367 0.56
368 0.55
369 0.55
370 0.56
371 0.48
372 0.38
373 0.33
374 0.27
375 0.26
376 0.24
377 0.27
378 0.32
379 0.38
380 0.46
381 0.55
382 0.63
383 0.63
384 0.73
385 0.78
386 0.81
387 0.83
388 0.8
389 0.81
390 0.76
391 0.79