Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PDM1

Protein Details
Accession F4PDM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
524-545IEPRHREPTMTNKERRNKRELQBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 9, mito 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
Amino Acid Sequences MVFTHTNLYDLLSDYNNLDVKPGVEATKKLGNFFQSLNLDIHKNGIFVPRLTLKYLWHTKSKDCKFQLFKGNDELYHKYKDNLVGGPKCDIAVPEHLKEYFAGMPLIFKDVEITCNDLSFDTQAHAKPDYKSNRLVESMFGETMMFATKLLKWYLEHGLVVSNITFAVRYERKAHFKSFDQQVSNERRAGDTSPDYKLRGEMMKLMEKSSYGKCITDFLKHETVKIVGPNNYNKNVRRVKDYIGHQDLVDGFEFRFKKTAFKQSLPYRLASKSDFQYCMMDTDSAYFAISGSSLQDVVKPHLLDEFKQKRQVWLERDDTLENKLYDSRTPGLFKLEYEGDCIISLASKMYYYDEKKFSSKGINKRQNEITKYKYLSALNGNANQGFRNSGFRANNNQMNTYSPTKTGMKLFNDKRLRVMDKLYKLYYSPKTGFISARKLYLKLDKQLPISQTIKFLDQQEVHQLHQESQRKPALSPITSWRSCSDTQSGNGYSFSISDDNGNVLGKSYKYYELKRVEVTETFLIEPRHREPTMTNKERRNKRELQELARVQGPTNKKTKKFGATYFLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.2
4 0.18
5 0.18
6 0.16
7 0.15
8 0.17
9 0.18
10 0.18
11 0.19
12 0.21
13 0.25
14 0.32
15 0.32
16 0.32
17 0.33
18 0.33
19 0.32
20 0.32
21 0.35
22 0.29
23 0.31
24 0.31
25 0.3
26 0.28
27 0.25
28 0.28
29 0.21
30 0.19
31 0.18
32 0.23
33 0.23
34 0.21
35 0.27
36 0.29
37 0.31
38 0.33
39 0.33
40 0.3
41 0.37
42 0.46
43 0.45
44 0.47
45 0.49
46 0.55
47 0.64
48 0.69
49 0.69
50 0.65
51 0.71
52 0.69
53 0.74
54 0.75
55 0.67
56 0.63
57 0.61
58 0.59
59 0.51
60 0.5
61 0.48
62 0.42
63 0.44
64 0.41
65 0.34
66 0.35
67 0.38
68 0.36
69 0.36
70 0.4
71 0.39
72 0.4
73 0.4
74 0.36
75 0.32
76 0.28
77 0.24
78 0.18
79 0.23
80 0.26
81 0.26
82 0.28
83 0.28
84 0.28
85 0.27
86 0.28
87 0.2
88 0.16
89 0.15
90 0.12
91 0.14
92 0.14
93 0.16
94 0.12
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.14
99 0.14
100 0.17
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.09
109 0.13
110 0.14
111 0.16
112 0.19
113 0.21
114 0.23
115 0.32
116 0.38
117 0.39
118 0.44
119 0.45
120 0.46
121 0.45
122 0.43
123 0.35
124 0.31
125 0.3
126 0.23
127 0.19
128 0.15
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.08
133 0.05
134 0.07
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.16
141 0.21
142 0.2
143 0.19
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.12
149 0.08
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.13
155 0.14
156 0.17
157 0.23
158 0.29
159 0.37
160 0.4
161 0.45
162 0.41
163 0.44
164 0.49
165 0.51
166 0.52
167 0.46
168 0.44
169 0.48
170 0.51
171 0.5
172 0.44
173 0.36
174 0.3
175 0.3
176 0.3
177 0.26
178 0.24
179 0.24
180 0.26
181 0.27
182 0.27
183 0.26
184 0.25
185 0.23
186 0.21
187 0.18
188 0.19
189 0.21
190 0.26
191 0.26
192 0.26
193 0.23
194 0.21
195 0.24
196 0.21
197 0.22
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.21
202 0.22
203 0.24
204 0.25
205 0.25
206 0.32
207 0.32
208 0.32
209 0.3
210 0.29
211 0.25
212 0.26
213 0.24
214 0.2
215 0.24
216 0.3
217 0.33
218 0.37
219 0.41
220 0.39
221 0.45
222 0.48
223 0.46
224 0.46
225 0.44
226 0.43
227 0.45
228 0.48
229 0.48
230 0.45
231 0.43
232 0.36
233 0.35
234 0.31
235 0.25
236 0.2
237 0.12
238 0.08
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.16
243 0.15
244 0.21
245 0.25
246 0.36
247 0.35
248 0.38
249 0.45
250 0.48
251 0.57
252 0.52
253 0.49
254 0.42
255 0.38
256 0.38
257 0.31
258 0.28
259 0.23
260 0.25
261 0.24
262 0.22
263 0.22
264 0.2
265 0.19
266 0.16
267 0.13
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.16
289 0.16
290 0.15
291 0.25
292 0.31
293 0.31
294 0.39
295 0.39
296 0.4
297 0.46
298 0.52
299 0.46
300 0.44
301 0.45
302 0.39
303 0.41
304 0.38
305 0.32
306 0.27
307 0.26
308 0.19
309 0.16
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.18
314 0.18
315 0.17
316 0.18
317 0.18
318 0.2
319 0.19
320 0.18
321 0.18
322 0.19
323 0.16
324 0.17
325 0.17
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.09
330 0.07
331 0.07
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.07
337 0.13
338 0.16
339 0.22
340 0.25
341 0.27
342 0.29
343 0.3
344 0.3
345 0.34
346 0.38
347 0.43
348 0.51
349 0.58
350 0.59
351 0.64
352 0.7
353 0.67
354 0.65
355 0.61
356 0.56
357 0.53
358 0.52
359 0.48
360 0.45
361 0.38
362 0.35
363 0.33
364 0.33
365 0.3
366 0.31
367 0.3
368 0.27
369 0.27
370 0.24
371 0.2
372 0.16
373 0.14
374 0.16
375 0.16
376 0.22
377 0.24
378 0.27
379 0.35
380 0.39
381 0.43
382 0.39
383 0.4
384 0.33
385 0.34
386 0.35
387 0.32
388 0.27
389 0.23
390 0.25
391 0.25
392 0.27
393 0.29
394 0.31
395 0.32
396 0.41
397 0.44
398 0.5
399 0.55
400 0.54
401 0.53
402 0.53
403 0.52
404 0.44
405 0.48
406 0.46
407 0.46
408 0.51
409 0.47
410 0.41
411 0.38
412 0.44
413 0.41
414 0.4
415 0.35
416 0.35
417 0.36
418 0.38
419 0.42
420 0.39
421 0.43
422 0.37
423 0.41
424 0.38
425 0.36
426 0.37
427 0.42
428 0.43
429 0.41
430 0.47
431 0.45
432 0.47
433 0.51
434 0.49
435 0.46
436 0.43
437 0.37
438 0.35
439 0.32
440 0.3
441 0.29
442 0.29
443 0.29
444 0.28
445 0.29
446 0.34
447 0.34
448 0.32
449 0.34
450 0.33
451 0.31
452 0.39
453 0.45
454 0.37
455 0.42
456 0.47
457 0.43
458 0.42
459 0.46
460 0.45
461 0.38
462 0.4
463 0.41
464 0.45
465 0.45
466 0.47
467 0.41
468 0.38
469 0.38
470 0.39
471 0.36
472 0.31
473 0.33
474 0.37
475 0.37
476 0.33
477 0.32
478 0.28
479 0.22
480 0.18
481 0.18
482 0.12
483 0.11
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.13
488 0.14
489 0.11
490 0.12
491 0.14
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.23
496 0.28
497 0.33
498 0.41
499 0.45
500 0.49
501 0.51
502 0.51
503 0.48
504 0.43
505 0.43
506 0.37
507 0.32
508 0.29
509 0.29
510 0.29
511 0.27
512 0.31
513 0.3
514 0.35
515 0.33
516 0.34
517 0.35
518 0.43
519 0.51
520 0.56
521 0.6
522 0.63
523 0.73
524 0.81
525 0.84
526 0.81
527 0.8
528 0.76
529 0.79
530 0.78
531 0.75
532 0.75
533 0.72
534 0.66
535 0.61
536 0.56
537 0.46
538 0.45
539 0.44
540 0.41
541 0.48
542 0.53
543 0.54
544 0.61
545 0.69
546 0.71
547 0.72
548 0.72