Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XPH8

Protein Details
Accession A0A6H0XPH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-344LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-335KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 13.5, nucl 13, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAGDTQSQPLPTSVWPSKVIPPPPTVFAITQILGFFEDLGYDKTVKALRKEATGKGLQLDSAEVKALQGPFKKSLGELYADALLQEEDDEESSDESDSGEEEGSNDDSESSEEESSDSSSESEAEEGTTAMAQVAALKRKRDDSSDSSSSESESDSDSDDDEAPPAKKNKTISGAEDTSEDSSDDEATSVSSSEVSSDSESSSESESDSDSSSDGEEVSTAPVVVKKSGTTKSKVSDDDSEASSATLVAEPAKADDNGGMHPARASRMTPGINTPLDKSKKNNVPFSRIPKDTFVDPRFASNAYVFYDYADRAHQDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDTTPKGIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.33
4 0.4
5 0.46
6 0.51
7 0.47
8 0.49
9 0.48
10 0.48
11 0.48
12 0.43
13 0.35
14 0.33
15 0.32
16 0.26
17 0.24
18 0.21
19 0.18
20 0.16
21 0.15
22 0.11
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.15
31 0.2
32 0.23
33 0.26
34 0.32
35 0.32
36 0.4
37 0.44
38 0.44
39 0.47
40 0.46
41 0.43
42 0.39
43 0.37
44 0.29
45 0.24
46 0.23
47 0.17
48 0.14
49 0.14
50 0.1
51 0.1
52 0.13
53 0.14
54 0.17
55 0.2
56 0.24
57 0.27
58 0.28
59 0.28
60 0.25
61 0.27
62 0.25
63 0.23
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.17
68 0.16
69 0.13
70 0.1
71 0.07
72 0.07
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.06
121 0.09
122 0.15
123 0.17
124 0.19
125 0.2
126 0.25
127 0.27
128 0.28
129 0.32
130 0.32
131 0.37
132 0.4
133 0.39
134 0.36
135 0.35
136 0.32
137 0.25
138 0.2
139 0.12
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.1
150 0.09
151 0.13
152 0.16
153 0.15
154 0.18
155 0.2
156 0.23
157 0.27
158 0.29
159 0.28
160 0.31
161 0.31
162 0.28
163 0.27
164 0.23
165 0.18
166 0.16
167 0.13
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.15
215 0.22
216 0.25
217 0.27
218 0.3
219 0.34
220 0.38
221 0.39
222 0.38
223 0.36
224 0.36
225 0.35
226 0.32
227 0.28
228 0.23
229 0.21
230 0.17
231 0.12
232 0.09
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.13
246 0.12
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.14
254 0.19
255 0.2
256 0.2
257 0.23
258 0.26
259 0.27
260 0.27
261 0.27
262 0.31
263 0.34
264 0.36
265 0.38
266 0.43
267 0.5
268 0.56
269 0.63
270 0.59
271 0.63
272 0.68
273 0.72
274 0.7
275 0.65
276 0.61
277 0.55
278 0.53
279 0.51
280 0.52
281 0.45
282 0.43
283 0.4
284 0.4
285 0.37
286 0.35
287 0.31
288 0.23
289 0.23
290 0.2
291 0.21
292 0.18
293 0.18
294 0.19
295 0.18
296 0.18
297 0.18
298 0.16
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.14
303 0.18
304 0.22
305 0.26
306 0.25
307 0.24
308 0.29
309 0.31
310 0.37
311 0.38
312 0.43
313 0.48
314 0.58
315 0.68
316 0.74
317 0.81
318 0.83
319 0.89
320 0.91
321 0.9
322 0.9
323 0.87
324 0.86
325 0.85
326 0.79
327 0.69
328 0.6
329 0.57
330 0.48
331 0.44
332 0.36
333 0.28