Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PDV3

Protein Details
Accession F4PDV3    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-67IPQLAIKQTKSKKSKKNSKTKENIASAAHydrophilic
383-417KRVMGRVSKKIKTKSVRSKAPVNKSKSKPKASAAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-57KSKKSKKNS
383-417KRVMGRVSKKIKTKSVRSKAPVNKSKSKPKASAAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034221  RBM34_RRM2  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
cd12395  RRM2_RBM34  
Amino Acid Sequences MGKQSKLTKKDSKAEAAGNDLVEKPLVTGDPLAVTSTQNIPQLAIKQTKSKKSKKNSKTKENIASAATSILGAVGKLDPKIASLFSTSAPVNPVSMMFAPQNSCIQPVIKSIEPVVTAATSIETKSEINTENSSKSTEIDVADGSDAEDATKAKEQSLSRREKLKELIARQSRTIFVGNLPICVTEKAALQQLKTLFSQFGTIECIRFRSIAFNSKLPRKLAYSAKQFHDKRDSLNAYIVYELPESVSKALELHGTLFLEKHLRVDRSETTQQKKYDHKKSIFIGNLLFDISEEALWSFFSDCGDITNVRVIRDRNTNVGKGFGYVQFAERSSVSLALKLNDTDLQGRQVRISRSNPTLAESGNSTTKSTAEGLRASKSDNIKRVMGRVSKKIKTKSVRSKAPVNKSKSKPKASAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.61
3 0.57
4 0.5
5 0.42
6 0.36
7 0.29
8 0.24
9 0.19
10 0.17
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.16
24 0.19
25 0.21
26 0.2
27 0.2
28 0.23
29 0.27
30 0.31
31 0.34
32 0.33
33 0.4
34 0.48
35 0.57
36 0.64
37 0.69
38 0.73
39 0.77
40 0.86
41 0.87
42 0.91
43 0.91
44 0.92
45 0.92
46 0.92
47 0.91
48 0.84
49 0.77
50 0.67
51 0.57
52 0.46
53 0.37
54 0.27
55 0.17
56 0.11
57 0.09
58 0.07
59 0.05
60 0.06
61 0.07
62 0.08
63 0.09
64 0.1
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.16
77 0.15
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.11
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.18
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.18
95 0.21
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.19
101 0.18
102 0.15
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.11
114 0.12
115 0.14
116 0.18
117 0.2
118 0.21
119 0.21
120 0.22
121 0.2
122 0.18
123 0.17
124 0.16
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.07
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.17
142 0.18
143 0.27
144 0.37
145 0.43
146 0.43
147 0.51
148 0.52
149 0.51
150 0.53
151 0.51
152 0.48
153 0.45
154 0.51
155 0.5
156 0.5
157 0.47
158 0.45
159 0.38
160 0.32
161 0.29
162 0.2
163 0.14
164 0.2
165 0.18
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.12
184 0.12
185 0.14
186 0.1
187 0.1
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.14
193 0.12
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.14
198 0.22
199 0.24
200 0.27
201 0.3
202 0.35
203 0.39
204 0.35
205 0.35
206 0.29
207 0.32
208 0.36
209 0.4
210 0.43
211 0.44
212 0.46
213 0.54
214 0.52
215 0.52
216 0.53
217 0.46
218 0.39
219 0.43
220 0.43
221 0.35
222 0.37
223 0.32
224 0.24
225 0.24
226 0.22
227 0.14
228 0.11
229 0.1
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.11
247 0.1
248 0.13
249 0.16
250 0.17
251 0.18
252 0.22
253 0.24
254 0.29
255 0.37
256 0.4
257 0.42
258 0.48
259 0.5
260 0.51
261 0.58
262 0.61
263 0.63
264 0.65
265 0.63
266 0.63
267 0.63
268 0.65
269 0.58
270 0.5
271 0.41
272 0.32
273 0.29
274 0.23
275 0.19
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.06
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.21
298 0.21
299 0.24
300 0.32
301 0.33
302 0.36
303 0.39
304 0.41
305 0.38
306 0.39
307 0.35
308 0.28
309 0.28
310 0.21
311 0.2
312 0.17
313 0.19
314 0.18
315 0.18
316 0.18
317 0.16
318 0.16
319 0.14
320 0.17
321 0.15
322 0.17
323 0.18
324 0.17
325 0.19
326 0.17
327 0.18
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.17
332 0.22
333 0.24
334 0.25
335 0.27
336 0.3
337 0.33
338 0.37
339 0.41
340 0.41
341 0.42
342 0.47
343 0.44
344 0.42
345 0.39
346 0.33
347 0.3
348 0.25
349 0.24
350 0.23
351 0.24
352 0.21
353 0.2
354 0.2
355 0.2
356 0.21
357 0.21
358 0.2
359 0.24
360 0.26
361 0.29
362 0.3
363 0.3
364 0.34
365 0.39
366 0.43
367 0.45
368 0.47
369 0.48
370 0.49
371 0.52
372 0.54
373 0.54
374 0.52
375 0.56
376 0.61
377 0.63
378 0.7
379 0.73
380 0.74
381 0.75
382 0.8
383 0.81
384 0.82
385 0.85
386 0.82
387 0.85
388 0.85
389 0.86
390 0.84
391 0.82
392 0.82
393 0.81
394 0.86
395 0.85
396 0.85
397 0.8