Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UW78

Protein Details
Accession A0A642UW78    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-40PSSPHSSNDEPKRKRVKKAPQGPRCQFFIHydrophilic
85-106ADHLQRCNKRFKEKPWFKKDYHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-30KRKRVKKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.333, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007871  Methyltransferase_TRM13  
IPR039044  Trm13  
IPR022776  TRM13/UPF0224_CHHC_Znf_dom  
IPR021721  Znf_CCCH-type_TRM13  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0106050  F:tRNA 2'-O-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05206  TRM13  
PF11722  zf-TRM13_CCCH  
PF05253  zf-U11-48K  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51800  ZF_CHHC_U11_48K  
Amino Acid Sequences MTPPSMSLPHGPSSPHSSNDEPKRKRVKKAPQGPRCQFFIERKNRQCPLQVPAGKNWCRQHDPDQSERVKCPLDPTHSVVKIHLADHLQRCNKRFKEKPWFKKDYHWLSYKEEAKTINGRSEAADGYEKESELDASNTRSGECEQETISQECDKESDDLCIATSTANAAQTQLIKYVVSVLDGITFEPLKKKHLHHKGLEPRLNQVTNQKHALQQSSLIGSLKEYDMLSENNYYVEFGCGKAEFSKYVADCITHDNSNTSMDKLGFGLIDRGVNRLKTDGKLKQITPSVKRDRIDIKDLDLEKFLEGEPATSVVAISKHLCGVATDLTFRCLHTIQSRVKGAVVAMCCRHVCKYHQLSPEARQFLARHHIKAESHFKALQKVASWAVDGGKDVEVGLKARRLIDEARVQGVRQQFAQHHVELIEYASRETTLENCAMCVYIKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.36
3 0.38
4 0.4
5 0.48
6 0.58
7 0.64
8 0.6
9 0.67
10 0.75
11 0.77
12 0.82
13 0.83
14 0.83
15 0.83
16 0.89
17 0.9
18 0.89
19 0.93
20 0.91
21 0.85
22 0.78
23 0.72
24 0.68
25 0.66
26 0.66
27 0.66
28 0.68
29 0.72
30 0.78
31 0.77
32 0.74
33 0.72
34 0.66
35 0.6
36 0.6
37 0.58
38 0.52
39 0.57
40 0.63
41 0.6
42 0.63
43 0.64
44 0.61
45 0.6
46 0.61
47 0.62
48 0.63
49 0.65
50 0.64
51 0.68
52 0.67
53 0.65
54 0.62
55 0.57
56 0.48
57 0.42
58 0.42
59 0.39
60 0.4
61 0.4
62 0.43
63 0.48
64 0.49
65 0.49
66 0.42
67 0.41
68 0.36
69 0.32
70 0.31
71 0.24
72 0.28
73 0.32
74 0.41
75 0.43
76 0.45
77 0.49
78 0.55
79 0.59
80 0.62
81 0.65
82 0.66
83 0.7
84 0.76
85 0.84
86 0.84
87 0.85
88 0.77
89 0.79
90 0.79
91 0.78
92 0.74
93 0.69
94 0.62
95 0.61
96 0.67
97 0.63
98 0.54
99 0.46
100 0.4
101 0.38
102 0.41
103 0.37
104 0.34
105 0.28
106 0.28
107 0.26
108 0.27
109 0.23
110 0.18
111 0.19
112 0.15
113 0.17
114 0.17
115 0.16
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.11
120 0.13
121 0.11
122 0.13
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.18
133 0.21
134 0.2
135 0.21
136 0.19
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.11
175 0.12
176 0.15
177 0.19
178 0.23
179 0.33
180 0.43
181 0.5
182 0.5
183 0.59
184 0.66
185 0.7
186 0.72
187 0.62
188 0.56
189 0.53
190 0.49
191 0.4
192 0.38
193 0.34
194 0.31
195 0.33
196 0.3
197 0.29
198 0.3
199 0.31
200 0.23
201 0.19
202 0.17
203 0.15
204 0.15
205 0.12
206 0.1
207 0.08
208 0.09
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.13
233 0.12
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.16
239 0.18
240 0.14
241 0.15
242 0.14
243 0.15
244 0.17
245 0.17
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.16
264 0.17
265 0.24
266 0.27
267 0.33
268 0.37
269 0.37
270 0.4
271 0.44
272 0.48
273 0.46
274 0.52
275 0.53
276 0.54
277 0.54
278 0.53
279 0.54
280 0.52
281 0.52
282 0.44
283 0.38
284 0.4
285 0.41
286 0.37
287 0.3
288 0.26
289 0.2
290 0.19
291 0.16
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.1
310 0.12
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.17
316 0.16
317 0.17
318 0.14
319 0.17
320 0.19
321 0.26
322 0.29
323 0.36
324 0.38
325 0.36
326 0.35
327 0.33
328 0.29
329 0.25
330 0.22
331 0.19
332 0.18
333 0.2
334 0.2
335 0.21
336 0.23
337 0.23
338 0.25
339 0.32
340 0.4
341 0.45
342 0.51
343 0.55
344 0.57
345 0.61
346 0.65
347 0.57
348 0.48
349 0.44
350 0.38
351 0.38
352 0.44
353 0.41
354 0.34
355 0.34
356 0.39
357 0.36
358 0.43
359 0.48
360 0.41
361 0.42
362 0.43
363 0.43
364 0.44
365 0.45
366 0.4
367 0.32
368 0.31
369 0.3
370 0.27
371 0.26
372 0.21
373 0.2
374 0.18
375 0.17
376 0.15
377 0.13
378 0.12
379 0.11
380 0.12
381 0.12
382 0.13
383 0.15
384 0.17
385 0.18
386 0.2
387 0.21
388 0.22
389 0.24
390 0.29
391 0.34
392 0.34
393 0.38
394 0.37
395 0.36
396 0.37
397 0.4
398 0.35
399 0.28
400 0.31
401 0.28
402 0.34
403 0.39
404 0.34
405 0.31
406 0.29
407 0.28
408 0.23
409 0.22
410 0.19
411 0.15
412 0.15
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.14
417 0.14
418 0.15
419 0.18
420 0.17
421 0.17
422 0.17
423 0.18