FuNGI

A0A642UPS3

Protein Details

Accession

A0A642UPS3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
578-598	ERGSGRGKGRHQRRNERDRLS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
574-592	RFEEERGSGRGKGRHQRRN

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10.833, cyto 9, cyto_mito 6.833, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022712 Beta_Casp IPR027075 CPSF2 IPR025069 Cpsf2_C IPR035639 CPSF2_MBL IPR001279 Metallo-B-lactamas IPR036866 RibonucZ/Hydroxyglut_hydro
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation
Pfam	View protein in Pfam PF10996 Beta-Casp PF13299 CPSF100_C PF16661 Lactamase_B_6
CDD	cd16293 CPSF2-like_MBL-fold

Amino Acid Sequences

MFQFSLLSPSSSDTSFRAGKLTFDGDVSILADPSWNGVNPDVVAFLEPHLPHISAIVLSHSTPESVSGYVLLCIKFPQLMQQIPVYSTLPVNQLGRIATVEFYRARGVLGPLPSALVELDEVDEWWDRVTPLKYLQSTHLSEAKLTLTPFNAGHSLGGTFWVVTKRQEKIIYAPKWNHSKDSFLNSASWVSASTGNPLAQLLRPTAIITSTDVGSATAHKKRTDKFLALVDATIANGGAVVLPCTLSGRFLEIFHLVDAHLQDAPVPVPVYFLSYSGTRVLSYASNLLDWMAPSLLKQWQDVATMEGGSNRVPFDPSKVDLLPDPKDLQRHSGPKIVFCSGNDIANGDLSAEAFRYLAGNEKTTIILTERSANDDVSRMLYEQWVTLATQLNNGVVDDGVVVPFEKVLSTDQWTTEEPLSGTDLTRYQGKVHAHRKQRMEAKVRDRKNKNLLEGDMDDDEDSSEEEAELMDGLSDEEAAAEAEPASKDANGDASVATELASHEAFVTDHIKQAVDQGRALDLKVTAKLKPRQAMFPYIVPKKKYDDYGAIIDIRQFQKQEDNSQSQIINEGKRRFEEERGSGRGKGRHQRRNERDRLSPQEQLNQQIIKRYLDALAEPQQRVPLGQVTSANRQLRVRCGLSYVDLSGTTDLRSLSAIVASLKPYNVILLPDTTSADHQGLKDVDAAFKKLLETNTTEQDSSEPDTLGSRLLSLAAIRSSSGLSSTAATSQARMSVNAVMPTETITLGSGDDKGISVGQLELKLDEELVASLKWQNIDGSYRVAPVVGELELVSTNKRPAQIGDVVNAQTQFTLKRLKADDAAAKVSSRPAQLGGPRLAIGNVSLPELKKKLINRNLKAEFKSEGTLVVNDTIAVRKVAYSNSDSDNTGDIVIDGSMGPLYYEVKECIRDSLAYV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.24
4	0.26
5	0.24
6	0.25
7	0.28
8	0.29
9	0.24
10	0.21
11	0.22
12	0.17
13	0.18
14	0.17
15	0.13
16	0.1
17	0.09
18	0.09
19	0.08
20	0.1
21	0.11
22	0.11
23	0.12
24	0.12
25	0.14
26	0.14
27	0.15
28	0.13
29	0.12
30	0.12
31	0.11
32	0.11
33	0.16
34	0.15
35	0.18
36	0.2
37	0.2
38	0.19
39	0.19
40	0.19
41	0.13
42	0.14
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.14
47	0.13
48	0.13
49	0.12
50	0.14
51	0.13
52	0.12
53	0.12
54	0.12
55	0.12
56	0.13
57	0.17
58	0.15
59	0.13
60	0.14
61	0.15
62	0.15
63	0.14
64	0.21
65	0.24
66	0.26
67	0.28
68	0.31
69	0.31
70	0.31
71	0.33
72	0.25
73	0.2
74	0.19
75	0.19
76	0.17
77	0.19
78	0.19
79	0.18
80	0.19
81	0.18
82	0.18
83	0.17
84	0.15
85	0.13
86	0.13
87	0.16
88	0.15
89	0.16
90	0.16
91	0.15
92	0.15
93	0.16
94	0.19
95	0.2
96	0.21
97	0.2
98	0.19
99	0.19
100	0.18
101	0.16
102	0.13
103	0.09
104	0.07
105	0.06
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.08
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.1
114	0.09
115	0.14
116	0.16
117	0.17
118	0.22
119	0.29
120	0.3
121	0.32
122	0.36
123	0.38
124	0.39
125	0.4
126	0.4
127	0.33
128	0.32
129	0.31
130	0.28
131	0.23
132	0.21
133	0.19
134	0.15
135	0.17
136	0.17
137	0.18
138	0.17
139	0.15
140	0.15
141	0.13
142	0.13
143	0.1
144	0.11
145	0.09
146	0.08
147	0.09
148	0.13
149	0.13
150	0.18
151	0.23
152	0.25
153	0.3
154	0.34
155	0.33
156	0.39
157	0.48
158	0.48
159	0.51
160	0.54
161	0.56
162	0.62
163	0.62
164	0.59
165	0.51
166	0.51
167	0.48
168	0.5
169	0.46
170	0.38
171	0.37
172	0.32
173	0.31
174	0.25
175	0.2
176	0.13
177	0.12
178	0.15
179	0.14
180	0.16
181	0.17
182	0.17
183	0.17
184	0.17
185	0.16
186	0.14
187	0.15
188	0.14
189	0.12
190	0.12
191	0.12
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.13
203	0.17
204	0.21
205	0.24
206	0.28
207	0.33
208	0.36
209	0.45
210	0.48
211	0.45
212	0.44
213	0.46
214	0.46
215	0.41
216	0.37
217	0.29
218	0.22
219	0.18
220	0.14
221	0.09
222	0.05
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.05
230	0.05
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.13
239	0.13
240	0.14
241	0.13
242	0.13
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.1
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.13
263	0.13
264	0.14
265	0.1
266	0.1
267	0.11
268	0.1
269	0.11
270	0.12
271	0.11
272	0.1
273	0.1
274	0.11
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.09
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.14
286	0.15
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.13
291	0.12
292	0.12
293	0.11
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.13
302	0.16
303	0.17
304	0.2
305	0.19
306	0.2
307	0.21
308	0.25
309	0.23
310	0.22
311	0.23
312	0.21
313	0.25
314	0.25
315	0.28
316	0.3
317	0.33
318	0.34
319	0.37
320	0.36
321	0.35
322	0.38
323	0.34
324	0.29
325	0.23
326	0.28
327	0.22
328	0.23
329	0.2
330	0.17
331	0.15
332	0.14
333	0.14
334	0.06
335	0.05
336	0.04
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.13
348	0.14
349	0.14
350	0.14
351	0.14
352	0.09
353	0.1
354	0.1
355	0.14
356	0.14
357	0.17
358	0.18
359	0.17
360	0.16
361	0.16
362	0.15
363	0.12
364	0.12
365	0.09
366	0.08
367	0.09
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.11
375	0.1
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.09
382	0.05
383	0.05
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.03
388	0.04
389	0.03
390	0.04
391	0.04
392	0.03
393	0.04
394	0.05
395	0.07
396	0.09
397	0.1
398	0.11
399	0.13
400	0.14
401	0.15
402	0.14
403	0.14
404	0.11
405	0.11
406	0.12
407	0.1
408	0.09
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.11
413	0.11
414	0.1
415	0.15
416	0.19
417	0.27
418	0.35
419	0.42
420	0.48
421	0.54
422	0.57
423	0.59
424	0.63
425	0.62
426	0.61
427	0.61
428	0.63
429	0.66
430	0.69
431	0.72
432	0.69
433	0.69
434	0.7
435	0.66
436	0.6
437	0.54
438	0.48
439	0.42
440	0.38
441	0.32
442	0.23
443	0.19
444	0.14
445	0.11
446	0.1
447	0.06
448	0.06
449	0.04
450	0.04
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.02
458	0.02
459	0.03
460	0.02
461	0.03
462	0.02
463	0.02
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.05
485	0.04
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.09
494	0.08
495	0.09
496	0.1
497	0.1
498	0.09
499	0.16
500	0.2
501	0.19
502	0.19
503	0.18
504	0.19
505	0.2
506	0.2
507	0.14
508	0.09
509	0.09
510	0.12
511	0.14
512	0.14
513	0.22
514	0.28
515	0.32
516	0.36
517	0.36
518	0.39
519	0.41
520	0.43
521	0.37
522	0.37
523	0.39
524	0.41
525	0.44
526	0.39
527	0.38
528	0.38
529	0.38
530	0.36
531	0.33
532	0.3
533	0.29
534	0.3
535	0.3
536	0.25
537	0.23
538	0.21
539	0.22
540	0.19
541	0.17
542	0.15
543	0.15
544	0.21
545	0.23
546	0.29
547	0.3
548	0.33
549	0.33
550	0.35
551	0.34
552	0.27
553	0.3
554	0.26
555	0.24
556	0.26
557	0.28
558	0.28
559	0.28
560	0.33
561	0.31
562	0.34
563	0.35
564	0.36
565	0.39
566	0.42
567	0.44
568	0.42
569	0.44
570	0.44
571	0.45
572	0.48
573	0.52
574	0.55
575	0.62
576	0.7
577	0.76
578	0.81
579	0.83
580	0.79
581	0.77
582	0.77
583	0.76
584	0.69
585	0.65
586	0.56
587	0.55
588	0.51
589	0.47
590	0.43
591	0.37
592	0.33
593	0.33
594	0.33
595	0.27
596	0.25
597	0.22
598	0.2
599	0.18
600	0.18
601	0.16
602	0.22
603	0.26
604	0.25
605	0.25
606	0.25
607	0.24
608	0.24
609	0.21
610	0.17
611	0.13
612	0.15
613	0.18
614	0.21
615	0.26
616	0.33
617	0.33
618	0.31
619	0.34
620	0.34
621	0.35
622	0.37
623	0.34
624	0.27
625	0.28
626	0.26
627	0.25
628	0.24
629	0.2
630	0.14
631	0.13
632	0.13
633	0.12
634	0.11
635	0.09
636	0.09
637	0.08
638	0.08
639	0.08
640	0.08
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.08
645	0.09
646	0.1
647	0.11
648	0.1
649	0.11
650	0.1
651	0.11
652	0.1
653	0.1
654	0.1
655	0.1
656	0.11
657	0.12
658	0.13
659	0.12
660	0.12
661	0.13
662	0.13
663	0.13
664	0.12
665	0.16
666	0.16
667	0.16
668	0.18
669	0.17
670	0.2
671	0.2
672	0.21
673	0.17
674	0.17
675	0.17
676	0.18
677	0.18
678	0.17
679	0.21
680	0.23
681	0.29
682	0.3
683	0.29
684	0.25
685	0.25
686	0.25
687	0.23
688	0.21
689	0.15
690	0.13
691	0.15
692	0.15
693	0.15
694	0.12
695	0.09
696	0.07
697	0.08
698	0.08
699	0.07
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.08
706	0.08
707	0.09
708	0.08
709	0.08
710	0.09
711	0.1
712	0.1
713	0.12
714	0.12
715	0.12
716	0.12
717	0.16
718	0.16
719	0.16
720	0.16
721	0.18
722	0.2
723	0.22
724	0.21
725	0.17
726	0.16
727	0.17
728	0.16
729	0.12
730	0.1
731	0.08
732	0.08
733	0.08
734	0.09
735	0.08
736	0.07
737	0.08
738	0.07
739	0.08
740	0.07
741	0.07
742	0.07
743	0.07
744	0.09
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.11
749	0.11
750	0.11
751	0.1
752	0.08
753	0.07
754	0.08
755	0.08
756	0.07
757	0.1
758	0.11
759	0.12
760	0.12
761	0.13
762	0.14
763	0.17
764	0.18
765	0.2
766	0.19
767	0.2
768	0.19
769	0.18
770	0.15
771	0.13
772	0.13
773	0.08
774	0.08
775	0.07
776	0.08
777	0.09
778	0.1
779	0.11
780	0.11
781	0.15
782	0.17
783	0.18
784	0.19
785	0.19
786	0.25
787	0.3
788	0.3
789	0.3
790	0.31
791	0.31
792	0.32
793	0.3
794	0.24
795	0.17
796	0.16
797	0.15
798	0.14
799	0.22
800	0.2
801	0.28
802	0.31
803	0.34
804	0.37
805	0.41
806	0.44
807	0.4
808	0.43
809	0.37
810	0.34
811	0.31
812	0.32
813	0.3
814	0.25
815	0.22
816	0.2
817	0.25
818	0.29
819	0.34
820	0.33
821	0.3
822	0.29
823	0.29
824	0.27
825	0.22
826	0.18
827	0.15
828	0.13
829	0.14
830	0.16
831	0.17
832	0.23
833	0.24
834	0.26
835	0.27
836	0.34
837	0.43
838	0.5
839	0.6
840	0.61
841	0.69
842	0.76
843	0.78
844	0.73
845	0.65
846	0.59
847	0.51
848	0.46
849	0.36
850	0.3
851	0.25
852	0.23
853	0.21
854	0.19
855	0.16
856	0.14
857	0.15
858	0.15
859	0.14
860	0.13
861	0.12
862	0.12
863	0.15
864	0.17
865	0.21
866	0.22
867	0.25
868	0.29
869	0.31
870	0.3
871	0.29
872	0.28
873	0.25
874	0.21
875	0.17
876	0.12
877	0.11
878	0.1
879	0.09
880	0.06
881	0.06
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.08
887	0.1
888	0.12
889	0.14
890	0.17
891	0.22
892	0.23
893	0.26
894	0.26

A0A642UPS3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer