FuNGI

F4P2C9

Protein Details

Accession

F4P2C9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	RTMDERRKARREAREREELE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
109-129	RRKARREAREREELERYRRER

Subcellular Location(s)

mito 17, cyto_mito 11.5, nucl 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0000244 P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF14559 TPR_19 PF13181 TPR_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR

Amino Acid Sequences

MSKPAPPNYIAGLGRGANSFTTRSDIGPARENAPDDGAALAAAQAATEGRRIPGKRGEDDGEGPSGVDPSEQYQDPDQERGLFNTAPYEADDEEADHIYEQIERTMDERRKARREAREREELERYRRERPKIQQQFVDLKRGLATMSEDEWAAIPEVGDMVRKKGASGKKSGLAERYTAVPDSVLLGAASRSQLVQSIDASGNGAASVMSNLGADTGRTDFAQFGQARDKVLGLKLDQVSDSVSGQTTIDPKGYLTDLSSVIIKSDSEISDIKKARTLLRSVTTTNPKHAPGWIAAARLEEHAGKLSAARDVISRGCDECPVNEDVWLEAARLNTIDNAKIILANAARMIPQSVKIWLRACDLETDPKAQKRVLRRALEYIPNSVKIWKAAVSLEADPEDARILLSRAVECVPLSVELWLALARLESYENARKVLNKARQAIPTSHEIWVGAAKLEEQNGNLRMVDKVIERSVSKLTEVGTNLEREQWLTEAESCERDGFVGVAESIVRCTIDIGIEEDDYKQTWIDDAEGCISRSAYATARAIYTHALKVFPNKKSVWRQAAFFEKAHGTRESLEELLQRAVRYCPQAEVLWLMGAKEKWLSGDIEAAKSILSNAFAANPNSEQIWLAAIKLEVETGEYHRARVLLASARERADTERVWMKSAVLERQQGRFQDAIELLNQGIQKFPLFSKLWVIKGQILDEDLEDIENARDNYAQALKRIPKSVVLWLLASRLEEKAGLPIKARATLEKARIMNAKVPEFWCEAIRVEVRAGNAPMAKALLAKSLQDCPTSGLLWSEAILMEARPQRKARSADALKKCENDPMVVATIARLFWAERKLDKARNWFNRAVKTNPDLGDSWGWWYKFELTHGTAEQQLEVMNRCVLAEPRHGTIWQQESKRMQNVGKKTDEILKLVAAEMSNSNL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.24
3	0.21
4	0.16
5	0.18
6	0.18
7	0.15
8	0.19
9	0.19
10	0.19
11	0.25
12	0.29
13	0.3
14	0.36
15	0.38
16	0.36
17	0.38
18	0.39
19	0.34
20	0.32
21	0.28
22	0.21
23	0.18
24	0.15
25	0.12
26	0.1
27	0.08
28	0.06
29	0.05
30	0.04
31	0.04
32	0.05
33	0.06
34	0.08
35	0.09
36	0.1
37	0.18
38	0.2
39	0.26
40	0.34
41	0.4
42	0.43
43	0.47
44	0.49
45	0.47
46	0.48
47	0.45
48	0.38
49	0.31
50	0.28
51	0.22
52	0.18
53	0.14
54	0.11
55	0.09
56	0.1
57	0.15
58	0.16
59	0.18
60	0.21
61	0.28
62	0.31
63	0.33
64	0.31
65	0.3
66	0.31
67	0.32
68	0.32
69	0.25
70	0.23
71	0.23
72	0.22
73	0.19
74	0.18
75	0.18
76	0.15
77	0.15
78	0.15
79	0.13
80	0.14
81	0.14
82	0.13
83	0.11
84	0.11
85	0.1
86	0.11
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.11
91	0.12
92	0.22
93	0.27
94	0.32
95	0.39
96	0.47
97	0.54
98	0.62
99	0.7
100	0.72
101	0.77
102	0.8
103	0.8
104	0.81
105	0.77
106	0.74
107	0.75
108	0.71
109	0.68
110	0.68
111	0.64
112	0.64
113	0.68
114	0.69
115	0.69
116	0.72
117	0.76
118	0.77
119	0.8
120	0.75
121	0.73
122	0.76
123	0.7
124	0.68
125	0.57
126	0.47
127	0.41
128	0.36
129	0.29
130	0.2
131	0.21
132	0.14
133	0.15
134	0.15
135	0.14
136	0.13
137	0.14
138	0.13
139	0.11
140	0.08
141	0.07
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.11
146	0.11
147	0.13
148	0.16
149	0.16
150	0.16
151	0.24
152	0.32
153	0.33
154	0.39
155	0.41
156	0.44
157	0.48
158	0.51
159	0.48
160	0.42
161	0.39
162	0.33
163	0.31
164	0.26
165	0.23
166	0.2
167	0.14
168	0.13
169	0.13
170	0.12
171	0.09
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.07
178	0.07
179	0.06
180	0.1
181	0.11
182	0.12
183	0.12
184	0.15
185	0.15
186	0.15
187	0.16
188	0.12
189	0.11
190	0.09
191	0.09
192	0.05
193	0.04
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.09
208	0.1
209	0.18
210	0.17
211	0.17
212	0.23
213	0.24
214	0.25
215	0.25
216	0.25
217	0.19
218	0.2
219	0.21
220	0.15
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.2
225	0.19
226	0.17
227	0.16
228	0.16
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.1
234	0.11
235	0.11
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.12
240	0.13
241	0.11
242	0.1
243	0.11
244	0.11
245	0.12
246	0.13
247	0.11
248	0.1
249	0.11
250	0.09
251	0.08
252	0.11
253	0.1
254	0.12
255	0.14
256	0.15
257	0.23
258	0.26
259	0.25
260	0.26
261	0.27
262	0.3
263	0.33
264	0.33
265	0.3
266	0.33
267	0.35
268	0.34
269	0.39
270	0.44
271	0.41
272	0.43
273	0.41
274	0.37
275	0.35
276	0.35
277	0.29
278	0.21
279	0.26
280	0.23
281	0.21
282	0.2
283	0.2
284	0.19
285	0.17
286	0.17
287	0.11
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.11
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.15
305	0.15
306	0.13
307	0.15
308	0.16
309	0.15
310	0.15
311	0.14
312	0.12
313	0.13
314	0.13
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.1
323	0.1
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.07
338	0.09
339	0.1
340	0.13
341	0.14
342	0.18
343	0.2
344	0.2
345	0.22
346	0.21
347	0.21
348	0.2
349	0.2
350	0.23
351	0.22
352	0.25
353	0.26
354	0.27
355	0.29
356	0.27
357	0.3
358	0.33
359	0.42
360	0.47
361	0.48
362	0.47
363	0.51
364	0.53
365	0.56
366	0.48
367	0.43
368	0.35
369	0.32
370	0.31
371	0.26
372	0.23
373	0.16
374	0.16
375	0.12
376	0.12
377	0.1
378	0.11
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.1
385	0.09
386	0.08
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.08
398	0.08
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.03
411	0.04
412	0.04
413	0.05
414	0.09
415	0.14
416	0.15
417	0.16
418	0.16
419	0.18
420	0.21
421	0.29
422	0.32
423	0.32
424	0.36
425	0.4
426	0.43
427	0.44
428	0.42
429	0.35
430	0.33
431	0.29
432	0.25
433	0.21
434	0.17
435	0.15
436	0.14
437	0.12
438	0.08
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.08
454	0.09
455	0.09
456	0.1
457	0.1
458	0.12
459	0.13
460	0.12
461	0.12
462	0.11
463	0.11
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.14
469	0.14
470	0.14
471	0.13
472	0.1
473	0.1
474	0.08
475	0.08
476	0.07
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.11
481	0.11
482	0.1
483	0.09
484	0.09
485	0.08
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.03
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.05
501	0.06
502	0.07
503	0.07
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.06
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.1
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.1
524	0.08
525	0.1
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.12
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.12
537	0.21
538	0.28
539	0.28
540	0.31
541	0.31
542	0.38
543	0.46
544	0.54
545	0.54
546	0.48
547	0.48
548	0.48
549	0.54
550	0.49
551	0.4
552	0.34
553	0.28
554	0.27
555	0.28
556	0.25
557	0.18
558	0.16
559	0.18
560	0.18
561	0.15
562	0.15
563	0.14
564	0.14
565	0.15
566	0.15
567	0.14
568	0.13
569	0.14
570	0.16
571	0.17
572	0.16
573	0.15
574	0.16
575	0.17
576	0.16
577	0.16
578	0.14
579	0.12
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.1
585	0.09
586	0.08
587	0.08
588	0.1
589	0.1
590	0.08
591	0.14
592	0.14
593	0.15
594	0.15
595	0.14
596	0.12
597	0.12
598	0.12
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.09
604	0.11
605	0.12
606	0.13
607	0.13
608	0.13
609	0.13
610	0.13
611	0.1
612	0.08
613	0.09
614	0.08
615	0.07
616	0.08
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.05
622	0.06
623	0.07
624	0.08
625	0.16
626	0.16
627	0.16
628	0.17
629	0.18
630	0.16
631	0.16
632	0.17
633	0.14
634	0.18
635	0.21
636	0.23
637	0.23
638	0.24
639	0.24
640	0.23
641	0.22
642	0.19
643	0.2
644	0.25
645	0.25
646	0.27
647	0.26
648	0.24
649	0.24
650	0.27
651	0.27
652	0.24
653	0.3
654	0.3
655	0.34
656	0.37
657	0.34
658	0.35
659	0.3
660	0.26
661	0.25
662	0.23
663	0.2
664	0.17
665	0.17
666	0.13
667	0.16
668	0.16
669	0.11
670	0.11
671	0.1
672	0.1
673	0.11
674	0.11
675	0.16
676	0.17
677	0.17
678	0.25
679	0.29
680	0.31
681	0.32
682	0.34
683	0.3
684	0.3
685	0.3
686	0.22
687	0.19
688	0.17
689	0.14
690	0.13
691	0.1
692	0.08
693	0.07
694	0.07
695	0.07
696	0.09
697	0.09
698	0.09
699	0.09
700	0.09
701	0.13
702	0.18
703	0.2
704	0.18
705	0.26
706	0.32
707	0.35
708	0.38
709	0.36
710	0.34
711	0.35
712	0.4
713	0.37
714	0.32
715	0.3
716	0.27
717	0.27
718	0.23
719	0.22
720	0.17
721	0.12
722	0.11
723	0.11
724	0.11
725	0.17
726	0.2
727	0.2
728	0.2
729	0.24
730	0.25
731	0.29
732	0.3
733	0.25
734	0.28
735	0.34
736	0.37
737	0.4
738	0.39
739	0.38
740	0.42
741	0.41
742	0.4
743	0.39
744	0.37
745	0.34
746	0.34
747	0.34
748	0.32
749	0.3
750	0.26
751	0.22
752	0.2
753	0.22
754	0.22
755	0.2
756	0.19
757	0.19
758	0.2
759	0.22
760	0.22
761	0.2
762	0.2
763	0.18
764	0.17
765	0.16
766	0.14
767	0.12
768	0.12
769	0.13
770	0.13
771	0.15
772	0.17
773	0.22
774	0.24
775	0.24
776	0.24
777	0.23
778	0.24
779	0.23
780	0.21
781	0.16
782	0.15
783	0.14
784	0.14
785	0.11
786	0.08
787	0.09
788	0.09
789	0.08
790	0.13
791	0.19
792	0.2
793	0.25
794	0.28
795	0.32
796	0.4
797	0.45
798	0.44
799	0.49
800	0.57
801	0.62
802	0.68
803	0.71
804	0.67
805	0.66
806	0.61
807	0.57
808	0.49
809	0.4
810	0.32
811	0.28
812	0.26
813	0.23
814	0.22
815	0.17
816	0.16
817	0.14
818	0.12
819	0.1
820	0.08
821	0.13
822	0.18
823	0.21
824	0.22
825	0.3
826	0.38
827	0.45
828	0.51
829	0.57
830	0.62
831	0.69
832	0.73
833	0.74
834	0.73
835	0.75
836	0.74
837	0.68
838	0.65
839	0.59
840	0.59
841	0.52
842	0.48
843	0.4
844	0.38
845	0.37
846	0.3
847	0.31
848	0.29
849	0.28
850	0.25
851	0.27
852	0.27
853	0.26
854	0.29
855	0.3
856	0.27
857	0.32
858	0.32
859	0.32
860	0.31
861	0.3
862	0.27
863	0.21
864	0.19
865	0.18
866	0.19
867	0.19
868	0.16
869	0.15
870	0.16
871	0.18
872	0.2
873	0.22
874	0.28
875	0.29
876	0.31
877	0.33
878	0.33
879	0.33
880	0.37
881	0.41
882	0.41
883	0.4
884	0.45
885	0.5
886	0.57
887	0.62
888	0.6
889	0.58
890	0.59
891	0.65
892	0.66
893	0.63
894	0.58
895	0.55
896	0.57
897	0.54
898	0.48
899	0.4
900	0.33
901	0.29
902	0.27
903	0.26
904	0.17
905	0.16

F4P2C9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer