FuNGI

A0A642UWT9

Protein Details

Accession

A0A642UWT9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-51	LTDGSSKKRPRKEEIMQQHEM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
260-264	KHKRA

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000690 Matrin/U1-C_Znf_C2H2 IPR003604 Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2 IPR024598 SF3a60/Prp9_C IPR036236 Znf_C2H2_sf
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF11931 SF3a60_Prp9_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50171 ZF_MATRIN

Amino Acid Sequences

MSLLDRQRNVLEEYDTLDFQVSERIRRNPNLTDGSSKKRPRKEEIMQQHEMCLMAERMTKQAETFDESDPSKTKLEIESMKDLEFTFADLHSKIKDTMSECSGIQFVEDINGSYAMYSSATNYSERGGKVKVQRKEILSKTCAPYLDIEFLFSPTELWGTILDLYPFYRQKHCENDERSYVFYLESLVTSKQLDMHQASAILSYIVDFWKRSHPLMNVDKKLIEVRGEVNPSSSDGQIWCGPCNKWFKESIYYNHLDGKKHKRAAKHTTDIKKPNRTDGEIITWILENPLKKEFEATKRAAAQPQTDRERLLEVSRLEGEDSDYTDVDSDNDDNDSDDDTNLLANLPTDANERPIPHWLYKLQGLNKSFHCEICGNAAYQGKITFERHFTQSKHQYGLKCLGVREDQVIFFNSITSIKEAQNLLLNLQQKQKDKYFEEEVEDSEGNVMSKSDYDELKQQGLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.24
3	0.22
4	0.2
5	0.16
6	0.14
7	0.21
8	0.2
9	0.24
10	0.3
11	0.37
12	0.44
13	0.5
14	0.56
15	0.53
16	0.59
17	0.6
18	0.57
19	0.58
20	0.57
21	0.6
22	0.64
23	0.67
24	0.68
25	0.7
26	0.74
27	0.74
28	0.78
29	0.79
30	0.8
31	0.82
32	0.81
33	0.8
34	0.73
35	0.65
36	0.56
37	0.46
38	0.35
39	0.27
40	0.19
41	0.15
42	0.18
43	0.17
44	0.2
45	0.21
46	0.21
47	0.19
48	0.22
49	0.22
50	0.24
51	0.25
52	0.24
53	0.27
54	0.27
55	0.3
56	0.29
57	0.29
58	0.25
59	0.23
60	0.23
61	0.21
62	0.27
63	0.3
64	0.33
65	0.37
66	0.38
67	0.37
68	0.36
69	0.33
70	0.28
71	0.22
72	0.18
73	0.12
74	0.11
75	0.13
76	0.12
77	0.14
78	0.13
79	0.15
80	0.15
81	0.15
82	0.19
83	0.19
84	0.23
85	0.24
86	0.24
87	0.22
88	0.22
89	0.22
90	0.17
91	0.14
92	0.1
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.06
103	0.07
104	0.06
105	0.07
106	0.09
107	0.11
108	0.11
109	0.12
110	0.13
111	0.16
112	0.17
113	0.18
114	0.18
115	0.23
116	0.32
117	0.4
118	0.44
119	0.46
120	0.51
121	0.53
122	0.6
123	0.6
124	0.58
125	0.54
126	0.55
127	0.51
128	0.49
129	0.44
130	0.36
131	0.33
132	0.28
133	0.28
134	0.21
135	0.2
136	0.17
137	0.18
138	0.17
139	0.14
140	0.12
141	0.07
142	0.08
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.09
152	0.13
153	0.16
154	0.17
155	0.21
156	0.24
157	0.29
158	0.38
159	0.42
160	0.46
161	0.48
162	0.51
163	0.51
164	0.5
165	0.46
166	0.37
167	0.33
168	0.24
169	0.19
170	0.15
171	0.1
172	0.09
173	0.09
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.09
178	0.1
179	0.11
180	0.14
181	0.13
182	0.14
183	0.14
184	0.14
185	0.14
186	0.11
187	0.1
188	0.07
189	0.06
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.14
197	0.16
198	0.17
199	0.2
200	0.22
201	0.3
202	0.38
203	0.45
204	0.41
205	0.4
206	0.39
207	0.35
208	0.35
209	0.27
210	0.19
211	0.12
212	0.12
213	0.14
214	0.16
215	0.15
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.15
220	0.12
221	0.1
222	0.08
223	0.1
224	0.12
225	0.13
226	0.12
227	0.14
228	0.15
229	0.19
230	0.26
231	0.25
232	0.25
233	0.27
234	0.28
235	0.33
236	0.37
237	0.36
238	0.35
239	0.36
240	0.34
241	0.38
242	0.38
243	0.32
244	0.36
245	0.42
246	0.43
247	0.48
248	0.5
249	0.51
250	0.57
251	0.65
252	0.66
253	0.65
254	0.66
255	0.67
256	0.73
257	0.75
258	0.74
259	0.74
260	0.66
261	0.65
262	0.6
263	0.56
264	0.5
265	0.43
266	0.4
267	0.32
268	0.31
269	0.24
270	0.19
271	0.16
272	0.15
273	0.14
274	0.1
275	0.1
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.18
280	0.23
281	0.28
282	0.35
283	0.35
284	0.35
285	0.39
286	0.41
287	0.41
288	0.37
289	0.36
290	0.35
291	0.41
292	0.43
293	0.4
294	0.39
295	0.35
296	0.36
297	0.31
298	0.26
299	0.23
300	0.18
301	0.19
302	0.19
303	0.19
304	0.16
305	0.15
306	0.16
307	0.11
308	0.13
309	0.11
310	0.11
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.08
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.07
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.09
336	0.1
337	0.13
338	0.16
339	0.18
340	0.18
341	0.25
342	0.28
343	0.27
344	0.3
345	0.28
346	0.29
347	0.33
348	0.39
349	0.37
350	0.4
351	0.41
352	0.42
353	0.42
354	0.46
355	0.41
356	0.35
357	0.33
358	0.27
359	0.26
360	0.28
361	0.27
362	0.21
363	0.23
364	0.25
365	0.22
366	0.22
367	0.22
368	0.17
369	0.19
370	0.22
371	0.22
372	0.24
373	0.28
374	0.31
375	0.36
376	0.37
377	0.44
378	0.51
379	0.52
380	0.53
381	0.54
382	0.53
383	0.52
384	0.56
385	0.52
386	0.45
387	0.41
388	0.4
389	0.38
390	0.36
391	0.34
392	0.29
393	0.24
394	0.23
395	0.25
396	0.21
397	0.19
398	0.17
399	0.15
400	0.13
401	0.14
402	0.16
403	0.17
404	0.17
405	0.22
406	0.22
407	0.23
408	0.28
409	0.27
410	0.25
411	0.26
412	0.29
413	0.28
414	0.35
415	0.39
416	0.39
417	0.45
418	0.5
419	0.54
420	0.54
421	0.57
422	0.58
423	0.55
424	0.55
425	0.51
426	0.46
427	0.43
428	0.39
429	0.32
430	0.25
431	0.22
432	0.16
433	0.15
434	0.13
435	0.09
436	0.1
437	0.13
438	0.16
439	0.17
440	0.19
441	0.26
442	0.3

A0A642UWT9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer