Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642URD4

Protein Details
Accession A0A642URD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-332RRNISERRRKKIEERRRRRQENPFMRMEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
307-322ISERRRKKIEERRRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037818  TAF8  
IPR019473  TFIID_su8_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF10406  TAF8_C  
CDD cd08049  TAF8  
Amino Acid Sequences MQIPESELQKRAQQVAREEVISKVETDPGDEAVAFQLKKSIAVHLKSRGRSFFTQQFLDMLSCLATEYLHNLCVGLRADMELQRRHLPSLADIEVLFRCQGIRTLSIYEEASLTKKIYKYIKYDVDRISKEAQKIIMKLNDAEYQVDEGNPSYLFFTNECYEIASLVPSQTKRPSYIPEYFPELPPDYTFQHTPEYLNTITDLKRLRINLVEESRVAEKSLYNLIEDDNTEWKTQPEGELELSNSRPDTPSDHCFSLASSNFKEEKQEDLQSEGIEGNMLTSIDSLEGAVSSQNFDIVRYSALRRNISERRRKKIEERRRRRQENPFMRMEKYYSPYAAYNHTLETTAEFDEMVTAGFHQIIKQVRSHHASQRKQLDDIVKKKDQIVQQRQAERDKLDFAFNFSSNGYHSSDSEDEFADYFDNVRSATSNTQSAQFGTIGDGKPQSAEQSVLVGSYDNVTGSGEESTIEHKEATV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.51
3 0.51
4 0.48
5 0.45
6 0.39
7 0.37
8 0.31
9 0.27
10 0.2
11 0.21
12 0.19
13 0.2
14 0.2
15 0.18
16 0.18
17 0.16
18 0.16
19 0.15
20 0.2
21 0.17
22 0.15
23 0.19
24 0.18
25 0.21
26 0.21
27 0.27
28 0.29
29 0.34
30 0.4
31 0.45
32 0.53
33 0.56
34 0.6
35 0.56
36 0.55
37 0.55
38 0.57
39 0.55
40 0.53
41 0.49
42 0.45
43 0.41
44 0.36
45 0.32
46 0.25
47 0.17
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.15
66 0.19
67 0.25
68 0.24
69 0.27
70 0.32
71 0.33
72 0.33
73 0.33
74 0.3
75 0.27
76 0.3
77 0.28
78 0.22
79 0.21
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.16
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.13
88 0.13
89 0.15
90 0.16
91 0.19
92 0.19
93 0.21
94 0.21
95 0.18
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.21
104 0.27
105 0.32
106 0.36
107 0.43
108 0.52
109 0.51
110 0.57
111 0.58
112 0.6
113 0.56
114 0.53
115 0.51
116 0.46
117 0.44
118 0.39
119 0.38
120 0.33
121 0.33
122 0.35
123 0.32
124 0.29
125 0.29
126 0.3
127 0.28
128 0.26
129 0.24
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.15
134 0.13
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.11
155 0.11
156 0.14
157 0.19
158 0.2
159 0.22
160 0.24
161 0.29
162 0.32
163 0.38
164 0.38
165 0.35
166 0.41
167 0.4
168 0.38
169 0.36
170 0.32
171 0.26
172 0.24
173 0.24
174 0.18
175 0.2
176 0.2
177 0.17
178 0.18
179 0.18
180 0.18
181 0.16
182 0.18
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.17
189 0.18
190 0.15
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.22
196 0.24
197 0.25
198 0.25
199 0.22
200 0.23
201 0.23
202 0.2
203 0.18
204 0.12
205 0.09
206 0.1
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.12
236 0.15
237 0.19
238 0.22
239 0.22
240 0.22
241 0.21
242 0.21
243 0.23
244 0.21
245 0.2
246 0.17
247 0.2
248 0.21
249 0.21
250 0.24
251 0.19
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.22
256 0.23
257 0.24
258 0.21
259 0.2
260 0.15
261 0.11
262 0.08
263 0.07
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.14
288 0.17
289 0.22
290 0.24
291 0.24
292 0.31
293 0.39
294 0.47
295 0.55
296 0.58
297 0.62
298 0.67
299 0.71
300 0.74
301 0.76
302 0.78
303 0.79
304 0.82
305 0.84
306 0.88
307 0.91
308 0.89
309 0.89
310 0.89
311 0.88
312 0.84
313 0.81
314 0.73
315 0.67
316 0.59
317 0.51
318 0.45
319 0.38
320 0.33
321 0.26
322 0.24
323 0.24
324 0.25
325 0.26
326 0.24
327 0.21
328 0.2
329 0.19
330 0.18
331 0.16
332 0.16
333 0.14
334 0.12
335 0.11
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.11
348 0.15
349 0.17
350 0.2
351 0.24
352 0.3
353 0.35
354 0.39
355 0.44
356 0.5
357 0.54
358 0.59
359 0.64
360 0.61
361 0.57
362 0.57
363 0.58
364 0.57
365 0.59
366 0.59
367 0.53
368 0.52
369 0.53
370 0.54
371 0.52
372 0.53
373 0.56
374 0.57
375 0.61
376 0.66
377 0.69
378 0.68
379 0.66
380 0.58
381 0.5
382 0.45
383 0.38
384 0.37
385 0.33
386 0.32
387 0.32
388 0.29
389 0.28
390 0.24
391 0.23
392 0.19
393 0.21
394 0.19
395 0.16
396 0.16
397 0.2
398 0.21
399 0.22
400 0.22
401 0.2
402 0.18
403 0.17
404 0.17
405 0.12
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.1
413 0.13
414 0.18
415 0.21
416 0.24
417 0.24
418 0.28
419 0.28
420 0.27
421 0.26
422 0.21
423 0.18
424 0.18
425 0.22
426 0.19
427 0.22
428 0.22
429 0.2
430 0.21
431 0.21
432 0.21
433 0.17
434 0.17
435 0.15
436 0.16
437 0.16
438 0.15
439 0.14
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.12
454 0.14
455 0.15