Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642V5M6

Protein Details
Accession A0A642V5M6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-37SGANECTRKKHQGERHQNLETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 11.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50142  RNASE_3_2  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MDNNRSARAMKRPIPPSGANECTRKKHQGERHQNLETAAEPRPSAVPYPNAVSYPNAVPYSIADLPAADSVDGNFSQLHKAESMYLQLQTLYQSIDAFDVPDGDIESLNALRNFKSNIKYDFSFGKQFKNVTSGSTSQKDWDQIGGWDGIVKRLLEVVEEISNPEQAPLPIIPNSSVYVVDCSQEASDTKPIPPFLKASFGSYPEFTQNELRRKNFYAVSNPAFKREMHVQLLQTKNLHAFSVDFSPNGRLYALGCNGNAYVFNADSGNQVAKISSTGVISSISFSPDGKYLAMGGDSVKVWEFSDNELDSKSKFIWKMPYSDSNIKHNFSVAFIDGNRLVYGSSNNTITVRRLTLGIENSWPTVTGVNHVAVSTGKKYIAAGLMDGTVRVYKVNASYRECACFGDANGIPVYNVRFTNGDKHVLSCSGSTSKVWDLENYGNTQASQCKVAFVGHKTPTLSVCATQNSGLIVSCCESGEIILFHQKSGNVQLQLKGHDSRVRAIAVSPDSMANEVYFVSASMDGTTKLWRIMRFPKPVPWFDICNERLIMKTATHMVDGIDNSENPNNRRAEWSGNISTEYVLSKILQILYPGSSKSSLSQRCSYLLCNRQLAIISRMYGLPFDVNPEQEHVKFISETEKPHSDLVRAHFGYAYKLHYPYEYRLFEIFLKLFFPKIVQMEGNSEWKFVYKEAISSLEEHLSGRVRFEVVGRGDGYWCPHIVHCLVDNRVEAVVKACSEEDAKLKAADMVLKQRGLPILKGKRHVQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.65
3 0.62
4 0.61
5 0.61
6 0.56
7 0.59
8 0.6
9 0.61
10 0.65
11 0.66
12 0.64
13 0.67
14 0.72
15 0.75
16 0.8
17 0.82
18 0.83
19 0.78
20 0.74
21 0.64
22 0.56
23 0.47
24 0.39
25 0.33
26 0.26
27 0.22
28 0.22
29 0.23
30 0.22
31 0.23
32 0.24
33 0.25
34 0.26
35 0.3
36 0.31
37 0.3
38 0.29
39 0.28
40 0.27
41 0.25
42 0.27
43 0.23
44 0.21
45 0.2
46 0.2
47 0.25
48 0.23
49 0.21
50 0.16
51 0.15
52 0.17
53 0.18
54 0.17
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.15
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.21
71 0.19
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.12
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.15
99 0.18
100 0.22
101 0.26
102 0.31
103 0.33
104 0.36
105 0.41
106 0.41
107 0.42
108 0.43
109 0.42
110 0.45
111 0.41
112 0.43
113 0.41
114 0.41
115 0.39
116 0.39
117 0.35
118 0.29
119 0.32
120 0.29
121 0.32
122 0.33
123 0.33
124 0.3
125 0.33
126 0.32
127 0.28
128 0.25
129 0.2
130 0.18
131 0.2
132 0.18
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.14
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.1
154 0.13
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.16
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.16
175 0.18
176 0.2
177 0.22
178 0.24
179 0.24
180 0.26
181 0.26
182 0.22
183 0.27
184 0.25
185 0.27
186 0.28
187 0.29
188 0.29
189 0.27
190 0.27
191 0.24
192 0.24
193 0.21
194 0.27
195 0.32
196 0.38
197 0.44
198 0.45
199 0.46
200 0.48
201 0.51
202 0.47
203 0.44
204 0.42
205 0.43
206 0.44
207 0.49
208 0.46
209 0.45
210 0.41
211 0.37
212 0.34
213 0.34
214 0.36
215 0.31
216 0.34
217 0.33
218 0.4
219 0.43
220 0.4
221 0.34
222 0.3
223 0.28
224 0.25
225 0.22
226 0.14
227 0.12
228 0.12
229 0.17
230 0.17
231 0.14
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.15
237 0.09
238 0.1
239 0.15
240 0.17
241 0.16
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.1
248 0.09
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.16
303 0.24
304 0.25
305 0.29
306 0.32
307 0.37
308 0.39
309 0.46
310 0.46
311 0.45
312 0.47
313 0.43
314 0.39
315 0.34
316 0.28
317 0.21
318 0.2
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.13
349 0.12
350 0.09
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.08
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.05
380 0.09
381 0.15
382 0.19
383 0.22
384 0.26
385 0.27
386 0.29
387 0.28
388 0.25
389 0.2
390 0.17
391 0.14
392 0.16
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.13
397 0.11
398 0.12
399 0.12
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.1
404 0.1
405 0.18
406 0.19
407 0.22
408 0.2
409 0.22
410 0.21
411 0.21
412 0.21
413 0.14
414 0.14
415 0.12
416 0.12
417 0.11
418 0.12
419 0.13
420 0.15
421 0.15
422 0.13
423 0.15
424 0.18
425 0.19
426 0.18
427 0.18
428 0.15
429 0.15
430 0.16
431 0.14
432 0.12
433 0.13
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.14
438 0.16
439 0.17
440 0.24
441 0.23
442 0.25
443 0.25
444 0.25
445 0.24
446 0.24
447 0.21
448 0.15
449 0.15
450 0.14
451 0.15
452 0.14
453 0.14
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.13
472 0.13
473 0.13
474 0.18
475 0.22
476 0.19
477 0.21
478 0.24
479 0.25
480 0.27
481 0.29
482 0.26
483 0.24
484 0.24
485 0.24
486 0.23
487 0.24
488 0.22
489 0.19
490 0.18
491 0.2
492 0.17
493 0.17
494 0.15
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.12
499 0.08
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.12
515 0.15
516 0.15
517 0.2
518 0.29
519 0.37
520 0.43
521 0.45
522 0.51
523 0.54
524 0.55
525 0.55
526 0.49
527 0.44
528 0.38
529 0.45
530 0.37
531 0.34
532 0.32
533 0.27
534 0.24
535 0.24
536 0.24
537 0.14
538 0.16
539 0.17
540 0.17
541 0.17
542 0.16
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.15
547 0.12
548 0.11
549 0.13
550 0.17
551 0.2
552 0.19
553 0.26
554 0.25
555 0.24
556 0.29
557 0.29
558 0.32
559 0.32
560 0.37
561 0.34
562 0.34
563 0.34
564 0.3
565 0.27
566 0.22
567 0.19
568 0.12
569 0.1
570 0.09
571 0.09
572 0.1
573 0.11
574 0.1
575 0.11
576 0.11
577 0.13
578 0.14
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.17
584 0.25
585 0.29
586 0.33
587 0.38
588 0.38
589 0.4
590 0.41
591 0.42
592 0.42
593 0.43
594 0.43
595 0.41
596 0.39
597 0.38
598 0.38
599 0.37
600 0.31
601 0.25
602 0.21
603 0.2
604 0.2
605 0.19
606 0.17
607 0.14
608 0.12
609 0.1
610 0.15
611 0.16
612 0.17
613 0.17
614 0.2
615 0.23
616 0.21
617 0.24
618 0.19
619 0.19
620 0.18
621 0.18
622 0.22
623 0.21
624 0.23
625 0.28
626 0.3
627 0.3
628 0.33
629 0.34
630 0.3
631 0.32
632 0.34
633 0.38
634 0.35
635 0.33
636 0.32
637 0.31
638 0.32
639 0.3
640 0.29
641 0.23
642 0.24
643 0.24
644 0.25
645 0.29
646 0.3
647 0.37
648 0.34
649 0.33
650 0.33
651 0.34
652 0.32
653 0.34
654 0.29
655 0.2
656 0.21
657 0.19
658 0.19
659 0.17
660 0.17
661 0.16
662 0.17
663 0.2
664 0.19
665 0.2
666 0.24
667 0.27
668 0.34
669 0.3
670 0.28
671 0.25
672 0.26
673 0.25
674 0.2
675 0.24
676 0.17
677 0.18
678 0.2
679 0.24
680 0.23
681 0.24
682 0.26
683 0.21
684 0.21
685 0.2
686 0.2
687 0.21
688 0.21
689 0.2
690 0.19
691 0.18
692 0.18
693 0.19
694 0.24
695 0.21
696 0.25
697 0.24
698 0.23
699 0.24
700 0.25
701 0.28
702 0.22
703 0.21
704 0.19
705 0.19
706 0.22
707 0.21
708 0.23
709 0.24
710 0.28
711 0.29
712 0.31
713 0.31
714 0.28
715 0.29
716 0.26
717 0.22
718 0.17
719 0.18
720 0.15
721 0.16
722 0.15
723 0.15
724 0.17
725 0.19
726 0.21
727 0.22
728 0.23
729 0.22
730 0.22
731 0.22
732 0.22
733 0.24
734 0.25
735 0.31
736 0.34
737 0.35
738 0.34
739 0.35
740 0.4
741 0.37
742 0.37
743 0.39
744 0.44
745 0.5
746 0.57