Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PDX4

Protein Details
Accession F4PDX4    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-37SSTKHIQCTCNRQRNSKTNSFKILSHydrophilic
430-454KQNPEEAKKYKQKATKRKSEMCLILHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006597  Sel1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0036503  P:ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF08238  Sel1  
Amino Acid Sequences MHRRPFTVTVAGSSTKHIQCTCNRQRNSKTNSFKILSNITHVSIQHSYSTRSTRTNPVAGNPTHSGMGGIFSKVSDGMNPSDFNSPLETHSIPMDLSDGVEHDLKTLKVSSILPNDYFLSGMFKKGRFNLQPKKLRQLTQLIIDECSKRSPEDLSTMITEKFPDAQPKDLYVLIGVLQKHSTPGEKLAFALSKVCMHRGDMDAELKYAAMLMTGVYGVKRDQELGMKHLRSLADRKHGPALYMLAMRAIQAQHKTEATGYWLSTSSAFVVQDLPRALKYLTLAHEQGTVEATYLLGSMYLKGRGTFDKRPDVQKAHTLYLEAAGKGLAIAQHDLASMYYEGTSGIDRNVPLGLEYWTMAAEGGFALSQMNIAKARITGLEIAGPGGGNYEKDWVLAREMLERALESSDKVNPALAQDVKQLIEDLDELEKQNPEEAKKYKQKATKRKSEMCLIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.31
3 0.35
4 0.34
5 0.37
6 0.42
7 0.53
8 0.6
9 0.62
10 0.66
11 0.71
12 0.79
13 0.82
14 0.83
15 0.83
16 0.81
17 0.79
18 0.82
19 0.74
20 0.67
21 0.62
22 0.6
23 0.51
24 0.47
25 0.42
26 0.35
27 0.36
28 0.33
29 0.33
30 0.28
31 0.27
32 0.27
33 0.26
34 0.28
35 0.3
36 0.36
37 0.34
38 0.37
39 0.41
40 0.45
41 0.49
42 0.51
43 0.48
44 0.48
45 0.53
46 0.48
47 0.49
48 0.42
49 0.38
50 0.32
51 0.3
52 0.24
53 0.16
54 0.19
55 0.14
56 0.12
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.09
63 0.11
64 0.13
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.21
69 0.22
70 0.21
71 0.21
72 0.2
73 0.18
74 0.22
75 0.21
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.12
95 0.14
96 0.16
97 0.21
98 0.25
99 0.28
100 0.27
101 0.27
102 0.28
103 0.25
104 0.23
105 0.17
106 0.17
107 0.15
108 0.19
109 0.21
110 0.21
111 0.24
112 0.27
113 0.36
114 0.37
115 0.47
116 0.53
117 0.59
118 0.67
119 0.68
120 0.75
121 0.72
122 0.68
123 0.64
124 0.61
125 0.54
126 0.52
127 0.53
128 0.43
129 0.39
130 0.38
131 0.34
132 0.27
133 0.26
134 0.2
135 0.15
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.18
140 0.19
141 0.18
142 0.2
143 0.21
144 0.2
145 0.18
146 0.16
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.2
151 0.2
152 0.24
153 0.25
154 0.26
155 0.27
156 0.25
157 0.23
158 0.15
159 0.14
160 0.1
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.1
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.17
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.12
179 0.14
180 0.14
181 0.16
182 0.14
183 0.14
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.16
188 0.17
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.09
194 0.08
195 0.05
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.11
210 0.12
211 0.16
212 0.22
213 0.21
214 0.21
215 0.23
216 0.22
217 0.2
218 0.24
219 0.24
220 0.27
221 0.28
222 0.29
223 0.32
224 0.32
225 0.3
226 0.26
227 0.23
228 0.17
229 0.17
230 0.15
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.11
257 0.1
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.15
268 0.18
269 0.18
270 0.17
271 0.2
272 0.19
273 0.18
274 0.15
275 0.12
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.12
290 0.17
291 0.23
292 0.28
293 0.33
294 0.4
295 0.44
296 0.49
297 0.53
298 0.52
299 0.49
300 0.5
301 0.48
302 0.42
303 0.38
304 0.34
305 0.27
306 0.27
307 0.26
308 0.18
309 0.14
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.14
380 0.13
381 0.16
382 0.18
383 0.18
384 0.2
385 0.2
386 0.21
387 0.19
388 0.18
389 0.16
390 0.17
391 0.16
392 0.13
393 0.15
394 0.18
395 0.19
396 0.19
397 0.19
398 0.18
399 0.19
400 0.24
401 0.24
402 0.21
403 0.24
404 0.26
405 0.25
406 0.25
407 0.24
408 0.17
409 0.16
410 0.15
411 0.13
412 0.13
413 0.14
414 0.16
415 0.18
416 0.19
417 0.18
418 0.23
419 0.26
420 0.27
421 0.34
422 0.37
423 0.45
424 0.53
425 0.61
426 0.64
427 0.69
428 0.76
429 0.79
430 0.84
431 0.85
432 0.85
433 0.87
434 0.85