Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UT52

Protein Details
Accession A0A642UT52    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-193ATAPPPQPVKPKPKPNPFGEHydrophilic
390-414ISADKNRRRGDRRGGSRRSRGNRDRBasic
442-472QSSSSSHSRDHRSRRRRDERKRSDKSGVKSSBasic
511-533GEGSGRRSRRGGKRRTQGSNAEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-242RR
394-412KNRRRGDRRGGSRRSRGNR
451-466DHRSRRRRDERKRSDK
504-529GSLDKKEGEGSGRRSRRGGKRRTQGS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MASIAVRIGGSGGGYGGHRGGFQGYSGGSVPSSIQGPPFIVKLLQLPSDANDTFIEDLFKSRYTPVVKVKVVYDPSSSPLTSNVIRKVAFVELRSAADYQKVLKWHDCYYQPGKRVMIDPANFNDFQDTMRFNSDHADELSSLSQKVASNSNRWERAGSLGHQAPVQNRRLSTATAPPPQPVKPKPKPNPFGEAKPVDTLTKEKEIQKRLIKVNETTTLTVGEGEDPKEILRNYQERWRGRRGSERRGSIAILKRDGQRSLSKHPSHTGNNKSQQSSSEQGPDSLPSIQKESITLSEDHNPVVDSENSVHGKSLECGEYDNLTKSHSRESDKEAQEKRSSIPKVDNSVESTSISEALTSPKNDPPDQLTGNDAKAPHSSKGSLAGTNTEISADKNRRRGDRRGGSRRSRGNRDRVNEKSQDSVKERTSTERTTSDDQPKKEQSSSSSHSRDHRSRRRRDERKRSDKSGVKSSADQTTKPAAKSVSDSDIVRDTNARTTEGSRRGSLDKKEGEGSGRRSRRGGKRRTQGSNAEERKDGRDKEESHKATSNATTNPQVGPLIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.11
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.11
19 0.13
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.15
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.14
28 0.15
29 0.18
30 0.2
31 0.2
32 0.19
33 0.19
34 0.2
35 0.26
36 0.25
37 0.22
38 0.19
39 0.19
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.13
44 0.16
45 0.16
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.23
50 0.25
51 0.31
52 0.38
53 0.44
54 0.45
55 0.46
56 0.47
57 0.48
58 0.48
59 0.43
60 0.38
61 0.3
62 0.32
63 0.33
64 0.31
65 0.24
66 0.22
67 0.24
68 0.25
69 0.29
70 0.3
71 0.31
72 0.31
73 0.31
74 0.31
75 0.33
76 0.31
77 0.27
78 0.26
79 0.24
80 0.25
81 0.26
82 0.25
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.17
87 0.18
88 0.21
89 0.23
90 0.27
91 0.3
92 0.32
93 0.37
94 0.37
95 0.42
96 0.47
97 0.5
98 0.5
99 0.5
100 0.48
101 0.44
102 0.44
103 0.42
104 0.41
105 0.36
106 0.36
107 0.35
108 0.38
109 0.35
110 0.33
111 0.29
112 0.21
113 0.2
114 0.19
115 0.17
116 0.14
117 0.19
118 0.19
119 0.17
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.19
124 0.19
125 0.15
126 0.17
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.13
131 0.14
132 0.13
133 0.15
134 0.21
135 0.22
136 0.27
137 0.34
138 0.42
139 0.42
140 0.42
141 0.41
142 0.34
143 0.36
144 0.34
145 0.29
146 0.28
147 0.26
148 0.27
149 0.27
150 0.27
151 0.27
152 0.31
153 0.34
154 0.3
155 0.28
156 0.31
157 0.31
158 0.31
159 0.29
160 0.31
161 0.33
162 0.36
163 0.37
164 0.36
165 0.37
166 0.39
167 0.44
168 0.43
169 0.47
170 0.51
171 0.61
172 0.69
173 0.76
174 0.8
175 0.76
176 0.78
177 0.71
178 0.67
179 0.64
180 0.57
181 0.48
182 0.42
183 0.39
184 0.3
185 0.27
186 0.24
187 0.2
188 0.22
189 0.24
190 0.29
191 0.35
192 0.39
193 0.46
194 0.49
195 0.53
196 0.54
197 0.56
198 0.53
199 0.48
200 0.48
201 0.46
202 0.42
203 0.35
204 0.3
205 0.24
206 0.21
207 0.18
208 0.14
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.15
219 0.18
220 0.2
221 0.27
222 0.35
223 0.38
224 0.44
225 0.5
226 0.49
227 0.49
228 0.58
229 0.58
230 0.61
231 0.62
232 0.59
233 0.54
234 0.5
235 0.48
236 0.44
237 0.42
238 0.35
239 0.3
240 0.3
241 0.31
242 0.32
243 0.32
244 0.28
245 0.28
246 0.29
247 0.35
248 0.41
249 0.4
250 0.39
251 0.42
252 0.44
253 0.44
254 0.48
255 0.47
256 0.46
257 0.52
258 0.53
259 0.51
260 0.46
261 0.42
262 0.38
263 0.34
264 0.28
265 0.25
266 0.21
267 0.21
268 0.21
269 0.19
270 0.16
271 0.15
272 0.15
273 0.11
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.18
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.15
288 0.13
289 0.14
290 0.12
291 0.08
292 0.09
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.14
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.11
309 0.12
310 0.14
311 0.14
312 0.19
313 0.22
314 0.25
315 0.26
316 0.33
317 0.41
318 0.44
319 0.51
320 0.49
321 0.5
322 0.49
323 0.47
324 0.42
325 0.41
326 0.38
327 0.32
328 0.35
329 0.34
330 0.37
331 0.37
332 0.37
333 0.32
334 0.32
335 0.3
336 0.24
337 0.2
338 0.15
339 0.14
340 0.12
341 0.09
342 0.08
343 0.1
344 0.12
345 0.13
346 0.15
347 0.17
348 0.21
349 0.22
350 0.23
351 0.24
352 0.27
353 0.27
354 0.25
355 0.26
356 0.24
357 0.24
358 0.24
359 0.2
360 0.16
361 0.19
362 0.21
363 0.19
364 0.19
365 0.19
366 0.18
367 0.24
368 0.24
369 0.22
370 0.2
371 0.2
372 0.19
373 0.19
374 0.18
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.19
379 0.25
380 0.28
381 0.36
382 0.41
383 0.49
384 0.55
385 0.61
386 0.64
387 0.66
388 0.73
389 0.76
390 0.8
391 0.8
392 0.83
393 0.84
394 0.82
395 0.82
396 0.79
397 0.79
398 0.78
399 0.75
400 0.76
401 0.73
402 0.72
403 0.66
404 0.6
405 0.56
406 0.52
407 0.53
408 0.48
409 0.47
410 0.43
411 0.43
412 0.42
413 0.42
414 0.44
415 0.4
416 0.4
417 0.38
418 0.4
419 0.4
420 0.47
421 0.51
422 0.52
423 0.51
424 0.55
425 0.58
426 0.57
427 0.55
428 0.49
429 0.43
430 0.45
431 0.47
432 0.48
433 0.47
434 0.47
435 0.51
436 0.57
437 0.62
438 0.65
439 0.7
440 0.71
441 0.77
442 0.85
443 0.89
444 0.91
445 0.94
446 0.94
447 0.95
448 0.95
449 0.94
450 0.9
451 0.89
452 0.85
453 0.8
454 0.79
455 0.74
456 0.66
457 0.61
458 0.57
459 0.56
460 0.51
461 0.45
462 0.39
463 0.42
464 0.43
465 0.39
466 0.39
467 0.31
468 0.31
469 0.34
470 0.34
471 0.3
472 0.29
473 0.28
474 0.28
475 0.31
476 0.29
477 0.26
478 0.24
479 0.21
480 0.25
481 0.26
482 0.25
483 0.22
484 0.27
485 0.35
486 0.4
487 0.42
488 0.37
489 0.39
490 0.44
491 0.49
492 0.5
493 0.5
494 0.46
495 0.46
496 0.47
497 0.45
498 0.45
499 0.45
500 0.47
501 0.48
502 0.5
503 0.5
504 0.52
505 0.6
506 0.65
507 0.68
508 0.72
509 0.71
510 0.76
511 0.83
512 0.87
513 0.84
514 0.82
515 0.8
516 0.8
517 0.76
518 0.69
519 0.64
520 0.57
521 0.57
522 0.57
523 0.52
524 0.46
525 0.49
526 0.5
527 0.54
528 0.63
529 0.59
530 0.57
531 0.6
532 0.55
533 0.52
534 0.52
535 0.49
536 0.42
537 0.44
538 0.43
539 0.39
540 0.38
541 0.35