Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UZN6

Protein Details
Accession A0A642UZN6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-54PEPTQKSRSSTPKIKIKPPKPEPEPEDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-87SSTPKIKIKPPKPEPEPEDVKTPKKIKLSLGAKNSKKSVDVKPARSVPRVRIK
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 11.999, nucl 9.5, cyto_mito 8.999, mito_nucl 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MALKLKLSVGGSGGSGSSQTPKTSGSPEPTQKSRSSTPKIKIKPPKPEPEPEDVKTPKKIKLSLGAKNSKKSVDVKPARSVPRVRIKPTRVPGEGYDSEAPDIEDDPLIEQGMMIRFLDDTNLDFVHSACESGDYTGLNIKWISKDKAVVNVNGTLYSARVIDLPTVTEVFKTTDRKNIFKTLDISQMLLVIKKVDPEKLRKDKDFEVPQEKLYHHPLYKMAQNKEFKENRYVWRDGLLPPFEDVFRRFRPRKLNHRVMDSVDARVNELIKRDEDAEESAFEIVDPKKMNAGAPGTPGVIGTPTGLSSSNTPRAWGNGGQLSGTPSAAGTPAPPFADDLDEFEGVNLEEELNKVLDGSVGDDLFGGIAIEREEGDEDDGEEDAAEEPDEPEDDDDSDDDDDEDDDDDQHLKMLNEEIADLEKAVESNKRHLDSASSRMMRMKFQTSYNSLRQSLDQKKRALAKLLEEQRKSDPTSQQGASASAAAAAAAAGVATAGVDADGDDEEDDDDGDDDAEDGDDAEDGDDGDNGDDGETPAANGDDDDDIELDEDNDIDDLFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.13
5 0.15
6 0.15
7 0.16
8 0.19
9 0.22
10 0.26
11 0.31
12 0.33
13 0.41
14 0.49
15 0.55
16 0.59
17 0.6
18 0.59
19 0.6
20 0.62
21 0.62
22 0.63
23 0.65
24 0.68
25 0.74
26 0.78
27 0.81
28 0.83
29 0.83
30 0.84
31 0.85
32 0.86
33 0.82
34 0.85
35 0.81
36 0.79
37 0.77
38 0.69
39 0.68
40 0.64
41 0.62
42 0.61
43 0.6
44 0.57
45 0.56
46 0.58
47 0.53
48 0.58
49 0.61
50 0.6
51 0.65
52 0.69
53 0.67
54 0.69
55 0.67
56 0.59
57 0.55
58 0.53
59 0.51
60 0.52
61 0.56
62 0.56
63 0.61
64 0.67
65 0.68
66 0.69
67 0.65
68 0.63
69 0.65
70 0.67
71 0.65
72 0.67
73 0.69
74 0.71
75 0.75
76 0.74
77 0.65
78 0.62
79 0.57
80 0.56
81 0.5
82 0.45
83 0.39
84 0.31
85 0.29
86 0.26
87 0.23
88 0.15
89 0.15
90 0.11
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.08
122 0.09
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.17
129 0.22
130 0.25
131 0.23
132 0.28
133 0.28
134 0.36
135 0.38
136 0.35
137 0.33
138 0.32
139 0.31
140 0.26
141 0.24
142 0.16
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.15
159 0.2
160 0.2
161 0.28
162 0.32
163 0.35
164 0.38
165 0.44
166 0.41
167 0.4
168 0.42
169 0.37
170 0.4
171 0.36
172 0.33
173 0.24
174 0.25
175 0.22
176 0.19
177 0.16
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.14
182 0.17
183 0.21
184 0.28
185 0.38
186 0.47
187 0.53
188 0.52
189 0.56
190 0.55
191 0.6
192 0.6
193 0.56
194 0.54
195 0.49
196 0.48
197 0.46
198 0.42
199 0.37
200 0.35
201 0.33
202 0.27
203 0.27
204 0.28
205 0.27
206 0.32
207 0.36
208 0.34
209 0.36
210 0.41
211 0.42
212 0.49
213 0.5
214 0.47
215 0.47
216 0.48
217 0.47
218 0.48
219 0.47
220 0.38
221 0.36
222 0.35
223 0.31
224 0.31
225 0.26
226 0.2
227 0.19
228 0.19
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.21
234 0.29
235 0.31
236 0.36
237 0.46
238 0.53
239 0.62
240 0.67
241 0.72
242 0.67
243 0.7
244 0.66
245 0.58
246 0.56
247 0.45
248 0.37
249 0.29
250 0.25
251 0.2
252 0.18
253 0.17
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.08
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.08
295 0.13
296 0.19
297 0.19
298 0.2
299 0.19
300 0.2
301 0.23
302 0.21
303 0.2
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.11
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.11
324 0.1
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.09
332 0.09
333 0.07
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.05
352 0.04
353 0.02
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.07
395 0.08
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.13
412 0.14
413 0.21
414 0.28
415 0.29
416 0.3
417 0.3
418 0.36
419 0.35
420 0.39
421 0.41
422 0.36
423 0.35
424 0.4
425 0.41
426 0.38
427 0.37
428 0.37
429 0.31
430 0.33
431 0.39
432 0.39
433 0.45
434 0.47
435 0.49
436 0.44
437 0.43
438 0.43
439 0.46
440 0.51
441 0.54
442 0.54
443 0.52
444 0.56
445 0.63
446 0.63
447 0.61
448 0.53
449 0.49
450 0.53
451 0.59
452 0.62
453 0.55
454 0.54
455 0.52
456 0.54
457 0.51
458 0.48
459 0.45
460 0.42
461 0.48
462 0.45
463 0.43
464 0.4
465 0.37
466 0.31
467 0.25
468 0.19
469 0.12
470 0.12
471 0.08
472 0.07
473 0.05
474 0.04
475 0.03
476 0.03
477 0.02
478 0.02
479 0.02
480 0.02
481 0.02
482 0.02
483 0.02
484 0.02
485 0.02
486 0.04
487 0.04
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.1
533 0.1
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.06
538 0.06