Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UM77

Protein Details
Accession A0A642UM77    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-68DADADGKGKKPRKKRAPRDPDAPKKPVBasic
177-218PKQEPAVETKEKKKKRKSEDKSKKTDDKPKKKSKKKKSEKSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-67KGKKPRKKRAPRDPDAPKK
187-219KEKKKKRKSEDKSKKTDDKPKKKSKKKKSEKSE
Subcellular Location(s) cyto_mito 10.333, cyto 9, cyto_nucl 8.999, mito 8.5, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPSPTPFRRWRGCLPPXTSAGVFATLNGTVAPAADVDPTASQDADADGKGKKPRKKRAPRDPDAPKKPVTSFFLYRDAVRDQLMKDNLTEDGVPMTNVEFTKLVSEKWMGEPEDVKAKYKEEYTQKWSQYQKELEAYKHKKALEAGDADADAPEVVEVEESVTEVAAPEDDDESAEEPKQEPAVETKEKKKKRKSEDKSKKTDDKPKKKSKKKKSEKSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.67
3 0.62
4 0.57
5 0.49
6 0.39
7 0.33
8 0.25
9 0.19
10 0.15
11 0.12
12 0.1
13 0.09
14 0.09
15 0.07
16 0.07
17 0.06
18 0.05
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.15
35 0.23
36 0.31
37 0.37
38 0.46
39 0.57
40 0.67
41 0.77
42 0.83
43 0.87
44 0.9
45 0.9
46 0.9
47 0.9
48 0.9
49 0.86
50 0.79
51 0.71
52 0.63
53 0.58
54 0.52
55 0.47
56 0.42
57 0.38
58 0.37
59 0.4
60 0.38
61 0.36
62 0.34
63 0.3
64 0.25
65 0.21
66 0.2
67 0.15
68 0.21
69 0.22
70 0.2
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.11
92 0.1
93 0.12
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.2
100 0.19
101 0.19
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.25
107 0.24
108 0.29
109 0.34
110 0.4
111 0.41
112 0.46
113 0.49
114 0.46
115 0.46
116 0.43
117 0.39
118 0.38
119 0.39
120 0.36
121 0.42
122 0.44
123 0.41
124 0.44
125 0.41
126 0.37
127 0.36
128 0.36
129 0.3
130 0.28
131 0.24
132 0.2
133 0.2
134 0.18
135 0.15
136 0.12
137 0.07
138 0.05
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.16
169 0.22
170 0.3
171 0.35
172 0.44
173 0.53
174 0.63
175 0.72
176 0.77
177 0.81
178 0.83
179 0.89
180 0.9
181 0.91
182 0.93
183 0.93
184 0.93
185 0.93
186 0.92
187 0.9
188 0.9
189 0.9
190 0.9
191 0.9
192 0.91
193 0.93
194 0.94
195 0.95
196 0.96
197 0.96
198 0.96