Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UX01

Protein Details
Accession A0A642UX01    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-124SFKNKDSQQKTIKRNVRRARPDSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-176KAKATKRR
415-415K
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MDDEEHTRPVEETVLKEEEEASVDPPQVDEAEEDLIEDARREADELDANDNAEGAEGAEGAEGTEGTEGTEGTEGTEGAEDEEALLNEDVAVEDDVYSLPSFKNKDSQQKTIKRNVRRARPDSNSHSPVPMEAAPPSYEQTPAYEEYSNEDPETRKRRELEAKMDAAVKAKATKRRKVDYDDIERMQDDKIDLLKQQMVYAATVDVEKNGRGEIATEKLKLLPEVIDILSRADLAISVLDNNLLDAVRQWLEPLPDASMPAYQIQKELITALESMPIKTDHLVASGIGKVLVFYQRSKRTEASLKRIVDRLISDWTRPILNKSDSYKDRTIAFSAYDKKRYANQLSSQRVKSKEAKTLYEVNAERRNRAAIPSARTTAYKIAPQVDRDSLRTNRNQSDERFKSIQSKMTNMGRRKATKKAGPSIEGKGLNM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.26
4 0.25
5 0.21
6 0.21
7 0.19
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.17
12 0.16
13 0.16
14 0.14
15 0.14
16 0.12
17 0.11
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.17
32 0.18
33 0.21
34 0.2
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.15
39 0.11
40 0.09
41 0.05
42 0.05
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.04
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.04
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.11
88 0.14
89 0.15
90 0.23
91 0.28
92 0.39
93 0.45
94 0.54
95 0.6
96 0.67
97 0.73
98 0.75
99 0.78
100 0.76
101 0.8
102 0.8
103 0.81
104 0.81
105 0.81
106 0.8
107 0.78
108 0.77
109 0.75
110 0.75
111 0.69
112 0.6
113 0.55
114 0.45
115 0.39
116 0.33
117 0.26
118 0.18
119 0.14
120 0.15
121 0.14
122 0.15
123 0.16
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.19
134 0.22
135 0.21
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.24
140 0.32
141 0.32
142 0.34
143 0.35
144 0.42
145 0.5
146 0.55
147 0.55
148 0.53
149 0.51
150 0.48
151 0.47
152 0.4
153 0.32
154 0.26
155 0.18
156 0.17
157 0.2
158 0.28
159 0.34
160 0.41
161 0.46
162 0.53
163 0.57
164 0.59
165 0.63
166 0.62
167 0.64
168 0.63
169 0.56
170 0.5
171 0.45
172 0.39
173 0.3
174 0.22
175 0.13
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.11
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.13
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.11
279 0.11
280 0.14
281 0.22
282 0.31
283 0.33
284 0.37
285 0.37
286 0.39
287 0.48
288 0.52
289 0.52
290 0.52
291 0.52
292 0.51
293 0.52
294 0.47
295 0.39
296 0.34
297 0.28
298 0.27
299 0.26
300 0.24
301 0.24
302 0.24
303 0.24
304 0.23
305 0.24
306 0.24
307 0.26
308 0.31
309 0.34
310 0.42
311 0.43
312 0.49
313 0.49
314 0.44
315 0.43
316 0.39
317 0.37
318 0.29
319 0.27
320 0.26
321 0.33
322 0.36
323 0.39
324 0.38
325 0.38
326 0.43
327 0.49
328 0.5
329 0.49
330 0.51
331 0.56
332 0.64
333 0.69
334 0.68
335 0.66
336 0.62
337 0.61
338 0.62
339 0.57
340 0.57
341 0.54
342 0.54
343 0.52
344 0.57
345 0.53
346 0.53
347 0.49
348 0.47
349 0.51
350 0.49
351 0.46
352 0.39
353 0.41
354 0.33
355 0.34
356 0.36
357 0.33
358 0.38
359 0.42
360 0.42
361 0.41
362 0.4
363 0.4
364 0.37
365 0.34
366 0.32
367 0.3
368 0.34
369 0.36
370 0.39
371 0.41
372 0.42
373 0.41
374 0.41
375 0.45
376 0.44
377 0.49
378 0.53
379 0.56
380 0.56
381 0.6
382 0.62
383 0.61
384 0.66
385 0.63
386 0.62
387 0.58
388 0.53
389 0.55
390 0.54
391 0.55
392 0.48
393 0.48
394 0.48
395 0.54
396 0.61
397 0.58
398 0.62
399 0.63
400 0.68
401 0.68
402 0.71
403 0.71
404 0.7
405 0.74
406 0.76
407 0.74
408 0.7
409 0.7
410 0.67
411 0.65