FuNGI

A0A642UJB4

Protein Details

Accession

A0A642UJB4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
500-524	NYLKAERKHSKKVRSSKQWRKLLSN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
506-516	RKHSKKVRSSK

Subcellular Location(s)

mito 16, cyto 4, extr 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLSHTTQRAVRTLRTPLRVLATSTAPPSVGGSSAPPVSPFLEDLARRRAPRAPARALDLTETSFRGIDAAAIPQLSAHDREQSWSSSYDPVVRLPYARDVSHLASLLDALIQSKNFARAESILHSLHSLDTPQGFVHHVNSYLAGWSDDEAVTVKMVEQWLASALAKYPGLELSDRTHAIVLAKYVRDKVDFDPFLARFPPHQLKSIFSNIDILGIDDLTVVFASDRITDKHVPEDLRGLIGSATTPATAQSAGGESSSEASSEVPEYFRSDAAKAPSVRKDLDELRDVGSFGIKVIRHTLLGLKQDDAELESLLNAIETGVDGSVLTQGNSVDFFQIYRQLKTPEQRQKFNDALNAYNQHRQQQLELRGLDGAREKWKHAFEDMQRRGTINMSKDINSELFKWYQAMLPSVVHEAQLCRDLMEGKVDMASLSEEEQQQMAHREHYAPYFVLVAPEKLCVITILELIRLNSTGGVADGMRAARALLSVGRSVELEYRSQNYLKAERKHSKKVRSSKQWRKLLSNSTQAQDPQSSSEWSENVLGKLGSVLTSYLISVAKVNVKAKDPATGKVIKASQPVFHHTYQHCGGQRVGVIKIHREVMKRLAGDELSACIQPQLLPMLVPPKPWTSYSGGGFLFTNSQVVRNKDSPETLAYLKAASDQGKLTQVYHGLNVLGDTAWTINKRLFEVVTHYWNTGESFSSIPQVVVEPKLPPKPPVDAEPQTKFEYARDVRDILNEAAGLRSQRCDTNYKLEIARAFIGEKMHFPHNLDFRGRAYPLSPHLNHLGNDLVRSLFLFWDGKQLGEQGLRWLKIHLANVYGFDKAPLDERAQFGDKHLEDIRASARDPLAPDAWWRKAEKPWQALSVCFELAEAYELDDPTTYVSHLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDVEGAKQVNLLPADRPQDVYKFVANLVQKRVDADAAAGVDEAVKVQNYVTRKVVKQTVMTNVYGVTFVGAVAQIQKQLMALDFPREEANRLSKYLTQQVFASIRELFEGAHLIQDWLGEVARRITKSIRVDYEDTASEDPAKPNHLSSVIWTTPLGLPCVQPYRVAKNKTIKTNLQDITLADPFGAGQVDSRKQQTAFPPNFVHSLDATHMLLTAKACGDHGLSFAAVHDSYWTHACAVDTMNREIRSQFINLHSADLVAQLREEFCKRYKGFLQVVNLPSDHAVVKQVKQIRKQWAAKAGRPVTVADEVYMERKRQSLLESEDPEVRQVGRSMVTTVSVTEGLHLEDAAVKTVGTKILVPLVFPEIPAKGDFDLNQVAQSSYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.55
3	0.51
4	0.53
5	0.5
6	0.46
7	0.4
8	0.36
9	0.34
10	0.33
11	0.3
12	0.24
13	0.22
14	0.21
15	0.18
16	0.15
17	0.12
18	0.13
19	0.15
20	0.17
21	0.17
22	0.16
23	0.17
24	0.18
25	0.18
26	0.17
27	0.16
28	0.21
29	0.24
30	0.28
31	0.35
32	0.4
33	0.4
34	0.42
35	0.46
36	0.49
37	0.56
38	0.6
39	0.6
40	0.58
41	0.63
42	0.64
43	0.59
44	0.53
45	0.45
46	0.39
47	0.32
48	0.29
49	0.24
50	0.19
51	0.18
52	0.15
53	0.13
54	0.12
55	0.1
56	0.12
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.11
61	0.13
62	0.14
63	0.16
64	0.15
65	0.2
66	0.21
67	0.25
68	0.27
69	0.28
70	0.28
71	0.26
72	0.27
73	0.25
74	0.26
75	0.29
76	0.27
77	0.27
78	0.29
79	0.28
80	0.28
81	0.27
82	0.33
83	0.32
84	0.31
85	0.3
86	0.3
87	0.32
88	0.34
89	0.32
90	0.23
91	0.19
92	0.19
93	0.16
94	0.12
95	0.1
96	0.08
97	0.09
98	0.09
99	0.11
100	0.12
101	0.18
102	0.18
103	0.18
104	0.2
105	0.19
106	0.23
107	0.25
108	0.28
109	0.23
110	0.23
111	0.23
112	0.21
113	0.2
114	0.17
115	0.14
116	0.12
117	0.13
118	0.13
119	0.13
120	0.14
121	0.15
122	0.15
123	0.17
124	0.17
125	0.18
126	0.17
127	0.18
128	0.17
129	0.16
130	0.16
131	0.13
132	0.11
133	0.11
134	0.12
135	0.11
136	0.11
137	0.11
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.09
142	0.09
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.12
149	0.12
150	0.1
151	0.11
152	0.13
153	0.14
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.14
158	0.14
159	0.15
160	0.17
161	0.22
162	0.22
163	0.22
164	0.21
165	0.2
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.19
170	0.21
171	0.22
172	0.25
173	0.26
174	0.26
175	0.27
176	0.28
177	0.33
178	0.31
179	0.31
180	0.36
181	0.34
182	0.35
183	0.34
184	0.31
185	0.23
186	0.31
187	0.38
188	0.33
189	0.39
190	0.38
191	0.39
192	0.43
193	0.49
194	0.42
195	0.33
196	0.34
197	0.27
198	0.28
199	0.24
200	0.19
201	0.12
202	0.11
203	0.1
204	0.07
205	0.07
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.05
211	0.05
212	0.08
213	0.1
214	0.11
215	0.17
216	0.21
217	0.22
218	0.27
219	0.31
220	0.3
221	0.29
222	0.32
223	0.27
224	0.25
225	0.23
226	0.19
227	0.14
228	0.13
229	0.11
230	0.08
231	0.08
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.09
251	0.1
252	0.09
253	0.1
254	0.12
255	0.13
256	0.15
257	0.15
258	0.15
259	0.18
260	0.22
261	0.28
262	0.28
263	0.32
264	0.36
265	0.38
266	0.38
267	0.36
268	0.37
269	0.36
270	0.38
271	0.36
272	0.32
273	0.3
274	0.3
275	0.29
276	0.23
277	0.19
278	0.14
279	0.11
280	0.14
281	0.12
282	0.13
283	0.16
284	0.17
285	0.16
286	0.17
287	0.21
288	0.21
289	0.26
290	0.27
291	0.23
292	0.23
293	0.23
294	0.22
295	0.19
296	0.15
297	0.09
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.06
302	0.06
303	0.04
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.04
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.04
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.1
319	0.1
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.08
324	0.17
325	0.18
326	0.19
327	0.22
328	0.25
329	0.3
330	0.37
331	0.46
332	0.49
333	0.53
334	0.59
335	0.6
336	0.63
337	0.62
338	0.57
339	0.53
340	0.44
341	0.4
342	0.37
343	0.39
344	0.34
345	0.36
346	0.35
347	0.34
348	0.35
349	0.33
350	0.33
351	0.36
352	0.39
353	0.39
354	0.38
355	0.34
356	0.33
357	0.32
358	0.29
359	0.23
360	0.21
361	0.21
362	0.23
363	0.24
364	0.28
365	0.3
366	0.31
367	0.3
368	0.35
369	0.36
370	0.46
371	0.49
372	0.48
373	0.46
374	0.44
375	0.42
376	0.39
377	0.36
378	0.27
379	0.28
380	0.26
381	0.26
382	0.26
383	0.27
384	0.25
385	0.22
386	0.2
387	0.17
388	0.16
389	0.16
390	0.16
391	0.15
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.13
396	0.13
397	0.14
398	0.15
399	0.14
400	0.12
401	0.12
402	0.11
403	0.11
404	0.13
405	0.12
406	0.1
407	0.1
408	0.11
409	0.11
410	0.13
411	0.12
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.05
419	0.07
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.11
426	0.15
427	0.14
428	0.13
429	0.14
430	0.15
431	0.17
432	0.18
433	0.18
434	0.13
435	0.13
436	0.13
437	0.12
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.09
445	0.09
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.09
456	0.08
457	0.07
458	0.07
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.04
464	0.06
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.12
480	0.12
481	0.12
482	0.13
483	0.15
484	0.17
485	0.17
486	0.19
487	0.19
488	0.26
489	0.32
490	0.36
491	0.43
492	0.5
493	0.56
494	0.64
495	0.69
496	0.71
497	0.73
498	0.77
499	0.79
500	0.81
501	0.86
502	0.86
503	0.88
504	0.86
505	0.81
506	0.76
507	0.72
508	0.69
509	0.64
510	0.62
511	0.54
512	0.47
513	0.45
514	0.39
515	0.35
516	0.28
517	0.22
518	0.16
519	0.15
520	0.15
521	0.14
522	0.15
523	0.13
524	0.13
525	0.15
526	0.14
527	0.13
528	0.13
529	0.11
530	0.1
531	0.1
532	0.09
533	0.06
534	0.05
535	0.05
536	0.04
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.07
544	0.1
545	0.12
546	0.15
547	0.16
548	0.17
549	0.2
550	0.2
551	0.26
552	0.25
553	0.24
554	0.26
555	0.28
556	0.26
557	0.27
558	0.28
559	0.23
560	0.26
561	0.25
562	0.24
563	0.23
564	0.28
565	0.28
566	0.27
567	0.32
568	0.28
569	0.32
570	0.29
571	0.32
572	0.29
573	0.26
574	0.26
575	0.2
576	0.22
577	0.19
578	0.18
579	0.16
580	0.15
581	0.15
582	0.16
583	0.18
584	0.19
585	0.19
586	0.19
587	0.22
588	0.25
589	0.24
590	0.23
591	0.21
592	0.18
593	0.17
594	0.15
595	0.11
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.05
605	0.05
606	0.06
607	0.11
608	0.11
609	0.12
610	0.13
611	0.14
612	0.15
613	0.16
614	0.19
615	0.18
616	0.21
617	0.22
618	0.23
619	0.21
620	0.2
621	0.19
622	0.16
623	0.13
624	0.1
625	0.1
626	0.07
627	0.1
628	0.13
629	0.15
630	0.19
631	0.2
632	0.22
633	0.22
634	0.23
635	0.2
636	0.19
637	0.19
638	0.16
639	0.14
640	0.12
641	0.11
642	0.1
643	0.1
644	0.11
645	0.09
646	0.09
647	0.09
648	0.1
649	0.13
650	0.13
651	0.12
652	0.12
653	0.13
654	0.12
655	0.12
656	0.12
657	0.09
658	0.08
659	0.08
660	0.07
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.06
667	0.06
668	0.08
669	0.09
670	0.1
671	0.1
672	0.1
673	0.09
674	0.15
675	0.17
676	0.19
677	0.19
678	0.19
679	0.18
680	0.18
681	0.18
682	0.13
683	0.11
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.1
688	0.09
689	0.08
690	0.08
691	0.08
692	0.08
693	0.09
694	0.09
695	0.1
696	0.14
697	0.18
698	0.19
699	0.21
700	0.21
701	0.24
702	0.25
703	0.27
704	0.31
705	0.32
706	0.36
707	0.38
708	0.39
709	0.37
710	0.36
711	0.32
712	0.25
713	0.29
714	0.25
715	0.24
716	0.23
717	0.23
718	0.22
719	0.23
720	0.26
721	0.17
722	0.16
723	0.12
724	0.1
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.07
729	0.08
730	0.09
731	0.11
732	0.13
733	0.17
734	0.18
735	0.26
736	0.27
737	0.28
738	0.28
739	0.28
740	0.26
741	0.24
742	0.22
743	0.15
744	0.13
745	0.12
746	0.13
747	0.12
748	0.12
749	0.14
750	0.15
751	0.15
752	0.17
753	0.21
754	0.23
755	0.26
756	0.26
757	0.24
758	0.24
759	0.26
760	0.25
761	0.2
762	0.17
763	0.16
764	0.19
765	0.25
766	0.24
767	0.23
768	0.26
769	0.29
770	0.28
771	0.26
772	0.25
773	0.18
774	0.18
775	0.16
776	0.12
777	0.09
778	0.09
779	0.09
780	0.05
781	0.07
782	0.08
783	0.07
784	0.14
785	0.15
786	0.14
787	0.14
788	0.15
789	0.15
790	0.15
791	0.15
792	0.14
793	0.18
794	0.18
795	0.18
796	0.18
797	0.19
798	0.22
799	0.24
800	0.18
801	0.17
802	0.16
803	0.19
804	0.19
805	0.17
806	0.14
807	0.12
808	0.11
809	0.09
810	0.12
811	0.11
812	0.13
813	0.14
814	0.15
815	0.19
816	0.2
817	0.2
818	0.19
819	0.25
820	0.22
821	0.24
822	0.24
823	0.22
824	0.2
825	0.22
826	0.23
827	0.17
828	0.17
829	0.16
830	0.15
831	0.15
832	0.16
833	0.17
834	0.15
835	0.14
836	0.18
837	0.21
838	0.24
839	0.25
840	0.27
841	0.27
842	0.33
843	0.4
844	0.44
845	0.45
846	0.44
847	0.48
848	0.46
849	0.43
850	0.4
851	0.35
852	0.27
853	0.2
854	0.17
855	0.11
856	0.1
857	0.11
858	0.07
859	0.06
860	0.08
861	0.08
862	0.08
863	0.08
864	0.08
865	0.07
866	0.08
867	0.07
868	0.06
869	0.07
870	0.09
871	0.1
872	0.14
873	0.14
874	0.16
875	0.16
876	0.18
877	0.17
878	0.2
879	0.2
880	0.17
881	0.16
882	0.15
883	0.14
884	0.12
885	0.13
886	0.08
887	0.07
888	0.06
889	0.06
890	0.05
891	0.06
892	0.06
893	0.05
894	0.05
895	0.05
896	0.05
897	0.06
898	0.06
899	0.08
900	0.09
901	0.1
902	0.11
903	0.15
904	0.19
905	0.19
906	0.21
907	0.19
908	0.21
909	0.23
910	0.23
911	0.21
912	0.18
913	0.18
914	0.2
915	0.22
916	0.24
917	0.26
918	0.26
919	0.25
920	0.25
921	0.26
922	0.21
923	0.18
924	0.14
925	0.12
926	0.09
927	0.09
928	0.08
929	0.07
930	0.06
931	0.06
932	0.06
933	0.05
934	0.04
935	0.05
936	0.05
937	0.09
938	0.11
939	0.14
940	0.19
941	0.24
942	0.25
943	0.31
944	0.37
945	0.37
946	0.38
947	0.39
948	0.42
949	0.4
950	0.39
951	0.34
952	0.28
953	0.25
954	0.21
955	0.17
956	0.09
957	0.05
958	0.05
959	0.05
960	0.05
961	0.04
962	0.06
963	0.07
964	0.08
965	0.08
966	0.08
967	0.08
968	0.09
969	0.09
970	0.09
971	0.1
972	0.13
973	0.13
974	0.14
975	0.17
976	0.17
977	0.19
978	0.2
979	0.26
980	0.24
981	0.25
982	0.27
983	0.27
984	0.31
985	0.38
986	0.35
987	0.3
988	0.28
989	0.32
990	0.32
991	0.29
992	0.27
993	0.18
994	0.17
995	0.16
996	0.16
997	0.11
998	0.09
999	0.11
1000	0.09
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.09
1004	0.09
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.07
1008	0.07
1009	0.06
1010	0.07
1011	0.11
1012	0.15
1013	0.16
1014	0.17
1015	0.19
1016	0.26
1017	0.32
1018	0.38
1019	0.38
1020	0.4
1021	0.42
1022	0.42
1023	0.43
1024	0.37
1025	0.34
1026	0.28
1027	0.24
1028	0.21
1029	0.21
1030	0.21
1031	0.19
1032	0.22
1033	0.2
1034	0.2
1035	0.22
1036	0.2
1037	0.18
1038	0.2
1039	0.26
1040	0.23
1041	0.23
1042	0.22
1043	0.22
1044	0.24
1045	0.24
1046	0.23
1047	0.16
1048	0.16
1049	0.2
1050	0.25
1051	0.23
1052	0.25
1053	0.28
1054	0.36
1055	0.43
1056	0.46
1057	0.49
1058	0.55
1059	0.61
1060	0.66
1061	0.68
1062	0.65
1063	0.62
1064	0.67
1065	0.61
1066	0.53
1067	0.47
1068	0.39
1069	0.37
1070	0.32
1071	0.27
1072	0.17
1073	0.15
1074	0.13
1075	0.12
1076	0.11
1077	0.06
1078	0.07
1079	0.13
1080	0.17
1081	0.2
1082	0.23
1083	0.26
1084	0.26
1085	0.31
1086	0.38
1087	0.43
1088	0.43
1089	0.46
1090	0.46
1091	0.45
1092	0.47
1093	0.43
1094	0.36
1095	0.25
1096	0.24
1097	0.2
1098	0.2
1099	0.18
1100	0.15
1101	0.16
1102	0.14
1103	0.15
1104	0.13
1105	0.13
1106	0.11
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.11
1110	0.12
1111	0.11
1112	0.12
1113	0.11
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.12
1118	0.1
1119	0.1
1120	0.1
1121	0.1
1122	0.12
1123	0.13
1124	0.14
1125	0.11
1126	0.13
1127	0.13
1128	0.13
1129	0.16
1130	0.19
1131	0.22
1132	0.25
1133	0.31
1134	0.31
1135	0.32
1136	0.3
1137	0.31
1138	0.28
1139	0.26
1140	0.26
1141	0.24
1142	0.28
1143	0.27
1144	0.29
1145	0.26
1146	0.23
1147	0.21
1148	0.2
1149	0.17
1150	0.12
1151	0.12
1152	0.11
1153	0.12
1154	0.16
1155	0.18
1156	0.19
1157	0.22
1158	0.31
1159	0.32
1160	0.39
1161	0.43
1162	0.48
1163	0.52
1164	0.54
1165	0.56
1166	0.55
1167	0.56
1168	0.51
1169	0.46
1170	0.38
1171	0.32
1172	0.27
1173	0.22
1174	0.14
1175	0.19
1176	0.2
1177	0.23
1178	0.29
1179	0.36
1180	0.42
1181	0.49
1182	0.56
1183	0.6
1184	0.66
1185	0.71
1186	0.71
1187	0.73
1188	0.74
1189	0.72
1190	0.75
1191	0.68
1192	0.61
1193	0.55
1194	0.49
1195	0.43
1196	0.4
1197	0.34
1198	0.24
1199	0.23
1200	0.2
1201	0.25
1202	0.27
1203	0.24
1204	0.22
1205	0.23
1206	0.24
1207	0.25
1208	0.27
1209	0.3
1210	0.34
1211	0.42
1212	0.44
1213	0.45
1214	0.48
1215	0.46
1216	0.44
1217	0.37
1218	0.3
1219	0.23
1220	0.21
1221	0.2
1222	0.18
1223	0.19
1224	0.19
1225	0.18
1226	0.19
1227	0.17
1228	0.16
1229	0.16
1230	0.15
1231	0.13
1232	0.13
1233	0.13
1234	0.12
1235	0.12
1236	0.11
1237	0.09
1238	0.13
1239	0.13
1240	0.14
1241	0.13
1242	0.12
1243	0.13
1244	0.15
1245	0.16
1246	0.13
1247	0.13
1248	0.13
1249	0.2
1250	0.2
1251	0.19
1252	0.2
1253	0.24
1254	0.23
1255	0.23
1256	0.24
1257	0.18
1258	0.2
1259	0.2
1260	0.2
1261	0.16
1262	0.19
1263	0.19
1264	0.21
1265	0.25
1266	0.23
1267	0.24
1268	0.23
1269	0.22
1270	0.19

A0A642UJB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer