Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642USK9

Protein Details
Accession A0A642USK9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-114VRAAVQSVRRNRKRSSKSKKPDPKRQKHSTSSPESEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-105RRNRKRSSKSKKPDPKRQK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007147  TF_Vhr  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MDRKQGITHQIRSRLSAGAFADDRLWKRFSARRLELIDTLDLSSKKASEQEAEIQNVAESLRKEFGYSVEYTQDFDKLVRAAVQSVRRNRKRSSKSKKPDPKRQKHSTSSPESEEQFISEIARLRDVHDDVVDLSYPRTRAQSTVDHASATINHMLAQPKLPPLKQLDIRDTPDFDQGILKCRTILINLIDRSKSCAESVTKKSGNLQLLGQSVISACIAYVFEKSFDQVNPKSIDYLRGKLENPRHLAEFFRRLDPNAPQVTDEVAVISLYMLLGGCVKDFGFTSTMMPLAKMFFFCIMRDYPFFAKVATDFEYYEGRGAVVDTDNTPVAPAAPADTASAGAATVPPPVPTSVPASVPVPVAAPIPTPSTYPTTTTTAPTLPPLATLAEASARVLPIPSAISSTSHTPAATPHARSPVIAPVTASVTKHRKKVLLQFCDKVLEFSYPIQNSAPPRHGELIENARSAFHLANNTIVGLRDLRTHQHLSSDSDLERVFLHHEVIEIEVFTMGTKAIPIYELTSTVTGHQGGDGGNNNGNGGNSSGGTQPRYLLPPLKLPVDNFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.44
3 0.4
4 0.33
5 0.3
6 0.29
7 0.26
8 0.28
9 0.29
10 0.31
11 0.3
12 0.31
13 0.25
14 0.32
15 0.37
16 0.41
17 0.47
18 0.5
19 0.54
20 0.57
21 0.61
22 0.57
23 0.53
24 0.47
25 0.38
26 0.33
27 0.3
28 0.25
29 0.22
30 0.2
31 0.18
32 0.17
33 0.2
34 0.21
35 0.2
36 0.24
37 0.31
38 0.35
39 0.37
40 0.36
41 0.32
42 0.3
43 0.27
44 0.23
45 0.18
46 0.13
47 0.14
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.21
55 0.2
56 0.22
57 0.23
58 0.23
59 0.23
60 0.22
61 0.19
62 0.17
63 0.18
64 0.13
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.18
69 0.23
70 0.32
71 0.37
72 0.46
73 0.57
74 0.62
75 0.67
76 0.71
77 0.76
78 0.78
79 0.81
80 0.82
81 0.82
82 0.85
83 0.9
84 0.94
85 0.94
86 0.94
87 0.95
88 0.95
89 0.94
90 0.93
91 0.92
92 0.89
93 0.89
94 0.87
95 0.85
96 0.79
97 0.73
98 0.67
99 0.59
100 0.53
101 0.43
102 0.34
103 0.26
104 0.21
105 0.16
106 0.14
107 0.17
108 0.15
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.23
113 0.24
114 0.23
115 0.19
116 0.19
117 0.16
118 0.17
119 0.16
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.2
129 0.26
130 0.29
131 0.34
132 0.34
133 0.31
134 0.3
135 0.29
136 0.25
137 0.21
138 0.17
139 0.11
140 0.11
141 0.14
142 0.16
143 0.16
144 0.17
145 0.16
146 0.2
147 0.24
148 0.23
149 0.25
150 0.28
151 0.35
152 0.39
153 0.42
154 0.44
155 0.45
156 0.5
157 0.47
158 0.45
159 0.39
160 0.36
161 0.32
162 0.25
163 0.24
164 0.2
165 0.25
166 0.24
167 0.23
168 0.19
169 0.2
170 0.2
171 0.16
172 0.19
173 0.15
174 0.21
175 0.23
176 0.26
177 0.26
178 0.25
179 0.29
180 0.27
181 0.24
182 0.17
183 0.2
184 0.21
185 0.29
186 0.34
187 0.38
188 0.37
189 0.37
190 0.41
191 0.42
192 0.4
193 0.33
194 0.29
195 0.23
196 0.23
197 0.23
198 0.18
199 0.13
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.16
216 0.16
217 0.21
218 0.22
219 0.22
220 0.24
221 0.22
222 0.29
223 0.26
224 0.28
225 0.26
226 0.26
227 0.27
228 0.31
229 0.38
230 0.36
231 0.37
232 0.35
233 0.35
234 0.32
235 0.34
236 0.32
237 0.33
238 0.28
239 0.29
240 0.28
241 0.27
242 0.3
243 0.29
244 0.32
245 0.26
246 0.25
247 0.21
248 0.21
249 0.21
250 0.18
251 0.15
252 0.08
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.03
258 0.02
259 0.03
260 0.02
261 0.02
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.13
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.1
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.14
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.16
358 0.16
359 0.18
360 0.2
361 0.22
362 0.22
363 0.23
364 0.23
365 0.2
366 0.2
367 0.19
368 0.17
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.11
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.15
397 0.21
398 0.24
399 0.24
400 0.25
401 0.3
402 0.3
403 0.3
404 0.31
405 0.31
406 0.28
407 0.25
408 0.22
409 0.17
410 0.21
411 0.22
412 0.21
413 0.21
414 0.29
415 0.34
416 0.39
417 0.42
418 0.42
419 0.47
420 0.57
421 0.6
422 0.6
423 0.62
424 0.59
425 0.57
426 0.57
427 0.51
428 0.42
429 0.33
430 0.25
431 0.2
432 0.21
433 0.26
434 0.22
435 0.23
436 0.23
437 0.25
438 0.27
439 0.32
440 0.34
441 0.28
442 0.32
443 0.34
444 0.34
445 0.33
446 0.35
447 0.38
448 0.36
449 0.35
450 0.32
451 0.28
452 0.27
453 0.27
454 0.21
455 0.15
456 0.16
457 0.16
458 0.18
459 0.18
460 0.18
461 0.16
462 0.16
463 0.14
464 0.11
465 0.12
466 0.14
467 0.16
468 0.19
469 0.24
470 0.27
471 0.27
472 0.31
473 0.33
474 0.34
475 0.36
476 0.36
477 0.31
478 0.3
479 0.29
480 0.24
481 0.22
482 0.18
483 0.17
484 0.14
485 0.15
486 0.12
487 0.13
488 0.13
489 0.14
490 0.13
491 0.1
492 0.1
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.06
498 0.05
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.1
505 0.11
506 0.12
507 0.14
508 0.15
509 0.15
510 0.15
511 0.17
512 0.15
513 0.14
514 0.13
515 0.13
516 0.12
517 0.15
518 0.17
519 0.18
520 0.2
521 0.2
522 0.2
523 0.19
524 0.19
525 0.16
526 0.14
527 0.12
528 0.1
529 0.12
530 0.15
531 0.18
532 0.2
533 0.2
534 0.2
535 0.23
536 0.27
537 0.3
538 0.32
539 0.32
540 0.38
541 0.41
542 0.45
543 0.44
544 0.43
545 0.46
546 0.47