Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UF37

Protein Details
Accession A0A642UF37    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-319LLRTAVKKKIRPKKTNTVTVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-311KKKIRPK
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.833, nucl 9.5, cyto_mito 6.833, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MSLSLELSVGTRARAICFFDERVTGYVVSHGPVLPQARVSVAVSIVPHDRIDAFKQANGDFPDAFSVHDAVLTEAEPRDDGTTVYPFSFTITYPRTKFDNPHVVVMAQMVEEEEILSPQANLPDLEPRSRNLLAELNHQYLSAAIYETGGPLPPVNTIRANPRAQVHWVAPVNVALSLKLKTMKAAGRNSMLLASLTLASDLDGFKIVINDMSVDFKHGSVSRIYPQPWPVTFASGDNINFTYCLTNEEELDTKHILIKLKSEVHQQIDNEWTAVSGDITTSWTPLVDFCIIAPPINHLLRTAVKKKIRPKKTNTVTVNLSVNNILSGLRLTFNGRPTIEMGDVAVWRLQAVNNSPNRITLSLLVQQKQFSLPVGADPEACDNTQLSLAYQAPKPQTGVVVLDNGLRIGPLDPNSVYDTDIRLFGVSRGIHNLEGVKIFDVHSGEGLDFGKLVEVYVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.22
3 0.24
4 0.28
5 0.3
6 0.29
7 0.3
8 0.3
9 0.29
10 0.27
11 0.23
12 0.19
13 0.2
14 0.19
15 0.18
16 0.17
17 0.15
18 0.13
19 0.17
20 0.2
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.18
26 0.18
27 0.15
28 0.13
29 0.14
30 0.13
31 0.15
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.17
38 0.2
39 0.26
40 0.25
41 0.25
42 0.29
43 0.28
44 0.33
45 0.33
46 0.32
47 0.24
48 0.23
49 0.24
50 0.21
51 0.21
52 0.17
53 0.15
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.13
74 0.15
75 0.15
76 0.13
77 0.17
78 0.2
79 0.27
80 0.28
81 0.31
82 0.34
83 0.36
84 0.4
85 0.42
86 0.48
87 0.44
88 0.46
89 0.44
90 0.39
91 0.36
92 0.32
93 0.23
94 0.12
95 0.1
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.16
111 0.17
112 0.22
113 0.22
114 0.22
115 0.27
116 0.28
117 0.27
118 0.22
119 0.25
120 0.23
121 0.29
122 0.33
123 0.29
124 0.28
125 0.28
126 0.25
127 0.2
128 0.2
129 0.12
130 0.08
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.13
144 0.14
145 0.21
146 0.28
147 0.29
148 0.28
149 0.29
150 0.29
151 0.3
152 0.32
153 0.26
154 0.26
155 0.26
156 0.24
157 0.22
158 0.2
159 0.18
160 0.16
161 0.15
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.15
170 0.18
171 0.24
172 0.27
173 0.28
174 0.28
175 0.28
176 0.28
177 0.24
178 0.2
179 0.13
180 0.1
181 0.08
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.07
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.13
209 0.15
210 0.18
211 0.2
212 0.2
213 0.22
214 0.25
215 0.23
216 0.26
217 0.22
218 0.21
219 0.2
220 0.18
221 0.16
222 0.14
223 0.14
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.14
239 0.12
240 0.1
241 0.12
242 0.14
243 0.15
244 0.14
245 0.17
246 0.19
247 0.22
248 0.23
249 0.27
250 0.29
251 0.29
252 0.32
253 0.29
254 0.27
255 0.26
256 0.25
257 0.19
258 0.15
259 0.12
260 0.09
261 0.09
262 0.07
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.17
283 0.18
284 0.18
285 0.14
286 0.17
287 0.21
288 0.28
289 0.3
290 0.33
291 0.39
292 0.45
293 0.55
294 0.62
295 0.68
296 0.71
297 0.75
298 0.78
299 0.81
300 0.85
301 0.78
302 0.74
303 0.66
304 0.6
305 0.54
306 0.43
307 0.35
308 0.25
309 0.21
310 0.15
311 0.12
312 0.09
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.11
319 0.14
320 0.16
321 0.21
322 0.2
323 0.21
324 0.22
325 0.24
326 0.21
327 0.18
328 0.15
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.15
339 0.22
340 0.25
341 0.29
342 0.29
343 0.3
344 0.32
345 0.29
346 0.26
347 0.2
348 0.21
349 0.24
350 0.29
351 0.3
352 0.29
353 0.29
354 0.28
355 0.28
356 0.24
357 0.19
358 0.15
359 0.13
360 0.14
361 0.17
362 0.17
363 0.16
364 0.16
365 0.18
366 0.18
367 0.18
368 0.16
369 0.13
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.1
374 0.13
375 0.15
376 0.18
377 0.2
378 0.24
379 0.25
380 0.27
381 0.27
382 0.24
383 0.24
384 0.22
385 0.23
386 0.19
387 0.18
388 0.17
389 0.18
390 0.17
391 0.15
392 0.13
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.12
397 0.12
398 0.16
399 0.16
400 0.19
401 0.22
402 0.22
403 0.22
404 0.19
405 0.2
406 0.18
407 0.18
408 0.16
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.19
413 0.17
414 0.18
415 0.22
416 0.24
417 0.24
418 0.25
419 0.26
420 0.22
421 0.23
422 0.22
423 0.18
424 0.17
425 0.17
426 0.19
427 0.18
428 0.16
429 0.15
430 0.16
431 0.14
432 0.16
433 0.15
434 0.12
435 0.11
436 0.1
437 0.11
438 0.1