Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UGD2

Protein Details
Accession A0A642UGD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-137ERERQRRQVINEQRKQRRKLKRTHGDTEASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-129RKQRRKLKR
Subcellular Location(s) mito 12.5, mito_nucl 11.833, nucl 10, cyto_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSDKTRSQLIASTVGSVKRYTLINPVDATTKRFGFRCPVCDLTYQDNLKLLDHFNSYQHKAKAGITTAASTEGEVEPGVPRASFATVVETMEQLIAERVNSRDPKYEERERQRRQVINEQRKQRRKLKRTHGDTEASAEVEAALGFGSFGKRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.24
4 0.21
5 0.18
6 0.19
7 0.17
8 0.23
9 0.23
10 0.25
11 0.26
12 0.26
13 0.29
14 0.29
15 0.31
16 0.27
17 0.27
18 0.26
19 0.26
20 0.27
21 0.31
22 0.34
23 0.34
24 0.36
25 0.37
26 0.37
27 0.39
28 0.41
29 0.37
30 0.41
31 0.37
32 0.32
33 0.31
34 0.3
35 0.27
36 0.24
37 0.2
38 0.14
39 0.16
40 0.16
41 0.17
42 0.22
43 0.25
44 0.29
45 0.29
46 0.28
47 0.27
48 0.28
49 0.27
50 0.24
51 0.22
52 0.17
53 0.16
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.1
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.06
85 0.07
86 0.13
87 0.16
88 0.17
89 0.24
90 0.28
91 0.35
92 0.41
93 0.5
94 0.54
95 0.62
96 0.71
97 0.7
98 0.75
99 0.76
100 0.74
101 0.71
102 0.72
103 0.73
104 0.73
105 0.76
106 0.77
107 0.79
108 0.83
109 0.85
110 0.84
111 0.84
112 0.82
113 0.85
114 0.86
115 0.86
116 0.85
117 0.85
118 0.81
119 0.75
120 0.66
121 0.61
122 0.51
123 0.4
124 0.32
125 0.24
126 0.17
127 0.13
128 0.11
129 0.06
130 0.04
131 0.03
132 0.04
133 0.05
134 0.09