FuNGI

F4P1M6

Protein Details

Accession

F4P1M6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
221-240	DKKMTYVKSRQEKKIRSFKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007258 Vps52
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0019905 F:syntaxin binding GO:0032456 P:endocytic recycling GO:0006896 P:Golgi to vacuole transport GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF04129 Vps52

Amino Acid Sequences

MADSLKVVTRVSTVSDSSRLSAHDKDAIPNSLQGVISKLLQDAESTVTDEAAWQTKPRQSVVASNKPEYDITFDEVDDRITEFQEDELVKSALSKGVNLREYAMQIEKDLTLVQDAHVLDYIRQVHSLIDLHGQIKECDLLLGNMETLLRGNQMHLGQINDEISVMQEQSRSMTIRLRNRVSTQSSLFEMLEGTVVSPDLIKKICEGEVNEFFLQHLIDLDKKMTYVKSRQEKKIRSFKDVAPELERLRQRAVEKIRDFLLKKIESLKSPNTNIAIIQQSVFLKYRSMFSFLMERYSEVGVEIHGNYVATVSNYYFVLFEKYVKSIAKFQMVIADKFDLIGCEEGAKRGLFSGRLTLKDKTNVFTLGDRLQVLVNPDPGIIMLNIAEDSHLKYSYEAIFKSTTRLLLDNACSEYIFTTEFFSKTNTSHPIEVPGVVFTEIFDQTLKMLQATIKAQIDNTFDAVGILICIRINSQNIRIMQKRRIPCLETFLNLINILLWPRFQAIIDMHIDSLRRAAVNRLLVTKEVHPHYIMRRYVEFSAAILTLNQGYDDALLTNSLARLRSEVEVLIQRMAMEFPSRKNRSVFFINNFDLVASILNEYTTASFNHEKEYFDRIVIDHTSEFVDNELDQYIHDMMELVQKYETVDNLSFVDAEKFEQVATDFNATWKSTINNMYISITQAFPNFQNGARILHTAMTQFLLFYRRFLTCFERRFSQGKKSRVQPVGIQSLMVEIKKFKSSFQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.26
3	0.27
4	0.26
5	0.27
6	0.25
7	0.26
8	0.27
9	0.28
10	0.31
11	0.31
12	0.35
13	0.39
14	0.4
15	0.37
16	0.35
17	0.34
18	0.29
19	0.28
20	0.23
21	0.2
22	0.19
23	0.18
24	0.17
25	0.17
26	0.15
27	0.14
28	0.14
29	0.13
30	0.14
31	0.14
32	0.15
33	0.14
34	0.13
35	0.12
36	0.13
37	0.14
38	0.14
39	0.15
40	0.16
41	0.21
42	0.25
43	0.29
44	0.29
45	0.32
46	0.3
47	0.4
48	0.47
49	0.51
50	0.53
51	0.53
52	0.53
53	0.5
54	0.49
55	0.4
56	0.36
57	0.28
58	0.26
59	0.24
60	0.22
61	0.22
62	0.21
63	0.21
64	0.16
65	0.15
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.11
70	0.11
71	0.15
72	0.15
73	0.15
74	0.17
75	0.17
76	0.16
77	0.16
78	0.17
79	0.16
80	0.15
81	0.17
82	0.19
83	0.26
84	0.29
85	0.28
86	0.3
87	0.28
88	0.29
89	0.3
90	0.28
91	0.21
92	0.19
93	0.2
94	0.18
95	0.16
96	0.15
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.1
101	0.13
102	0.13
103	0.13
104	0.15
105	0.15
106	0.14
107	0.18
108	0.21
109	0.17
110	0.17
111	0.17
112	0.15
113	0.17
114	0.18
115	0.14
116	0.15
117	0.16
118	0.16
119	0.19
120	0.2
121	0.17
122	0.17
123	0.16
124	0.13
125	0.12
126	0.11
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.07
138	0.08
139	0.12
140	0.12
141	0.14
142	0.15
143	0.16
144	0.15
145	0.17
146	0.16
147	0.12
148	0.11
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.07
154	0.08
155	0.08
156	0.1
157	0.12
158	0.13
159	0.13
160	0.2
161	0.26
162	0.34
163	0.42
164	0.45
165	0.47
166	0.49
167	0.55
168	0.53
169	0.51
170	0.45
171	0.39
172	0.36
173	0.34
174	0.3
175	0.23
176	0.18
177	0.13
178	0.11
179	0.08
180	0.07
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.06
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.12
191	0.14
192	0.16
193	0.18
194	0.22
195	0.25
196	0.29
197	0.28
198	0.26
199	0.24
200	0.22
201	0.19
202	0.12
203	0.1
204	0.07
205	0.09
206	0.09
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.12
211	0.14
212	0.18
213	0.23
214	0.31
215	0.41
216	0.49
217	0.58
218	0.66
219	0.72
220	0.76
221	0.8
222	0.75
223	0.72
224	0.69
225	0.63
226	0.63
227	0.59
228	0.52
229	0.45
230	0.45
231	0.39
232	0.4
233	0.39
234	0.31
235	0.28
236	0.3
237	0.27
238	0.32
239	0.37
240	0.4
241	0.39
242	0.39
243	0.4
244	0.42
245	0.42
246	0.37
247	0.39
248	0.3
249	0.3
250	0.34
251	0.34
252	0.31
253	0.35
254	0.38
255	0.36
256	0.37
257	0.38
258	0.33
259	0.31
260	0.28
261	0.26
262	0.22
263	0.16
264	0.14
265	0.14
266	0.13
267	0.15
268	0.16
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.16
273	0.15
274	0.19
275	0.17
276	0.18
277	0.24
278	0.22
279	0.25
280	0.21
281	0.21
282	0.18
283	0.18
284	0.16
285	0.1
286	0.1
287	0.07
288	0.08
289	0.08
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.05
294	0.06
295	0.05
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.11
308	0.12
309	0.14
310	0.14
311	0.16
312	0.19
313	0.21
314	0.23
315	0.22
316	0.21
317	0.26
318	0.27
319	0.26
320	0.21
321	0.19
322	0.16
323	0.15
324	0.15
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.08
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.15
340	0.15
341	0.19
342	0.22
343	0.23
344	0.25
345	0.29
346	0.3
347	0.25
348	0.24
349	0.22
350	0.2
351	0.18
352	0.19
353	0.14
354	0.15
355	0.13
356	0.12
357	0.11
358	0.11
359	0.12
360	0.11
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.06
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.09
381	0.12
382	0.14
383	0.13
384	0.14
385	0.15
386	0.15
387	0.18
388	0.16
389	0.14
390	0.13
391	0.14
392	0.13
393	0.14
394	0.15
395	0.15
396	0.15
397	0.14
398	0.12
399	0.11
400	0.1
401	0.08
402	0.08
403	0.06
404	0.07
405	0.09
406	0.09
407	0.1
408	0.11
409	0.12
410	0.12
411	0.16
412	0.19
413	0.2
414	0.22
415	0.22
416	0.24
417	0.23
418	0.23
419	0.19
420	0.14
421	0.12
422	0.1
423	0.1
424	0.06
425	0.08
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.09
432	0.09
433	0.06
434	0.07
435	0.07
436	0.1
437	0.11
438	0.15
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.17
443	0.19
444	0.16
445	0.16
446	0.12
447	0.11
448	0.11
449	0.1
450	0.07
451	0.05
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.05
457	0.07
458	0.09
459	0.11
460	0.14
461	0.19
462	0.22
463	0.27
464	0.33
465	0.36
466	0.41
467	0.47
468	0.49
469	0.5
470	0.52
471	0.5
472	0.45
473	0.47
474	0.41
475	0.35
476	0.32
477	0.27
478	0.24
479	0.2
480	0.18
481	0.12
482	0.1
483	0.1
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.1
491	0.09
492	0.12
493	0.14
494	0.14
495	0.13
496	0.14
497	0.14
498	0.12
499	0.12
500	0.1
501	0.08
502	0.08
503	0.11
504	0.15
505	0.19
506	0.21
507	0.22
508	0.22
509	0.23
510	0.25
511	0.25
512	0.26
513	0.24
514	0.24
515	0.23
516	0.26
517	0.3
518	0.36
519	0.35
520	0.32
521	0.32
522	0.34
523	0.34
524	0.32
525	0.26
526	0.18
527	0.18
528	0.15
529	0.13
530	0.09
531	0.09
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.08
546	0.09
547	0.09
548	0.1
549	0.12
550	0.13
551	0.13
552	0.13
553	0.14
554	0.18
555	0.19
556	0.18
557	0.16
558	0.14
559	0.14
560	0.14
561	0.12
562	0.12
563	0.13
564	0.19
565	0.3
566	0.34
567	0.37
568	0.39
569	0.41
570	0.42
571	0.48
572	0.49
573	0.44
574	0.48
575	0.46
576	0.43
577	0.41
578	0.35
579	0.26
580	0.2
581	0.15
582	0.08
583	0.07
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.13
592	0.18
593	0.19
594	0.25
595	0.26
596	0.26
597	0.28
598	0.34
599	0.29
600	0.25
601	0.26
602	0.2
603	0.23
604	0.22
605	0.22
606	0.15
607	0.15
608	0.17
609	0.16
610	0.15
611	0.12
612	0.12
613	0.1
614	0.1
615	0.1
616	0.09
617	0.08
618	0.11
619	0.11
620	0.09
621	0.09
622	0.08
623	0.08
624	0.15
625	0.16
626	0.14
627	0.14
628	0.14
629	0.16
630	0.17
631	0.17
632	0.15
633	0.15
634	0.15
635	0.16
636	0.17
637	0.15
638	0.14
639	0.16
640	0.12
641	0.13
642	0.13
643	0.12
644	0.11
645	0.12
646	0.12
647	0.12
648	0.14
649	0.15
650	0.14
651	0.16
652	0.19
653	0.19
654	0.19
655	0.19
656	0.18
657	0.21
658	0.25
659	0.26
660	0.24
661	0.25
662	0.27
663	0.26
664	0.27
665	0.23
666	0.19
667	0.18
668	0.18
669	0.19
670	0.17
671	0.22
672	0.21
673	0.2
674	0.24
675	0.24
676	0.26
677	0.26
678	0.26
679	0.22
680	0.22
681	0.22
682	0.18
683	0.18
684	0.16
685	0.14
686	0.12
687	0.13
688	0.17
689	0.15
690	0.16
691	0.19
692	0.19
693	0.21
694	0.24
695	0.31
696	0.35
697	0.41
698	0.45
699	0.46
700	0.5
701	0.56
702	0.58
703	0.6
704	0.6
705	0.63
706	0.66
707	0.69
708	0.74
709	0.72
710	0.71
711	0.67
712	0.66
713	0.66
714	0.57
715	0.5
716	0.39
717	0.38
718	0.37
719	0.3
720	0.24
721	0.18
722	0.22
723	0.29

F4P1M6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer