Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UZQ5

Protein Details
Accession A0A642UZQ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32GPSGYRVAKRPSIRRHRRTDSAASLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-22RPSIRR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR006553  Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13516  LRR_6  
CDD cd09293  AMN1  
Amino Acid Sequences MYRKPDPGPSGYRVAKRPSIRRHRRTDSAASLVRSPSVCDVSSDDSTSLDSPPSTPYDPQEPAYFDARPTTPQTIPAAVRLGDVPEIVHRIFQYVDHATVVPEEGCVVRRRPLSFDHAMLIHQSTQKAVSVLKHSPTTSAGLEVSASSAQALANCMMVNRLWCSIAKAVIGERVLFANERNWHRLTAQPQPYRHLNRPKQVVLHKLVHARQPSIESIKHADYSRLTWLELYMCPKLAPPVEMXXXXXXPPVEMLVASLEKIVITGSKTVDDHFLQMVGRRCPNLRTLDLRACELISDSGVYHVATGCRQLRTLNLGRKHKGHLITDTSISAVARHCRHLATVGLAGCHITDHSVWELAAHCSDSLQRLSLNNCRLLTDHSVPHILSRPHPSFFQHLTVLELSHTNLSHWRPVIEFKRRQQYKGLAMVVHVDQALEHQWRATEMEMDKVISQRMFSDILHWANDPDDGDMPYHTLLKHSQH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.63
4 0.68
5 0.7
6 0.75
7 0.79
8 0.83
9 0.87
10 0.88
11 0.88
12 0.85
13 0.83
14 0.79
15 0.77
16 0.72
17 0.64
18 0.58
19 0.5
20 0.46
21 0.36
22 0.31
23 0.27
24 0.25
25 0.23
26 0.21
27 0.24
28 0.27
29 0.29
30 0.28
31 0.24
32 0.21
33 0.22
34 0.22
35 0.19
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.15
40 0.19
41 0.2
42 0.21
43 0.24
44 0.3
45 0.32
46 0.34
47 0.35
48 0.33
49 0.33
50 0.35
51 0.32
52 0.25
53 0.27
54 0.26
55 0.25
56 0.28
57 0.3
58 0.27
59 0.31
60 0.33
61 0.33
62 0.33
63 0.32
64 0.3
65 0.25
66 0.25
67 0.21
68 0.19
69 0.14
70 0.14
71 0.11
72 0.1
73 0.13
74 0.13
75 0.14
76 0.12
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.17
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.1
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.1
93 0.13
94 0.15
95 0.2
96 0.24
97 0.26
98 0.28
99 0.32
100 0.37
101 0.37
102 0.37
103 0.33
104 0.29
105 0.28
106 0.26
107 0.23
108 0.19
109 0.18
110 0.16
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.19
118 0.22
119 0.25
120 0.26
121 0.26
122 0.26
123 0.26
124 0.25
125 0.2
126 0.18
127 0.15
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.07
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.18
166 0.21
167 0.25
168 0.25
169 0.26
170 0.27
171 0.31
172 0.3
173 0.34
174 0.4
175 0.42
176 0.42
177 0.46
178 0.52
179 0.54
180 0.58
181 0.59
182 0.56
183 0.57
184 0.62
185 0.6
186 0.58
187 0.57
188 0.56
189 0.5
190 0.47
191 0.43
192 0.42
193 0.42
194 0.41
195 0.38
196 0.32
197 0.27
198 0.25
199 0.24
200 0.23
201 0.21
202 0.18
203 0.19
204 0.2
205 0.21
206 0.19
207 0.19
208 0.16
209 0.17
210 0.19
211 0.17
212 0.16
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.11
224 0.12
225 0.1
226 0.14
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.15
231 0.15
232 0.13
233 0.12
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.14
257 0.18
258 0.18
259 0.19
260 0.19
261 0.2
262 0.21
263 0.26
264 0.26
265 0.25
266 0.27
267 0.31
268 0.36
269 0.36
270 0.35
271 0.3
272 0.25
273 0.22
274 0.18
275 0.13
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.12
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.23
293 0.31
294 0.34
295 0.39
296 0.46
297 0.48
298 0.51
299 0.53
300 0.51
301 0.48
302 0.43
303 0.41
304 0.39
305 0.38
306 0.36
307 0.32
308 0.27
309 0.22
310 0.19
311 0.15
312 0.12
313 0.16
314 0.17
315 0.19
316 0.2
317 0.2
318 0.21
319 0.22
320 0.21
321 0.17
322 0.19
323 0.17
324 0.16
325 0.15
326 0.15
327 0.12
328 0.11
329 0.08
330 0.06
331 0.05
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.11
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.15
349 0.2
350 0.27
351 0.3
352 0.32
353 0.31
354 0.31
355 0.31
356 0.32
357 0.35
358 0.32
359 0.3
360 0.27
361 0.29
362 0.28
363 0.3
364 0.32
365 0.27
366 0.27
367 0.33
368 0.34
369 0.34
370 0.36
371 0.36
372 0.37
373 0.38
374 0.38
375 0.31
376 0.28
377 0.3
378 0.29
379 0.26
380 0.2
381 0.17
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.12
386 0.17
387 0.19
388 0.24
389 0.24
390 0.24
391 0.23
392 0.32
393 0.41
394 0.46
395 0.52
396 0.55
397 0.65
398 0.68
399 0.68
400 0.68
401 0.67
402 0.65
403 0.64
404 0.59
405 0.48
406 0.45
407 0.46
408 0.38
409 0.31
410 0.22
411 0.14
412 0.1
413 0.11
414 0.15
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.17
421 0.17
422 0.19
423 0.17
424 0.22
425 0.22
426 0.23
427 0.24
428 0.24
429 0.26
430 0.21
431 0.2
432 0.16
433 0.18
434 0.19
435 0.17
436 0.19
437 0.22
438 0.24
439 0.25
440 0.25
441 0.23
442 0.21
443 0.23
444 0.2
445 0.16
446 0.16
447 0.15
448 0.15
449 0.15
450 0.16
451 0.16
452 0.18
453 0.15
454 0.16