FuNGI

F4NRI1

Protein Details

Accession

F4NRI1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
601-623	IARELEKQKEQRSKKRARMSIAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
614-615	KK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito_nucl 12.5, mito 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MYQNAMQQVISHLLSQGLTPAQAQQQAHAYVQQNLQQLISQQQHAQGQHQQAISQQQQQSATLPESTTEAQRKVQQQPVQQIPAVQPVATYETHRLIAAGAGVMPHHIMKVPNPKFDLKSFKAPVTMVRQDPYKIRQEQYRLDAIRQGKEFKAAGRGDNQIDGNIGLGGINISLDKDKIAPFGNAAKQKQNLFKKKTRTYYLSRDHEDAGNSDRLGDTDMILTSVNARHGDPDRHPWVLQDDDDQYYTGNLEGSQGSNYMLFVFVNGGFKVIPATKFYKFMPRVNYRTLTVDEAEEQMKTKTRSKVSSHSDRWVMRNKEGIDGEKSMSLMDKLRNNIIDDEPKHAVVKTKREAEPGLDYTEEFADDEEINFGIDDAEDAKDAARRMFGEDRANQRFEDEEDVDAELDNLRKGKVAKNSRFTSAWYLLGMLTIQRVSSLDSNCQKIAKSLVKHEKNDVYEMDEENPYVSDEEEDEELNEMEEQKDEKAAQQQAIAAKKEADLIMKIRRDVSGSSTKLQRSGSISGTQSPRVASPTSPSSQPSATSPLSNTSTANGKNRPKSGGSTPGPASSSEIKRRRESSVSTGMTGHNSPPPPPAPAQVIARELEKQKEQRSKKRARMSIASQGDAPSSPFNPTQHQSSSKPSSRPQSSSPASPHNSQVRQPTPRSISHSSAASPSALSVPGSPPRSGDSENTGAVLTEEHIIRVIQAKKGAPITVKDIVAHVRNFLQSNPTNKDLLRQIMRRVVVHDKETGIVTLKDEFKGKY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.15
3	0.15
4	0.12
5	0.11
6	0.11
7	0.15
8	0.17
9	0.23
10	0.23
11	0.23
12	0.28
13	0.3
14	0.3
15	0.33
16	0.31
17	0.31
18	0.34
19	0.37
20	0.35
21	0.33
22	0.33
23	0.28
24	0.27
25	0.3
26	0.3
27	0.27
28	0.25
29	0.3
30	0.35
31	0.35
32	0.38
33	0.37
34	0.39
35	0.42
36	0.4
37	0.36
38	0.34
39	0.41
40	0.41
41	0.42
42	0.39
43	0.38
44	0.39
45	0.39
46	0.38
47	0.33
48	0.3
49	0.24
50	0.21
51	0.18
52	0.2
53	0.21
54	0.25
55	0.27
56	0.28
57	0.31
58	0.37
59	0.44
60	0.48
61	0.55
62	0.54
63	0.56
64	0.63
65	0.67
66	0.64
67	0.57
68	0.52
69	0.45
70	0.47
71	0.4
72	0.3
73	0.22
74	0.2
75	0.23
76	0.21
77	0.22
78	0.18
79	0.2
80	0.21
81	0.21
82	0.19
83	0.16
84	0.16
85	0.13
86	0.1
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.09
96	0.16
97	0.27
98	0.32
99	0.37
100	0.41
101	0.45
102	0.47
103	0.52
104	0.55
105	0.49
106	0.54
107	0.52
108	0.5
109	0.48
110	0.45
111	0.45
112	0.43
113	0.45
114	0.37
115	0.37
116	0.37
117	0.37
118	0.42
119	0.42
120	0.42
121	0.42
122	0.43
123	0.47
124	0.52
125	0.56
126	0.56
127	0.59
128	0.52
129	0.47
130	0.5
131	0.47
132	0.46
133	0.42
134	0.41
135	0.32
136	0.35
137	0.35
138	0.3
139	0.34
140	0.3
141	0.3
142	0.3
143	0.33
144	0.3
145	0.32
146	0.31
147	0.22
148	0.21
149	0.19
150	0.15
151	0.1
152	0.09
153	0.05
154	0.05
155	0.04
156	0.04
157	0.04
158	0.03
159	0.04
160	0.05
161	0.05
162	0.06
163	0.08
164	0.09
165	0.11
166	0.13
167	0.13
168	0.15
169	0.21
170	0.27
171	0.33
172	0.35
173	0.38
174	0.4
175	0.45
176	0.52
177	0.56
178	0.6
179	0.61
180	0.66
181	0.71
182	0.76
183	0.79
184	0.77
185	0.73
186	0.71
187	0.73
188	0.75
189	0.73
190	0.67
191	0.61
192	0.55
193	0.51
194	0.44
195	0.35
196	0.3
197	0.24
198	0.2
199	0.18
200	0.16
201	0.14
202	0.15
203	0.14
204	0.1
205	0.08
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.09
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.14
216	0.18
217	0.23
218	0.24
219	0.31
220	0.33
221	0.34
222	0.34
223	0.32
224	0.32
225	0.29
226	0.27
227	0.22
228	0.2
229	0.2
230	0.2
231	0.19
232	0.15
233	0.13
234	0.12
235	0.09
236	0.07
237	0.05
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.06
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.06
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.1
258	0.11
259	0.11
260	0.13
261	0.17
262	0.18
263	0.2
264	0.21
265	0.3
266	0.32
267	0.35
268	0.41
269	0.45
270	0.48
271	0.51
272	0.53
273	0.44
274	0.43
275	0.4
276	0.33
277	0.25
278	0.21
279	0.17
280	0.16
281	0.15
282	0.12
283	0.11
284	0.1
285	0.14
286	0.16
287	0.22
288	0.27
289	0.31
290	0.37
291	0.41
292	0.49
293	0.53
294	0.6
295	0.58
296	0.56
297	0.57
298	0.53
299	0.53
300	0.53
301	0.48
302	0.4
303	0.42
304	0.38
305	0.37
306	0.36
307	0.34
308	0.27
309	0.25
310	0.24
311	0.19
312	0.18
313	0.13
314	0.12
315	0.11
316	0.1
317	0.13
318	0.15
319	0.16
320	0.18
321	0.2
322	0.21
323	0.22
324	0.21
325	0.24
326	0.22
327	0.25
328	0.24
329	0.23
330	0.22
331	0.2
332	0.25
333	0.23
334	0.3
335	0.31
336	0.37
337	0.38
338	0.4
339	0.4
340	0.36
341	0.36
342	0.3
343	0.26
344	0.19
345	0.17
346	0.16
347	0.15
348	0.12
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.11
373	0.14
374	0.17
375	0.2
376	0.24
377	0.31
378	0.34
379	0.34
380	0.3
381	0.28
382	0.26
383	0.22
384	0.22
385	0.15
386	0.12
387	0.12
388	0.12
389	0.12
390	0.11
391	0.1
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.08
398	0.09
399	0.14
400	0.23
401	0.33
402	0.39
403	0.47
404	0.49
405	0.5
406	0.5
407	0.47
408	0.44
409	0.35
410	0.29
411	0.21
412	0.19
413	0.16
414	0.15
415	0.13
416	0.07
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.05
422	0.06
423	0.1
424	0.11
425	0.17
426	0.2
427	0.23
428	0.23
429	0.24
430	0.22
431	0.19
432	0.25
433	0.24
434	0.23
435	0.31
436	0.4
437	0.46
438	0.47
439	0.51
440	0.5
441	0.45
442	0.45
443	0.36
444	0.29
445	0.25
446	0.24
447	0.22
448	0.17
449	0.15
450	0.13
451	0.13
452	0.1
453	0.08
454	0.07
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.08
459	0.07
460	0.07
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.08
472	0.1
473	0.16
474	0.19
475	0.19
476	0.19
477	0.21
478	0.24
479	0.28
480	0.27
481	0.21
482	0.19
483	0.18
484	0.19
485	0.17
486	0.14
487	0.11
488	0.14
489	0.2
490	0.21
491	0.22
492	0.21
493	0.21
494	0.21
495	0.21
496	0.23
497	0.26
498	0.26
499	0.29
500	0.33
501	0.33
502	0.35
503	0.34
504	0.31
505	0.27
506	0.28
507	0.27
508	0.26
509	0.26
510	0.29
511	0.31
512	0.29
513	0.26
514	0.23
515	0.21
516	0.19
517	0.2
518	0.15
519	0.17
520	0.21
521	0.22
522	0.23
523	0.23
524	0.23
525	0.23
526	0.23
527	0.21
528	0.22
529	0.21
530	0.21
531	0.2
532	0.22
533	0.24
534	0.24
535	0.22
536	0.18
537	0.22
538	0.25
539	0.3
540	0.33
541	0.38
542	0.43
543	0.46
544	0.48
545	0.45
546	0.46
547	0.46
548	0.48
549	0.43
550	0.42
551	0.4
552	0.39
553	0.38
554	0.33
555	0.32
556	0.29
557	0.33
558	0.38
559	0.44
560	0.47
561	0.52
562	0.55
563	0.56
564	0.54
565	0.52
566	0.5
567	0.53
568	0.49
569	0.44
570	0.42
571	0.38
572	0.35
573	0.31
574	0.25
575	0.2
576	0.2
577	0.2
578	0.23
579	0.24
580	0.25
581	0.25
582	0.27
583	0.26
584	0.28
585	0.31
586	0.29
587	0.3
588	0.27
589	0.27
590	0.29
591	0.27
592	0.28
593	0.31
594	0.34
595	0.41
596	0.5
597	0.58
598	0.64
599	0.72
600	0.78
601	0.81
602	0.85
603	0.83
604	0.8
605	0.79
606	0.75
607	0.75
608	0.68
609	0.59
610	0.5
611	0.43
612	0.37
613	0.29
614	0.24
615	0.17
616	0.14
617	0.16
618	0.18
619	0.2
620	0.25
621	0.27
622	0.31
623	0.34
624	0.39
625	0.39
626	0.45
627	0.52
628	0.53
629	0.55
630	0.56
631	0.6
632	0.61
633	0.63
634	0.58
635	0.59
636	0.56
637	0.58
638	0.57
639	0.56
640	0.53
641	0.51
642	0.54
643	0.54
644	0.53
645	0.51
646	0.55
647	0.55
648	0.58
649	0.59
650	0.6
651	0.56
652	0.58
653	0.61
654	0.58
655	0.54
656	0.49
657	0.48
658	0.41
659	0.38
660	0.34
661	0.26
662	0.2
663	0.17
664	0.15
665	0.13
666	0.12
667	0.12
668	0.15
669	0.22
670	0.25
671	0.24
672	0.24
673	0.26
674	0.3
675	0.31
676	0.3
677	0.3
678	0.3
679	0.3
680	0.3
681	0.27
682	0.22
683	0.2
684	0.17
685	0.11
686	0.11
687	0.11
688	0.1
689	0.11
690	0.11
691	0.12
692	0.19
693	0.21
694	0.21
695	0.26
696	0.27
697	0.31
698	0.34
699	0.37
700	0.32
701	0.32
702	0.35
703	0.36
704	0.35
705	0.31
706	0.31
707	0.33
708	0.35
709	0.32
710	0.28
711	0.26
712	0.28
713	0.29
714	0.28
715	0.31
716	0.32
717	0.39
718	0.43
719	0.42
720	0.42
721	0.41
722	0.46
723	0.43
724	0.47
725	0.48
726	0.46
727	0.5
728	0.55
729	0.58
730	0.53
731	0.52
732	0.53
733	0.49
734	0.48
735	0.45
736	0.39
737	0.37
738	0.37
739	0.33
740	0.27
741	0.22
742	0.21
743	0.23
744	0.25
745	0.25

F4NRI1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer