FuNGI

F4PBJ7

Protein Details

Accession

F4PBJ7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
554-579	TASEPVHRMRKHKRVSKNGVQNDKCQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR014789 PolyA-riboNase_RNA-binding IPR036867 R3H_dom_sf IPR006941 RNase_CAF1 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0004535 F:poly(A)-specific ribonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000289 P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
Pfam	View protein in Pfam PF04857 CAF1 PF08675 RNA_bind
CDD	cd12428 RRM_PARN

Amino Acid Sequences

MEVVQSNFEEVLDSVREAIENADFIAVDTEFTGLGLTPNERLSLLDTPQERYLKHRSAARLFEPIQIGLAAFKWDAEQGVYMSKPFNFNIYPRTGNKFFGLDRTFCVQISSLEFLEGNGFDFNKWIREGIPFVSITEEAAIRKKLETINTESDIVIDEKNTEYVKDFIESVQKWLCETTDESYSISTSNSFHKRLIHQEIKKQFPGQVSTESTKSGVNLKRLQANQKDSSHTESRQALLKAELDLLVGFRKVIDIMVAAQKPIVGHNMSLDLFHIIHRFIQPLPDTWEEYKDIVNRNFPSVFDTKFMAISNKNLQTAIINTTLGNLYDSILKEPFDAPSIKLAMGFDSYANDVRELHKAGFDAYISGVSFLKMLGLVDSLPVSTSIDWTSDFSLHCKNKLYIMYSDIPFLNLSGIEEIPDRSNVFYLSEFLPTWKTRDILNKFKEFGGITVKWINDTSCLIIVRDRKMVTVAERFCTSQDTDYKLRIWDGSHTQTPGSPKASASSPFLAAANPDTDVSTSDKLSTLISKKEVMAEPKSEIQSSVKRRREEYTGTASEPVHRMRKHKRVSKNGVQNDKCQMM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.12
4	0.11
5	0.13
6	0.11
7	0.09
8	0.1
9	0.09
10	0.09
11	0.09
12	0.11
13	0.09
14	0.08
15	0.08
16	0.08
17	0.07
18	0.07
19	0.07
20	0.05
21	0.07
22	0.08
23	0.1
24	0.11
25	0.12
26	0.13
27	0.13
28	0.14
29	0.17
30	0.19
31	0.2
32	0.24
33	0.25
34	0.28
35	0.35
36	0.37
37	0.33
38	0.35
39	0.43
40	0.43
41	0.46
42	0.49
43	0.51
44	0.56
45	0.62
46	0.59
47	0.58
48	0.53
49	0.53
50	0.48
51	0.4
52	0.33
53	0.26
54	0.23
55	0.15
56	0.14
57	0.11
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.1
65	0.09
66	0.13
67	0.13
68	0.13
69	0.15
70	0.16
71	0.18
72	0.17
73	0.21
74	0.2
75	0.22
76	0.27
77	0.31
78	0.36
79	0.36
80	0.44
81	0.42
82	0.42
83	0.41
84	0.39
85	0.34
86	0.37
87	0.37
88	0.3
89	0.31
90	0.33
91	0.32
92	0.28
93	0.29
94	0.21
95	0.19
96	0.21
97	0.21
98	0.17
99	0.16
100	0.16
101	0.15
102	0.16
103	0.14
104	0.11
105	0.09
106	0.1
107	0.09
108	0.11
109	0.12
110	0.13
111	0.13
112	0.13
113	0.13
114	0.15
115	0.17
116	0.17
117	0.2
118	0.17
119	0.17
120	0.18
121	0.17
122	0.15
123	0.14
124	0.13
125	0.11
126	0.14
127	0.15
128	0.14
129	0.14
130	0.18
131	0.19
132	0.23
133	0.27
134	0.31
135	0.35
136	0.36
137	0.37
138	0.33
139	0.3
140	0.27
141	0.23
142	0.16
143	0.1
144	0.09
145	0.09
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.11
150	0.13
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.12
155	0.2
156	0.2
157	0.22
158	0.23
159	0.22
160	0.21
161	0.22
162	0.2
163	0.15
164	0.16
165	0.15
166	0.16
167	0.16
168	0.16
169	0.16
170	0.16
171	0.14
172	0.12
173	0.11
174	0.09
175	0.16
176	0.21
177	0.22
178	0.24
179	0.28
180	0.31
181	0.38
182	0.46
183	0.48
184	0.48
185	0.55
186	0.61
187	0.62
188	0.61
189	0.54
190	0.48
191	0.41
192	0.4
193	0.34
194	0.31
195	0.3
196	0.3
197	0.29
198	0.26
199	0.24
200	0.2
201	0.19
202	0.22
203	0.22
204	0.26
205	0.3
206	0.31
207	0.37
208	0.4
209	0.47
210	0.46
211	0.49
212	0.49
213	0.47
214	0.48
215	0.44
216	0.47
217	0.43
218	0.37
219	0.36
220	0.3
221	0.29
222	0.31
223	0.29
224	0.24
225	0.21
226	0.21
227	0.16
228	0.15
229	0.14
230	0.09
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.06
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.1
244	0.11
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.12
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.07
263	0.08
264	0.09
265	0.1
266	0.09
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.17
271	0.17
272	0.19
273	0.18
274	0.2
275	0.18
276	0.18
277	0.19
278	0.17
279	0.21
280	0.2
281	0.24
282	0.23
283	0.24
284	0.24
285	0.22
286	0.24
287	0.21
288	0.2
289	0.16
290	0.17
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.14
295	0.12
296	0.15
297	0.19
298	0.2
299	0.2
300	0.19
301	0.19
302	0.17
303	0.18
304	0.17
305	0.12
306	0.1
307	0.1
308	0.11
309	0.11
310	0.1
311	0.09
312	0.06
313	0.06
314	0.08
315	0.09
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.13
326	0.13
327	0.12
328	0.13
329	0.12
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.11
341	0.14
342	0.15
343	0.14
344	0.13
345	0.13
346	0.14
347	0.14
348	0.12
349	0.09
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.08
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.08
375	0.09
376	0.1
377	0.11
378	0.12
379	0.13
380	0.21
381	0.22
382	0.24
383	0.27
384	0.26
385	0.29
386	0.32
387	0.33
388	0.26
389	0.29
390	0.32
391	0.28
392	0.3
393	0.25
394	0.23
395	0.19
396	0.17
397	0.13
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.1
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.11
413	0.12
414	0.12
415	0.13
416	0.13
417	0.14
418	0.18
419	0.17
420	0.2
421	0.2
422	0.2
423	0.21
424	0.31
425	0.38
426	0.43
427	0.49
428	0.51
429	0.51
430	0.5
431	0.49
432	0.4
433	0.34
434	0.32
435	0.25
436	0.23
437	0.26
438	0.25
439	0.23
440	0.24
441	0.22
442	0.16
443	0.17
444	0.16
445	0.15
446	0.16
447	0.15
448	0.19
449	0.24
450	0.25
451	0.29
452	0.27
453	0.25
454	0.26
455	0.28
456	0.29
457	0.33
458	0.32
459	0.3
460	0.31
461	0.31
462	0.3
463	0.3
464	0.27
465	0.24
466	0.26
467	0.29
468	0.31
469	0.33
470	0.34
471	0.32
472	0.32
473	0.28
474	0.25
475	0.25
476	0.29
477	0.32
478	0.34
479	0.34
480	0.33
481	0.34
482	0.37
483	0.36
484	0.32
485	0.27
486	0.24
487	0.25
488	0.29
489	0.28
490	0.29
491	0.26
492	0.24
493	0.24
494	0.24
495	0.21
496	0.19
497	0.19
498	0.15
499	0.13
500	0.12
501	0.11
502	0.12
503	0.13
504	0.16
505	0.16
506	0.16
507	0.16
508	0.16
509	0.16
510	0.18
511	0.23
512	0.23
513	0.26
514	0.28
515	0.29
516	0.3
517	0.36
518	0.39
519	0.38
520	0.39
521	0.37
522	0.38
523	0.42
524	0.44
525	0.38
526	0.35
527	0.35
528	0.39
529	0.46
530	0.53
531	0.54
532	0.57
533	0.6
534	0.63
535	0.64
536	0.62
537	0.59
538	0.58
539	0.54
540	0.51
541	0.52
542	0.47
543	0.45
544	0.42
545	0.41
546	0.4
547	0.41
548	0.48
549	0.55
550	0.65
551	0.71
552	0.76
553	0.8
554	0.82
555	0.88
556	0.9
557	0.9
558	0.89
559	0.9
560	0.84
561	0.8

F4PBJ7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer