Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UK55

Protein Details
Accession A0A642UK55    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-51ERVTLKGDKVEKKEKKEKKEKKDKKEKKDKKEKKKDKQDKIDAKDTDBasic
82-101LEKLEKKHPKPKPATEDGKDBasic
336-359VAATARPPVKRRRPDDHHQQPSTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-41KVEKKEKKEKKEKKDKKEKKDKKEKKKDK
71-94QQRLLKKGKLDLEKLEKKHPKPKP
295-300KRAPKR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034226  Nop13/Rnp24_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12397  RRM2_Nop13p_fungi  
Amino Acid Sequences MSDEERVTLKGDKVEKKEKKEKKEKKDKKEKKDKKEKKKDKQDKIDAKDTDEAGDEIEIDLNASVPLNKKQQRLLKKGKLDLEKLEKKHPKPKPATEDGKDDAEPKRSPFGVWIGNLSFDTTKDDLVRFIVAKSAEQGTSVTEEDISRVNIPKKENKIKGFAYVDLPSADHVASVVALSESALNGRKLLIKDSTSFEGRPSKQEAALSKNPPSRILFVGNLSFDTSEDNLREHFGHCGDIVRVRMATFEDSGKCKGFAFIDFKDESGPTTALKSKVAKTLINRKLRLEYGEDRSKRAPKRPHPAITDADAETHVNPSEGAGFEPRAGAPVSRERDVAATARPPVKRRRPDDHHQQPSTRLKSSVALAQAPRASAAIVESTGTKIKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.64
3 0.7
4 0.78
5 0.81
6 0.83
7 0.87
8 0.89
9 0.89
10 0.92
11 0.93
12 0.94
13 0.96
14 0.95
15 0.95
16 0.96
17 0.95
18 0.95
19 0.96
20 0.95
21 0.95
22 0.96
23 0.96
24 0.96
25 0.97
26 0.97
27 0.96
28 0.96
29 0.96
30 0.95
31 0.91
32 0.89
33 0.79
34 0.73
35 0.67
36 0.56
37 0.46
38 0.37
39 0.29
40 0.2
41 0.18
42 0.14
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.08
52 0.1
53 0.16
54 0.25
55 0.31
56 0.35
57 0.42
58 0.51
59 0.59
60 0.67
61 0.72
62 0.72
63 0.74
64 0.77
65 0.78
66 0.76
67 0.69
68 0.67
69 0.66
70 0.65
71 0.6
72 0.64
73 0.65
74 0.64
75 0.7
76 0.7
77 0.7
78 0.71
79 0.78
80 0.77
81 0.77
82 0.8
83 0.74
84 0.73
85 0.65
86 0.59
87 0.5
88 0.44
89 0.37
90 0.34
91 0.32
92 0.28
93 0.29
94 0.26
95 0.26
96 0.25
97 0.27
98 0.25
99 0.24
100 0.25
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.15
106 0.11
107 0.16
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.16
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.12
127 0.12
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.14
136 0.17
137 0.21
138 0.24
139 0.31
140 0.39
141 0.48
142 0.54
143 0.53
144 0.55
145 0.52
146 0.55
147 0.5
148 0.42
149 0.35
150 0.29
151 0.26
152 0.2
153 0.19
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.15
177 0.14
178 0.16
179 0.19
180 0.21
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.24
185 0.24
186 0.25
187 0.27
188 0.25
189 0.25
190 0.28
191 0.28
192 0.28
193 0.34
194 0.33
195 0.34
196 0.36
197 0.36
198 0.35
199 0.35
200 0.3
201 0.25
202 0.25
203 0.21
204 0.19
205 0.2
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.12
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.12
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.12
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.1
235 0.13
236 0.14
237 0.17
238 0.19
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.18
245 0.21
246 0.19
247 0.23
248 0.23
249 0.23
250 0.23
251 0.22
252 0.18
253 0.15
254 0.15
255 0.1
256 0.13
257 0.17
258 0.17
259 0.21
260 0.23
261 0.23
262 0.29
263 0.31
264 0.32
265 0.35
266 0.45
267 0.5
268 0.55
269 0.55
270 0.51
271 0.53
272 0.52
273 0.47
274 0.43
275 0.4
276 0.4
277 0.48
278 0.46
279 0.45
280 0.49
281 0.55
282 0.55
283 0.58
284 0.6
285 0.61
286 0.7
287 0.76
288 0.78
289 0.76
290 0.75
291 0.69
292 0.62
293 0.56
294 0.45
295 0.37
296 0.3
297 0.25
298 0.2
299 0.18
300 0.14
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.13
314 0.12
315 0.14
316 0.22
317 0.27
318 0.27
319 0.28
320 0.27
321 0.28
322 0.29
323 0.27
324 0.22
325 0.21
326 0.26
327 0.32
328 0.35
329 0.4
330 0.48
331 0.57
332 0.63
333 0.67
334 0.73
335 0.75
336 0.81
337 0.86
338 0.86
339 0.86
340 0.83
341 0.78
342 0.76
343 0.78
344 0.74
345 0.66
346 0.56
347 0.48
348 0.45
349 0.44
350 0.4
351 0.34
352 0.33
353 0.31
354 0.35
355 0.35
356 0.31
357 0.29
358 0.24
359 0.2
360 0.14
361 0.15
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.13
367 0.18