Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UP05

Protein Details
Accession A0A642UP05    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-48TSNTNLTKHRPTAKKRAGKSLGHydrophilic
92-127KLMPQKRLPKVASKRFPKKTPRKTSKHQKFNYDDLAHydrophilic
212-237LQLQHKAKRYSPKKSQRPQLPRKYESHydrophilic
639-670FNEGSKQKVYKRSGKAKTARKLARRRQSISEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-48RPTAKKRAGKSLG
97-117KRLPKVASKRFPKKTPRKTSK
646-664KVYKRSGKAKTARKLARRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018837  TF_CRF1/IFH1  
Gene Ontology GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10380  CRF1  
Amino Acid Sequences MAKSPRKECAPVGGKKIPSYAGFPTPTSNTNLTKHRPTAKKRAGKSLGPHHFQPAGKRLGSTPSRRFSIVDSPSDDDDDDDDDSQVVVSMPKLMPQKRLPKVASKRFPKKTPRKTSKHQKFNYDDLASSSDDDAMDLADSDDDEQSNANDRDNDDEDDDDASDASSVSIDFSFMNAAAARRKSVASQFDSGDDSSDSGDNSSSDSDVDFVKLQLQHKAKRYSPKKSQRPQLPRKYESAIASSDSESELSDVPSAESSTTSVEPPKFGRRKSDAVLPDDINFTFDFDDSTQHSTLLPDGLEVNGNINEDLGEDLGEDLGEDLSTPPDLPVLPQSLDMVDFDLAVPKITDANSDEEYEFDDNELLATLHADDDILDSPATSEPSRTRNNSINSLDDDDEQKFLREEEKYLVNEFETNGFDDEVDDSDEDMSEQELIDFGEDYMPNPEDKITSRSKSASDEDDDSYMWNYFFSTKSDEEESEARAQAAAYENAILSSDEDNLGMGAADGYESSDSTDVDENLPSTTTNAKVAQKAKEVLSSTTTDYRPPVLGTWMTVDSKPFGIIDGLSTRVLNGHEPRKSRKSVSVPTNVDDPLGLDELLNVSELDDSETDVKIWQDFNSRAKVPLGAFRNKSTGLATPVFNEGSKQKVYKRSGKAKTARKLARRRQSISEAIQEGYRPTKSGLFAEHILGDVEEVMGDDREFMNLIKGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.56
3 0.57
4 0.5
5 0.42
6 0.4
7 0.36
8 0.36
9 0.35
10 0.34
11 0.36
12 0.36
13 0.36
14 0.37
15 0.37
16 0.35
17 0.38
18 0.46
19 0.48
20 0.53
21 0.58
22 0.63
23 0.67
24 0.71
25 0.77
26 0.79
27 0.82
28 0.79
29 0.82
30 0.79
31 0.76
32 0.76
33 0.76
34 0.75
35 0.7
36 0.66
37 0.61
38 0.6
39 0.55
40 0.54
41 0.51
42 0.48
43 0.44
44 0.43
45 0.4
46 0.43
47 0.49
48 0.51
49 0.52
50 0.51
51 0.53
52 0.53
53 0.53
54 0.48
55 0.5
56 0.46
57 0.42
58 0.4
59 0.41
60 0.41
61 0.41
62 0.36
63 0.27
64 0.22
65 0.19
66 0.17
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.11
77 0.11
78 0.16
79 0.24
80 0.26
81 0.34
82 0.42
83 0.52
84 0.54
85 0.63
86 0.62
87 0.65
88 0.73
89 0.76
90 0.77
91 0.77
92 0.81
93 0.81
94 0.87
95 0.88
96 0.88
97 0.89
98 0.9
99 0.9
100 0.89
101 0.91
102 0.93
103 0.93
104 0.93
105 0.88
106 0.87
107 0.82
108 0.8
109 0.78
110 0.69
111 0.58
112 0.5
113 0.46
114 0.36
115 0.31
116 0.24
117 0.16
118 0.14
119 0.13
120 0.1
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.17
137 0.18
138 0.24
139 0.26
140 0.27
141 0.21
142 0.21
143 0.2
144 0.19
145 0.19
146 0.13
147 0.1
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.08
162 0.07
163 0.09
164 0.14
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.17
169 0.19
170 0.24
171 0.3
172 0.29
173 0.31
174 0.31
175 0.31
176 0.32
177 0.29
178 0.24
179 0.18
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.08
185 0.09
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.12
198 0.15
199 0.16
200 0.24
201 0.3
202 0.34
203 0.42
204 0.49
205 0.49
206 0.57
207 0.64
208 0.66
209 0.71
210 0.76
211 0.79
212 0.81
213 0.85
214 0.85
215 0.88
216 0.89
217 0.89
218 0.88
219 0.8
220 0.75
221 0.69
222 0.63
223 0.54
224 0.46
225 0.36
226 0.28
227 0.26
228 0.22
229 0.18
230 0.14
231 0.12
232 0.1
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.13
248 0.13
249 0.15
250 0.18
251 0.28
252 0.31
253 0.31
254 0.39
255 0.41
256 0.45
257 0.46
258 0.5
259 0.45
260 0.43
261 0.46
262 0.38
263 0.33
264 0.3
265 0.27
266 0.21
267 0.16
268 0.13
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.09
274 0.1
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.06
296 0.04
297 0.04
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.11
344 0.08
345 0.07
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.04
350 0.03
351 0.04
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.07
366 0.09
367 0.11
368 0.17
369 0.22
370 0.23
371 0.27
372 0.32
373 0.35
374 0.4
375 0.39
376 0.36
377 0.33
378 0.33
379 0.3
380 0.24
381 0.23
382 0.17
383 0.16
384 0.14
385 0.13
386 0.1
387 0.1
388 0.12
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.17
393 0.18
394 0.19
395 0.19
396 0.16
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.09
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.11
434 0.16
435 0.19
436 0.2
437 0.23
438 0.25
439 0.26
440 0.28
441 0.29
442 0.28
443 0.25
444 0.26
445 0.25
446 0.24
447 0.23
448 0.19
449 0.18
450 0.14
451 0.11
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.14
458 0.14
459 0.17
460 0.2
461 0.19
462 0.21
463 0.21
464 0.23
465 0.21
466 0.2
467 0.17
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.14
472 0.12
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.07
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.05
488 0.04
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.08
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.09
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.14
512 0.18
513 0.21
514 0.27
515 0.32
516 0.35
517 0.37
518 0.39
519 0.37
520 0.37
521 0.36
522 0.31
523 0.29
524 0.27
525 0.26
526 0.28
527 0.28
528 0.24
529 0.24
530 0.24
531 0.22
532 0.21
533 0.19
534 0.17
535 0.17
536 0.16
537 0.18
538 0.19
539 0.19
540 0.19
541 0.19
542 0.16
543 0.16
544 0.16
545 0.13
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.11
550 0.11
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.12
555 0.13
556 0.14
557 0.17
558 0.22
559 0.28
560 0.33
561 0.38
562 0.47
563 0.53
564 0.57
565 0.56
566 0.58
567 0.6
568 0.64
569 0.67
570 0.69
571 0.65
572 0.62
573 0.61
574 0.52
575 0.42
576 0.33
577 0.25
578 0.17
579 0.15
580 0.13
581 0.09
582 0.09
583 0.1
584 0.1
585 0.09
586 0.07
587 0.06
588 0.06
589 0.07
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.12
597 0.12
598 0.12
599 0.13
600 0.14
601 0.2
602 0.24
603 0.29
604 0.35
605 0.35
606 0.36
607 0.36
608 0.38
609 0.32
610 0.35
611 0.37
612 0.39
613 0.41
614 0.42
615 0.45
616 0.42
617 0.41
618 0.35
619 0.32
620 0.3
621 0.29
622 0.27
623 0.25
624 0.27
625 0.27
626 0.25
627 0.23
628 0.2
629 0.22
630 0.26
631 0.28
632 0.32
633 0.41
634 0.49
635 0.56
636 0.64
637 0.7
638 0.74
639 0.81
640 0.83
641 0.84
642 0.85
643 0.86
644 0.85
645 0.84
646 0.86
647 0.86
648 0.87
649 0.87
650 0.83
651 0.8
652 0.79
653 0.77
654 0.71
655 0.69
656 0.6
657 0.52
658 0.47
659 0.4
660 0.35
661 0.32
662 0.28
663 0.21
664 0.21
665 0.25
666 0.26
667 0.28
668 0.29
669 0.29
670 0.3
671 0.3
672 0.28
673 0.24
674 0.22
675 0.19
676 0.15
677 0.1
678 0.08
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.07
684 0.08
685 0.08
686 0.09
687 0.1
688 0.1