Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4P422

Protein Details
Accession F4P422    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
404-427FFASKATTIHNRKRQRHADYSNGNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MTDINSNVSLPLSVELSHNNSDTMNADSIQNVESKSLILATDCSADAPVVDSSQANPVELDMDIDESQPRAFVESGAYTDQDQFGNADDQEMQDADRQDRTGRSDDHSKDDDKEAANIMDLMHHQQESRFSHAAACAKDLDDDTLQSAFGSDIDDLEENMDDLGNDSDFHTTPQPTVPLADDDYNINDSENDDDVADSEDRAAQARDDDLDGESDDDEEFKASVAGRPNKVNPTGYTNISDASHPTGRSLRLQGKSPIKKIDMIAEIETASADYTRGASTSADEEDLNADILPGLGLDKEDAKKARELMQIARQDARKAQELTEDSFEKLYDLKMEELQLEISLITSGKHPECMQQLAEIETRKELRLRETADRLGYKISNCEAAYEAATAILARYSHCFLVPFFASKATTIHNRKRQRHADYSNGNVREDFEERVPTWARVVLRNRNNNQSSKPPGEIPAQVFLPNPCIGLDENEIEQDVLAMNSAIRGFLDVDNNQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.2
4 0.22
5 0.22
6 0.21
7 0.2
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.17
12 0.15
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.09
26 0.1
27 0.11
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.11
35 0.1
36 0.08
37 0.1
38 0.09
39 0.1
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.08
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.13
61 0.13
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.15
66 0.17
67 0.18
68 0.14
69 0.14
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.11
80 0.12
81 0.15
82 0.15
83 0.17
84 0.18
85 0.19
86 0.22
87 0.26
88 0.28
89 0.28
90 0.31
91 0.39
92 0.41
93 0.45
94 0.46
95 0.43
96 0.41
97 0.41
98 0.4
99 0.31
100 0.3
101 0.25
102 0.22
103 0.2
104 0.17
105 0.14
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.2
114 0.22
115 0.28
116 0.26
117 0.24
118 0.26
119 0.3
120 0.33
121 0.27
122 0.25
123 0.2
124 0.19
125 0.2
126 0.18
127 0.17
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.09
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.12
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.08
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.1
183 0.09
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.08
211 0.15
212 0.2
213 0.22
214 0.24
215 0.27
216 0.3
217 0.31
218 0.3
219 0.24
220 0.27
221 0.27
222 0.26
223 0.25
224 0.22
225 0.21
226 0.2
227 0.19
228 0.13
229 0.14
230 0.15
231 0.12
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.17
236 0.22
237 0.25
238 0.24
239 0.27
240 0.33
241 0.41
242 0.44
243 0.45
244 0.45
245 0.39
246 0.39
247 0.37
248 0.35
249 0.27
250 0.24
251 0.22
252 0.18
253 0.17
254 0.14
255 0.13
256 0.08
257 0.06
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.07
286 0.08
287 0.11
288 0.13
289 0.15
290 0.17
291 0.19
292 0.25
293 0.26
294 0.28
295 0.29
296 0.35
297 0.37
298 0.37
299 0.39
300 0.33
301 0.31
302 0.32
303 0.3
304 0.28
305 0.26
306 0.24
307 0.27
308 0.28
309 0.29
310 0.3
311 0.28
312 0.23
313 0.22
314 0.21
315 0.15
316 0.14
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.1
335 0.1
336 0.13
337 0.13
338 0.17
339 0.2
340 0.23
341 0.22
342 0.2
343 0.21
344 0.21
345 0.24
346 0.21
347 0.18
348 0.19
349 0.2
350 0.19
351 0.22
352 0.2
353 0.22
354 0.28
355 0.32
356 0.36
357 0.39
358 0.42
359 0.43
360 0.43
361 0.39
362 0.35
363 0.33
364 0.27
365 0.25
366 0.22
367 0.22
368 0.21
369 0.22
370 0.2
371 0.18
372 0.18
373 0.15
374 0.14
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.09
383 0.11
384 0.12
385 0.13
386 0.14
387 0.13
388 0.18
389 0.19
390 0.19
391 0.17
392 0.19
393 0.19
394 0.19
395 0.2
396 0.19
397 0.27
398 0.34
399 0.43
400 0.51
401 0.6
402 0.68
403 0.77
404 0.83
405 0.82
406 0.83
407 0.8
408 0.8
409 0.77
410 0.77
411 0.75
412 0.67
413 0.59
414 0.48
415 0.44
416 0.38
417 0.33
418 0.28
419 0.21
420 0.25
421 0.24
422 0.3
423 0.3
424 0.26
425 0.26
426 0.27
427 0.27
428 0.3
429 0.38
430 0.43
431 0.5
432 0.6
433 0.64
434 0.7
435 0.74
436 0.71
437 0.68
438 0.67
439 0.66
440 0.61
441 0.59
442 0.51
443 0.49
444 0.48
445 0.48
446 0.42
447 0.38
448 0.34
449 0.32
450 0.31
451 0.28
452 0.28
453 0.23
454 0.2
455 0.15
456 0.16
457 0.16
458 0.18
459 0.21
460 0.19
461 0.19
462 0.19
463 0.2
464 0.18
465 0.16
466 0.13
467 0.09
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.07
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.11
478 0.13
479 0.2