Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A642UJB8

Protein Details
Accession A0A642UJB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-42ARQRDAGESTRRRRSRKRRSSTTEEGKPTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-31RRRRSRKRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
Amino Acid Sequences MDFSSLIGHEIEARQRDAGESTRRRRSRKRRSSTTEEGKPTDGDNDETSTAPSAPDAAPAPAPTDLLDIPREPQSIDEQLQVFDEDPTGLSEAAKIDRLHYLVRQEKYKQFLAAEASATATAITSTDIAHGDHQRLALRVRKFLKSTVLQWQAIEPESPLLKTVKIDFVKLFYKLRAHKLSPDVLTSLATVVHYLQRHDYHGATESYYQMSIGNVAWPIGIRDVGIHARSNDDKTTKAMANIMASDTTRRWMVSVKRVITWCETVTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.23
4 0.24
5 0.28
6 0.33
7 0.39
8 0.47
9 0.57
10 0.64
11 0.71
12 0.79
13 0.84
14 0.85
15 0.86
16 0.88
17 0.89
18 0.91
19 0.91
20 0.91
21 0.9
22 0.87
23 0.82
24 0.74
25 0.65
26 0.56
27 0.47
28 0.41
29 0.32
30 0.26
31 0.22
32 0.22
33 0.21
34 0.2
35 0.2
36 0.17
37 0.16
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.09
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.15
48 0.12
49 0.13
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.12
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.15
61 0.18
62 0.2
63 0.21
64 0.22
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.19
69 0.15
70 0.11
71 0.1
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.16
88 0.22
89 0.26
90 0.29
91 0.32
92 0.35
93 0.37
94 0.41
95 0.41
96 0.34
97 0.28
98 0.27
99 0.26
100 0.22
101 0.18
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.05
108 0.04
109 0.03
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.18
125 0.18
126 0.23
127 0.26
128 0.28
129 0.29
130 0.3
131 0.33
132 0.29
133 0.31
134 0.34
135 0.36
136 0.33
137 0.32
138 0.31
139 0.26
140 0.24
141 0.21
142 0.12
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.11
151 0.17
152 0.17
153 0.19
154 0.18
155 0.21
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.19
160 0.25
161 0.27
162 0.35
163 0.37
164 0.37
165 0.4
166 0.43
167 0.45
168 0.4
169 0.37
170 0.3
171 0.25
172 0.23
173 0.18
174 0.14
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.16
183 0.17
184 0.2
185 0.22
186 0.22
187 0.19
188 0.22
189 0.22
190 0.19
191 0.18
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.06
209 0.07
210 0.1
211 0.14
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.22
216 0.25
217 0.27
218 0.29
219 0.28
220 0.28
221 0.29
222 0.34
223 0.31
224 0.29
225 0.29
226 0.26
227 0.26
228 0.25
229 0.23
230 0.19
231 0.18
232 0.19
233 0.17
234 0.18
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.22
239 0.29
240 0.36
241 0.44
242 0.44
243 0.49
244 0.51
245 0.53
246 0.51
247 0.48