FuNGI

F4NY80

Protein Details

Accession

F4NY80

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
62-81	GAQSRKTKCKQEQAARDDIQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 3, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019188 SNAPC1
Gene Ontology	GO:0019185 C:snRNA-activating protein complex GO:0043565 F:sequence-specific DNA binding GO:0042795 P:snRNA transcription by RNA polymerase II GO:0042796 P:snRNA transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF09808 SNAPC1

Amino Acid Sequences

MPRDATQAIAAAAPRKRNIRVNGTNKINLARYARRTSSEQISSSGIDKTVSGVNGISIRGLGAQSRKTKCKQEQAARDDIQSLLSRFSLRQSASLQDFRDDWRALGFFRIHTVATNSETYELILRTFYVALLELLDSCTSPYQQAGICFALYALFFSRPSSKPILLIHISPRQMHLVLNIQSACVKCNMFEAVSAITNLLGADAFLIVPYNVKAGGLSFPYFEPNIPRKDLSVSAISPHALYIRELVNDTFFKKSNVLSNMDDWNTYDHFMSQYTNLKKLLPQSITATLVQNDDDSKDPLLLHSKLYLYENTPSIVTNTIDPRFADTVRQTVDTYESIKQQRINILSSLTSKNHTMPFVYSDTPTDKGIAVSTALNDGDLLSPAMSIPIEPIKAFASSDDATLQPSYVRHSSEIGNSLESSVPLGTQATQDYTRHNVLIENLMAGLEFAGSSEFDVETFGKRGTDSLKFVYHVPSDESDNEYMDDTYY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.36
3	0.42
4	0.49
5	0.55
6	0.59
7	0.66
8	0.7
9	0.74
10	0.76
11	0.74
12	0.67
13	0.64
14	0.55
15	0.5
16	0.48
17	0.47
18	0.47
19	0.51
20	0.52
21	0.52
22	0.54
23	0.55
24	0.57
25	0.54
26	0.48
27	0.43
28	0.42
29	0.39
30	0.35
31	0.31
32	0.22
33	0.17
34	0.15
35	0.15
36	0.16
37	0.15
38	0.14
39	0.12
40	0.14
41	0.15
42	0.15
43	0.13
44	0.09
45	0.09
46	0.1
47	0.1
48	0.12
49	0.15
50	0.22
51	0.31
52	0.38
53	0.45
54	0.5
55	0.6
56	0.65
57	0.71
58	0.74
59	0.76
60	0.79
61	0.78
62	0.82
63	0.73
64	0.66
65	0.56
66	0.46
67	0.39
68	0.31
69	0.26
70	0.18
71	0.17
72	0.17
73	0.16
74	0.19
75	0.22
76	0.19
77	0.22
78	0.23
79	0.28
80	0.32
81	0.36
82	0.34
83	0.3
84	0.3
85	0.3
86	0.34
87	0.29
88	0.23
89	0.21
90	0.21
91	0.2
92	0.23
93	0.22
94	0.16
95	0.18
96	0.19
97	0.16
98	0.16
99	0.18
100	0.16
101	0.18
102	0.19
103	0.16
104	0.16
105	0.16
106	0.15
107	0.15
108	0.13
109	0.11
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.07
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.06
121	0.07
122	0.07
123	0.06
124	0.06
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.08
129	0.09
130	0.1
131	0.11
132	0.14
133	0.14
134	0.13
135	0.13
136	0.12
137	0.11
138	0.09
139	0.09
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.1
144	0.16
145	0.16
146	0.21
147	0.24
148	0.23
149	0.26
150	0.27
151	0.31
152	0.27
153	0.28
154	0.29
155	0.3
156	0.31
157	0.28
158	0.28
159	0.24
160	0.23
161	0.21
162	0.18
163	0.19
164	0.19
165	0.21
166	0.2
167	0.18
168	0.2
169	0.19
170	0.18
171	0.14
172	0.12
173	0.1
174	0.11
175	0.12
176	0.1
177	0.1
178	0.11
179	0.1
180	0.1
181	0.1
182	0.08
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.06
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.15
211	0.18
212	0.21
213	0.22
214	0.22
215	0.21
216	0.23
217	0.24
218	0.2
219	0.18
220	0.16
221	0.15
222	0.15
223	0.14
224	0.12
225	0.11
226	0.1
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.13
240	0.13
241	0.14
242	0.18
243	0.2
244	0.23
245	0.22
246	0.24
247	0.26
248	0.25
249	0.24
250	0.18
251	0.17
252	0.14
253	0.13
254	0.11
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.1
259	0.1
260	0.18
261	0.19
262	0.21
263	0.21
264	0.21
265	0.23
266	0.26
267	0.3
268	0.24
269	0.24
270	0.24
271	0.26
272	0.27
273	0.27
274	0.23
275	0.17
276	0.17
277	0.15
278	0.12
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.1
286	0.11
287	0.15
288	0.15
289	0.14
290	0.15
291	0.15
292	0.15
293	0.17
294	0.17
295	0.14
296	0.16
297	0.16
298	0.15
299	0.14
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.12
304	0.12
305	0.16
306	0.16
307	0.17
308	0.17
309	0.2
310	0.2
311	0.2
312	0.21
313	0.18
314	0.21
315	0.21
316	0.23
317	0.19
318	0.18
319	0.21
320	0.18
321	0.2
322	0.18
323	0.22
324	0.23
325	0.26
326	0.28
327	0.28
328	0.32
329	0.32
330	0.31
331	0.26
332	0.25
333	0.24
334	0.25
335	0.26
336	0.22
337	0.21
338	0.2
339	0.23
340	0.24
341	0.23
342	0.21
343	0.19
344	0.21
345	0.23
346	0.23
347	0.2
348	0.2
349	0.22
350	0.23
351	0.22
352	0.19
353	0.16
354	0.15
355	0.14
356	0.12
357	0.11
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.07
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.12
379	0.12
380	0.13
381	0.13
382	0.11
383	0.14
384	0.14
385	0.15
386	0.15
387	0.14
388	0.15
389	0.15
390	0.15
391	0.11
392	0.12
393	0.16
394	0.17
395	0.19
396	0.19
397	0.21
398	0.23
399	0.26
400	0.3
401	0.26
402	0.25
403	0.23
404	0.23
405	0.21
406	0.19
407	0.16
408	0.11
409	0.09
410	0.08
411	0.09
412	0.08
413	0.09
414	0.11
415	0.14
416	0.17
417	0.18
418	0.21
419	0.26
420	0.28
421	0.26
422	0.25
423	0.23
424	0.23
425	0.27
426	0.23
427	0.18
428	0.15
429	0.15
430	0.14
431	0.12
432	0.1
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.09
443	0.1
444	0.12
445	0.14
446	0.15
447	0.14
448	0.14
449	0.17
450	0.2
451	0.25
452	0.27
453	0.29
454	0.32
455	0.33
456	0.34
457	0.38
458	0.35
459	0.31
460	0.3
461	0.28
462	0.29
463	0.3
464	0.33
465	0.28
466	0.27
467	0.26
468	0.23

F4NY80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer