Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NRC7

Protein Details
Accession F4NRC7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32ASEVSPVRHRSRKSNPNRSIQRISTHydrophilic
379-398GVYRSTKQSRKGGRRCVINKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MPVVADFASEVSPVRHRSRKSNPNRSIQRISTGAQPALSSNNIGMGAFQTNNSISTHIGIETHWGAPSHGGLPISPPPSSSSSASSSASQPSSLAYKFMPSNRVSPQGVIKLDVYAAFLDNPAALLYDRSNHALEANTRSIPDTNHCVLDTIGAGMKTTSTATSHSVRSIKCIATDNRRSKVAKLLRRGGPTAIHTSRLSSTLKAISPKTPIGHTGIAKHGGTLSCIPMRQSASAGYTCASPASLPCTGEPHTWQRFKLQRLLSQPTNNEQSSTRIADTVYPTSDAKPLHIQNAHDISIQSTITSSNPQTGSLAVATRVARVSLPIITMPLAKRRDSNPSSQDQPWFYTNPTLATMSDGNLTPTTLNGSQSDFGTEHGGVYRSTKQSRKGGRRCVINKDPIQWSKSAPLDISPTAVGYNLLKPEEITTCSVLRLQPDTYLRIKDIMLTARVNQGVFKKREAQRWCRIDVNKTARIYDWFVRLGWLDAPDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.37
3 0.41
4 0.5
5 0.61
6 0.69
7 0.75
8 0.8
9 0.81
10 0.84
11 0.9
12 0.88
13 0.86
14 0.78
15 0.73
16 0.65
17 0.58
18 0.55
19 0.51
20 0.43
21 0.35
22 0.32
23 0.27
24 0.27
25 0.26
26 0.19
27 0.13
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.12
32 0.11
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.14
41 0.12
42 0.13
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.15
48 0.15
49 0.16
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.17
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.11
59 0.15
60 0.21
61 0.22
62 0.2
63 0.2
64 0.21
65 0.25
66 0.29
67 0.27
68 0.25
69 0.26
70 0.29
71 0.3
72 0.28
73 0.26
74 0.27
75 0.26
76 0.22
77 0.18
78 0.17
79 0.2
80 0.18
81 0.17
82 0.13
83 0.17
84 0.2
85 0.24
86 0.29
87 0.26
88 0.31
89 0.34
90 0.4
91 0.36
92 0.35
93 0.36
94 0.36
95 0.35
96 0.32
97 0.28
98 0.23
99 0.22
100 0.2
101 0.16
102 0.1
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.09
115 0.11
116 0.13
117 0.14
118 0.13
119 0.14
120 0.16
121 0.18
122 0.21
123 0.23
124 0.21
125 0.21
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.21
130 0.22
131 0.21
132 0.22
133 0.22
134 0.21
135 0.2
136 0.2
137 0.16
138 0.1
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.08
149 0.12
150 0.15
151 0.16
152 0.2
153 0.24
154 0.23
155 0.27
156 0.29
157 0.26
158 0.25
159 0.31
160 0.32
161 0.37
162 0.47
163 0.5
164 0.49
165 0.53
166 0.52
167 0.47
168 0.52
169 0.51
170 0.48
171 0.49
172 0.54
173 0.55
174 0.56
175 0.56
176 0.48
177 0.42
178 0.37
179 0.37
180 0.3
181 0.27
182 0.24
183 0.25
184 0.24
185 0.24
186 0.23
187 0.15
188 0.17
189 0.17
190 0.19
191 0.2
192 0.21
193 0.21
194 0.23
195 0.25
196 0.23
197 0.21
198 0.21
199 0.21
200 0.23
201 0.21
202 0.21
203 0.2
204 0.22
205 0.21
206 0.19
207 0.17
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.05
229 0.05
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.12
235 0.14
236 0.15
237 0.18
238 0.22
239 0.27
240 0.29
241 0.3
242 0.35
243 0.39
244 0.41
245 0.45
246 0.41
247 0.4
248 0.44
249 0.49
250 0.46
251 0.44
252 0.43
253 0.39
254 0.41
255 0.36
256 0.31
257 0.25
258 0.24
259 0.23
260 0.23
261 0.19
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.17
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.18
272 0.16
273 0.15
274 0.19
275 0.2
276 0.24
277 0.26
278 0.25
279 0.27
280 0.3
281 0.29
282 0.24
283 0.23
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.11
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.1
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.12
300 0.12
301 0.08
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.08
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.12
316 0.12
317 0.18
318 0.2
319 0.21
320 0.24
321 0.26
322 0.36
323 0.36
324 0.43
325 0.41
326 0.43
327 0.48
328 0.47
329 0.49
330 0.41
331 0.41
332 0.36
333 0.32
334 0.28
335 0.27
336 0.25
337 0.21
338 0.21
339 0.19
340 0.16
341 0.18
342 0.17
343 0.14
344 0.15
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.09
350 0.09
351 0.13
352 0.12
353 0.14
354 0.13
355 0.15
356 0.16
357 0.16
358 0.18
359 0.14
360 0.14
361 0.16
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.14
366 0.12
367 0.15
368 0.21
369 0.24
370 0.3
371 0.35
372 0.4
373 0.49
374 0.59
375 0.67
376 0.7
377 0.74
378 0.75
379 0.81
380 0.79
381 0.79
382 0.77
383 0.76
384 0.7
385 0.66
386 0.68
387 0.62
388 0.59
389 0.51
390 0.45
391 0.43
392 0.41
393 0.37
394 0.28
395 0.26
396 0.28
397 0.27
398 0.26
399 0.19
400 0.17
401 0.15
402 0.15
403 0.14
404 0.11
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.15
409 0.15
410 0.18
411 0.2
412 0.2
413 0.2
414 0.2
415 0.2
416 0.21
417 0.23
418 0.22
419 0.22
420 0.23
421 0.21
422 0.24
423 0.27
424 0.31
425 0.33
426 0.34
427 0.32
428 0.31
429 0.3
430 0.27
431 0.28
432 0.28
433 0.28
434 0.27
435 0.27
436 0.31
437 0.32
438 0.29
439 0.28
440 0.32
441 0.38
442 0.39
443 0.41
444 0.46
445 0.51
446 0.6
447 0.66
448 0.68
449 0.68
450 0.72
451 0.72
452 0.71
453 0.7
454 0.68
455 0.69
456 0.68
457 0.65
458 0.6
459 0.57
460 0.5
461 0.49
462 0.49
463 0.43
464 0.4
465 0.34
466 0.32
467 0.33
468 0.31
469 0.29
470 0.26