Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

F4PE01

Protein Details
Accession F4PE01    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
422-474RENRDRGRDRDRDRAKERDRDRGRDNRDRGRDSRDSRDRDRDRQVHARNHSFKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
425-460RDRGRDRDRDRAKERDRDRGRDNRDRGRDSRDSRDR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007854  Fip1_dom  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF05182  Fip1  
Amino Acid Sequences MADMDDGDDELLYSSNNAQDNDISDNHRTLDSTHVDENKPSGSDNQEANDADDSDSDDDIEIVLAVPDDASISGSGVPAAGNADSAHTAASAAILPANSKTVQSKSAIGLPIPRQDSTAPAAQQPATGSGKPTIDIDAVGQYEGKDILDVDTDQFEDKPWKKPGADITDYFNYGFNEQTWKTYCNKQKMMREEIQMQKRLNPYDLPMDSDYGFDMQAFAAQQRMLGNPMPVFSTGKYQRLPHTGYGADNTLKQQSIMGKRPRDEDDSVKVLGEQTISTDRSRNKESSASGHQGGSSLDIPDHQNPPTQMGFIPSVNVFGDIHRHFPGNPELGVIQQHPVFGQFSQGPGGNIPRMDHNEKLIGFIHSSLLPRPLDGVLPVPFGFDPRAIPAGLDPRASAAHMADISGKPTNISGQTDRDRDSRENRDRGRDRDRDRAKERDRDRGRDNRDRGRDSRDSRDRDRDRQVHARNHSFKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.13
3 0.16
4 0.17
5 0.18
6 0.19
7 0.21
8 0.25
9 0.26
10 0.26
11 0.25
12 0.26
13 0.26
14 0.25
15 0.23
16 0.21
17 0.25
18 0.25
19 0.27
20 0.31
21 0.36
22 0.36
23 0.37
24 0.38
25 0.33
26 0.29
27 0.27
28 0.25
29 0.24
30 0.28
31 0.29
32 0.28
33 0.3
34 0.3
35 0.31
36 0.28
37 0.24
38 0.2
39 0.18
40 0.18
41 0.15
42 0.15
43 0.13
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.06
49 0.05
50 0.05
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.14
88 0.15
89 0.18
90 0.2
91 0.22
92 0.22
93 0.26
94 0.26
95 0.23
96 0.27
97 0.28
98 0.32
99 0.32
100 0.3
101 0.27
102 0.26
103 0.28
104 0.25
105 0.27
106 0.22
107 0.21
108 0.23
109 0.21
110 0.22
111 0.2
112 0.21
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.19
120 0.16
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.17
144 0.19
145 0.26
146 0.29
147 0.33
148 0.33
149 0.37
150 0.44
151 0.44
152 0.45
153 0.39
154 0.4
155 0.38
156 0.38
157 0.35
158 0.28
159 0.21
160 0.17
161 0.17
162 0.12
163 0.15
164 0.14
165 0.17
166 0.18
167 0.2
168 0.23
169 0.31
170 0.38
171 0.41
172 0.49
173 0.52
174 0.57
175 0.62
176 0.67
177 0.63
178 0.59
179 0.58
180 0.58
181 0.58
182 0.56
183 0.49
184 0.46
185 0.45
186 0.43
187 0.37
188 0.29
189 0.25
190 0.26
191 0.26
192 0.25
193 0.21
194 0.21
195 0.2
196 0.19
197 0.17
198 0.11
199 0.1
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.16
221 0.17
222 0.21
223 0.22
224 0.23
225 0.26
226 0.3
227 0.32
228 0.25
229 0.26
230 0.23
231 0.22
232 0.21
233 0.2
234 0.16
235 0.14
236 0.14
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.15
242 0.21
243 0.28
244 0.34
245 0.36
246 0.38
247 0.42
248 0.43
249 0.43
250 0.4
251 0.36
252 0.34
253 0.33
254 0.31
255 0.27
256 0.24
257 0.2
258 0.17
259 0.13
260 0.08
261 0.07
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.16
266 0.19
267 0.23
268 0.28
269 0.27
270 0.26
271 0.29
272 0.3
273 0.31
274 0.34
275 0.33
276 0.3
277 0.29
278 0.27
279 0.23
280 0.22
281 0.18
282 0.13
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.12
287 0.14
288 0.17
289 0.15
290 0.17
291 0.17
292 0.21
293 0.2
294 0.19
295 0.16
296 0.16
297 0.18
298 0.15
299 0.16
300 0.12
301 0.13
302 0.12
303 0.13
304 0.1
305 0.08
306 0.15
307 0.14
308 0.17
309 0.17
310 0.18
311 0.17
312 0.2
313 0.26
314 0.21
315 0.2
316 0.19
317 0.18
318 0.18
319 0.19
320 0.16
321 0.13
322 0.11
323 0.12
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.1
328 0.13
329 0.11
330 0.11
331 0.13
332 0.14
333 0.13
334 0.14
335 0.16
336 0.15
337 0.15
338 0.15
339 0.18
340 0.23
341 0.27
342 0.27
343 0.27
344 0.3
345 0.29
346 0.31
347 0.27
348 0.22
349 0.19
350 0.18
351 0.17
352 0.14
353 0.15
354 0.14
355 0.18
356 0.16
357 0.16
358 0.17
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.16
363 0.13
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.14
368 0.15
369 0.16
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.15
374 0.14
375 0.14
376 0.16
377 0.21
378 0.22
379 0.21
380 0.18
381 0.18
382 0.19
383 0.19
384 0.17
385 0.1
386 0.12
387 0.11
388 0.12
389 0.14
390 0.14
391 0.17
392 0.18
393 0.17
394 0.15
395 0.15
396 0.19
397 0.18
398 0.23
399 0.24
400 0.29
401 0.36
402 0.4
403 0.42
404 0.43
405 0.45
406 0.47
407 0.52
408 0.55
409 0.58
410 0.65
411 0.67
412 0.74
413 0.76
414 0.78
415 0.79
416 0.78
417 0.75
418 0.76
419 0.8
420 0.79
421 0.78
422 0.8
423 0.79
424 0.79
425 0.78
426 0.78
427 0.77
428 0.75
429 0.77
430 0.76
431 0.77
432 0.78
433 0.81
434 0.81
435 0.82
436 0.81
437 0.76
438 0.75
439 0.76
440 0.71
441 0.74
442 0.73
443 0.72
444 0.72
445 0.79
446 0.78
447 0.77
448 0.82
449 0.78
450 0.77
451 0.8
452 0.8
453 0.79
454 0.8
455 0.82