FuNGI

A0A5E8B608

Protein Details

Accession

A0A5E8B608

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
338-363	QQQSALNRKNKRQKVKNSPQSQNQQL	Hydrophilic
676-697	LSSRNRGRARARGKNKNRADGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
680-692	NRGRARARGKNKN

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR047415 CID_Pcf11 IPR008942 ENTH_VHS IPR045154 PCF11-like
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04818 CID
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID
CDD	cd16982 CID_Pcf11

Amino Acid Sequences

MSQDEIEAIRQDYLTSLQDLTSNSRPIISTLTIIAQENIHAAKAITKTIEEHISKCSPQNKLYGLYLLDSICKNVGKPYTIYFGLNLYMVFCDAYTLVNDSIRRKMYELFLTWKQPTANGTLLFDSVPMNKLEAFLNKAQGIKPHLPAMPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLLLLPAGSDKDREMYRQMKAFSADIPMSQKDLLQHIESLLHLAEQRRITDPSDENTPMQINILNQLKDQLANKVFQADVLGMIQKQLASYTSEELERFKREEPAQQAALSKPIPTGPASGSPTQAQQLLQHQHQLQLQLQLQQQQSALNRKNKRQKVKNSPQSQNQQLNLTPEQLQQLQQIVSMSNQQQQQQQQQPQYNMMHQQQVYPNAASTLMGSNSYLMNDMYNQQSLPLQQQLQQQQQLPPPQQQYAPNYDLLSALQGIANIQAAAAAAAAANVVAPAPIPPKPYVTQPYGAQTGRAGLRGNHAARMYSTPIPTGPAGQTGALPYGVGASPGSLGGNGVSNGGVGTGTGTGSNGSANGAGKKSGELSALLQTVELTEESLNKPRGDLIGLLYSSMPKRCSTCGKRFPDTVEGRKVREAHSDWHFRVNKKLRDENWTQVRSWFLTEEEWIKYKDESETQVALIVPMTATVAGTAIGALSSRNRGRARARGKNKNRADGGDFSPTSTTVGGSTNVSLVGSKPSLGSNSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLGTTNQRGGKTGAQDVPSLAKLTPAQLQAKYVLVPGDKSVVAQGCGICREKFKTSFNADAEDWVWRNAVHILGRYFHATCFAEAERGGGNDFLKRVGEGPSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGQPLAQDSAPVSALTAAPPNLPSAPTAVTSGSATTSSSSSSSAPILDLPGGIDLTAILASVKRKREETE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.15
4	0.15
5	0.17
6	0.19
7	0.24
8	0.28
9	0.28
10	0.26
11	0.28
12	0.28
13	0.26
14	0.29
15	0.24
16	0.2
17	0.18
18	0.21
19	0.21
20	0.21
21	0.21
22	0.16
23	0.15
24	0.16
25	0.15
26	0.13
27	0.11
28	0.11
29	0.15
30	0.16
31	0.19
32	0.17
33	0.18
34	0.2
35	0.24
36	0.32
37	0.29
38	0.29
39	0.33
40	0.36
41	0.37
42	0.41
43	0.44
44	0.42
45	0.43
46	0.48
47	0.45
48	0.45
49	0.45
50	0.42
51	0.36
52	0.32
53	0.31
54	0.24
55	0.24
56	0.2
57	0.19
58	0.18
59	0.18
60	0.17
61	0.21
62	0.24
63	0.24
64	0.26
65	0.28
66	0.31
67	0.32
68	0.32
69	0.27
70	0.24
71	0.22
72	0.2
73	0.17
74	0.12
75	0.1
76	0.1
77	0.09
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.11
84	0.12
85	0.15
86	0.18
87	0.21
88	0.27
89	0.3
90	0.3
91	0.29
92	0.32
93	0.34
94	0.38
95	0.39
96	0.39
97	0.41
98	0.45
99	0.44
100	0.44
101	0.39
102	0.34
103	0.32
104	0.31
105	0.3
106	0.26
107	0.26
108	0.24
109	0.24
110	0.22
111	0.2
112	0.17
113	0.13
114	0.14
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.13
119	0.15
120	0.17
121	0.2
122	0.21
123	0.25
124	0.26
125	0.28
126	0.28
127	0.3
128	0.34
129	0.33
130	0.34
131	0.34
132	0.34
133	0.34
134	0.37
135	0.42
136	0.44
137	0.44
138	0.47
139	0.49
140	0.56
141	0.62
142	0.67
143	0.66
144	0.65
145	0.69
146	0.72
147	0.73
148	0.73
149	0.74
150	0.72
151	0.72
152	0.72
153	0.72
154	0.72
155	0.72
156	0.72
157	0.72
158	0.72
159	0.72
160	0.72
161	0.72
162	0.72
163	0.72
164	0.72
165	0.72
166	0.72
167	0.72
168	0.72
169	0.72
170	0.72
171	0.72
172	0.72
173	0.72
174	0.72
175	0.72
176	0.72
177	0.71
178	0.68
179	0.62
180	0.55
181	0.48
182	0.41
183	0.33
184	0.25
185	0.18
186	0.12
187	0.1
188	0.11
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.13
193	0.14
194	0.16
195	0.22
196	0.25
197	0.3
198	0.34
199	0.35
200	0.33
201	0.34
202	0.33
203	0.27
204	0.26
205	0.22
206	0.19
207	0.21
208	0.19
209	0.19
210	0.18
211	0.18
212	0.16
213	0.19
214	0.19
215	0.17
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.15
220	0.14
221	0.11
222	0.09
223	0.1
224	0.11
225	0.16
226	0.16
227	0.18
228	0.2
229	0.22
230	0.23
231	0.27
232	0.28
233	0.26
234	0.3
235	0.3
236	0.28
237	0.28
238	0.27
239	0.2
240	0.19
241	0.18
242	0.12
243	0.16
244	0.2
245	0.19
246	0.18
247	0.2
248	0.2
249	0.21
250	0.22
251	0.23
252	0.2
253	0.2
254	0.21
255	0.21
256	0.2
257	0.17
258	0.17
259	0.1
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.1
272	0.11
273	0.12
274	0.13
275	0.14
276	0.16
277	0.19
278	0.2
279	0.2
280	0.2
281	0.26
282	0.26
283	0.33
284	0.36
285	0.38
286	0.36
287	0.36
288	0.36
289	0.3
290	0.32
291	0.25
292	0.2
293	0.15
294	0.14
295	0.14
296	0.13
297	0.14
298	0.12
299	0.18
300	0.21
301	0.21
302	0.22
303	0.22
304	0.22
305	0.21
306	0.21
307	0.15
308	0.14
309	0.21
310	0.24
311	0.23
312	0.28
313	0.27
314	0.29
315	0.3
316	0.3
317	0.25
318	0.26
319	0.26
320	0.26
321	0.27
322	0.3
323	0.28
324	0.27
325	0.25
326	0.23
327	0.25
328	0.29
329	0.35
330	0.38
331	0.44
332	0.51
333	0.62
334	0.67
335	0.74
336	0.75
337	0.79
338	0.81
339	0.87
340	0.88
341	0.87
342	0.86
343	0.83
344	0.81
345	0.78
346	0.73
347	0.63
348	0.56
349	0.48
350	0.46
351	0.38
352	0.33
353	0.26
354	0.21
355	0.21
356	0.19
357	0.19
358	0.15
359	0.16
360	0.14
361	0.13
362	0.13
363	0.11
364	0.1
365	0.13
366	0.13
367	0.16
368	0.18
369	0.2
370	0.24
371	0.27
372	0.35
373	0.39
374	0.43
375	0.45
376	0.47
377	0.46
378	0.47
379	0.45
380	0.39
381	0.36
382	0.33
383	0.31
384	0.27
385	0.29
386	0.27
387	0.28
388	0.28
389	0.23
390	0.21
391	0.16
392	0.16
393	0.12
394	0.1
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.06
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.09
412	0.1
413	0.11
414	0.12
415	0.12
416	0.16
417	0.21
418	0.26
419	0.29
420	0.32
421	0.32
422	0.33
423	0.36
424	0.37
425	0.34
426	0.33
427	0.32
428	0.3
429	0.3
430	0.31
431	0.3
432	0.31
433	0.31
434	0.27
435	0.25
436	0.24
437	0.21
438	0.17
439	0.14
440	0.08
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.04
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.02
454	0.02
455	0.02
456	0.02
457	0.02
458	0.02
459	0.02
460	0.02
461	0.02
462	0.02
463	0.03
464	0.05
465	0.06
466	0.08
467	0.09
468	0.12
469	0.14
470	0.18
471	0.22
472	0.23
473	0.24
474	0.23
475	0.26
476	0.27
477	0.26
478	0.22
479	0.17
480	0.17
481	0.15
482	0.15
483	0.13
484	0.09
485	0.13
486	0.18
487	0.18
488	0.18
489	0.18
490	0.17
491	0.17
492	0.19
493	0.2
494	0.16
495	0.16
496	0.14
497	0.14
498	0.15
499	0.15
500	0.14
501	0.11
502	0.1
503	0.1
504	0.09
505	0.1
506	0.08
507	0.09
508	0.07
509	0.06
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.05
519	0.03
520	0.04
521	0.03
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.05
542	0.06
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.1
549	0.1
550	0.09
551	0.09
552	0.1
553	0.12
554	0.12
555	0.12
556	0.11
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.07
561	0.05
562	0.05
563	0.07
564	0.09
565	0.15
566	0.17
567	0.17
568	0.17
569	0.17
570	0.17
571	0.16
572	0.15
573	0.12
574	0.13
575	0.13
576	0.13
577	0.12
578	0.13
579	0.14
580	0.15
581	0.15
582	0.12
583	0.14
584	0.18
585	0.28
586	0.35
587	0.44
588	0.51
589	0.57
590	0.6
591	0.6
592	0.6
593	0.6
594	0.58
595	0.54
596	0.54
597	0.49
598	0.47
599	0.49
600	0.47
601	0.39
602	0.4
603	0.36
604	0.32
605	0.37
606	0.42
607	0.39
608	0.47
609	0.5
610	0.44
611	0.52
612	0.55
613	0.54
614	0.55
615	0.61
616	0.55
617	0.58
618	0.61
619	0.6
620	0.6
621	0.56
622	0.49
623	0.43
624	0.42
625	0.36
626	0.32
627	0.24
628	0.15
629	0.14
630	0.15
631	0.17
632	0.16
633	0.17
634	0.17
635	0.17
636	0.17
637	0.17
638	0.18
639	0.17
640	0.19
641	0.21
642	0.21
643	0.19
644	0.21
645	0.19
646	0.17
647	0.14
648	0.11
649	0.06
650	0.05
651	0.06
652	0.04
653	0.04
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.04
663	0.05
664	0.11
665	0.12
666	0.19
667	0.21
668	0.26
669	0.32
670	0.41
671	0.5
672	0.55
673	0.64
674	0.68
675	0.77
676	0.82
677	0.83
678	0.82
679	0.75
680	0.68
681	0.62
682	0.56
683	0.5
684	0.47
685	0.41
686	0.33
687	0.31
688	0.27
689	0.23
690	0.18
691	0.15
692	0.08
693	0.1
694	0.1
695	0.1
696	0.1
697	0.09
698	0.09
699	0.09
700	0.08
701	0.07
702	0.1
703	0.09
704	0.1
705	0.1
706	0.11
707	0.12
708	0.14
709	0.15
710	0.15
711	0.18
712	0.19
713	0.19
714	0.19
715	0.19
716	0.19
717	0.18
718	0.17
719	0.15
720	0.14
721	0.15
722	0.15
723	0.14
724	0.14
725	0.14
726	0.14
727	0.14
728	0.14
729	0.14
730	0.14
731	0.14
732	0.14
733	0.13
734	0.13
735	0.13
736	0.15
737	0.19
738	0.2
739	0.25
740	0.29
741	0.28
742	0.29
743	0.31
744	0.32
745	0.31
746	0.34
747	0.32
748	0.29
749	0.3
750	0.29
751	0.29
752	0.26
753	0.23
754	0.17
755	0.16
756	0.15
757	0.16
758	0.2
759	0.23
760	0.26
761	0.25
762	0.27
763	0.26
764	0.26
765	0.25
766	0.21
767	0.18
768	0.15
769	0.15
770	0.14
771	0.16
772	0.14
773	0.14
774	0.17
775	0.15
776	0.15
777	0.16
778	0.17
779	0.16
780	0.2
781	0.23
782	0.2
783	0.23
784	0.27
785	0.32
786	0.36
787	0.38
788	0.43
789	0.46
790	0.53
791	0.5
792	0.5
793	0.44
794	0.41
795	0.37
796	0.33
797	0.28
798	0.21
799	0.2
800	0.15
801	0.16
802	0.15
803	0.18
804	0.15
805	0.19
806	0.19
807	0.21
808	0.23
809	0.24
810	0.24
811	0.2
812	0.24
813	0.21
814	0.2
815	0.22
816	0.21
817	0.2
818	0.19
819	0.21
820	0.16
821	0.16
822	0.16
823	0.14
824	0.14
825	0.15
826	0.15
827	0.15
828	0.14
829	0.14
830	0.15
831	0.17
832	0.19
833	0.17
834	0.21
835	0.24
836	0.27
837	0.26
838	0.26
839	0.23
840	0.22
841	0.23
842	0.2
843	0.17
844	0.16
845	0.17
846	0.18
847	0.18
848	0.17
849	0.16
850	0.16
851	0.16
852	0.15
853	0.15
854	0.15
855	0.14
856	0.14
857	0.15
858	0.16
859	0.17
860	0.19
861	0.21
862	0.21
863	0.21
864	0.22
865	0.23
866	0.24
867	0.22
868	0.2
869	0.18
870	0.18
871	0.18
872	0.16
873	0.13
874	0.11
875	0.11
876	0.11
877	0.14
878	0.13
879	0.14
880	0.14
881	0.16
882	0.16
883	0.16
884	0.16
885	0.15
886	0.16
887	0.16
888	0.17
889	0.15
890	0.15
891	0.16
892	0.16
893	0.14
894	0.12
895	0.12
896	0.12
897	0.12
898	0.12
899	0.12
900	0.13
901	0.13
902	0.14
903	0.15
904	0.14
905	0.14
906	0.14
907	0.15
908	0.13
909	0.13
910	0.11
911	0.11
912	0.11
913	0.1
914	0.09
915	0.06
916	0.07
917	0.06
918	0.06
919	0.05
920	0.07
921	0.14
922	0.2
923	0.28
924	0.31

A0A5E8B608

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer