Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E8BDP7

Protein Details
Accession A0A5E8BDP7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-79NEGGTTAPPPRKKHKKQQQQQQQKHVEDKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-64RKKHK
399-408DGRRRFRKSG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MTPSTDWQSDPRIAYDQARRCWIFEDGDIEYVYDETAGQWREDNGDGEANEGGTTAPPPRKKHKKQQQQQQQKHVEDKRERPNCGVYVSGLPRDVDPEQLKTQLAEAFGKYGVLAVDAAGGPRVKVYGARDVDLKEKDNEKDKEEKEKQVLDLKDKDKEKLQDLKEEPTKEAKEPTKETTEETTKEPTKETTKEATQEHKKDLNGGDALVIFFRPESVALAVEMTDNADLWLQGPGGPPTRVHVEPAKFKAKPSDSKPAEKKTVSGYEKTKAMRARAKLEAKVSTWDDDDEKGGSGDTRAGANKARWARDVILENVFGVEELHPGGKPSVDAGALAELEADILSGAEAIGVVRGVTVYDLEKDGVVSVRFESAEEAEACVRVMDGRWFGGRKLRAEISDGRRRFRKSGGGNRTKTEEEEGGEKDEEEERLEEFGKWLERDEKTEKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.45
3 0.48
4 0.48
5 0.55
6 0.52
7 0.49
8 0.5
9 0.46
10 0.39
11 0.33
12 0.33
13 0.26
14 0.27
15 0.26
16 0.23
17 0.19
18 0.16
19 0.14
20 0.09
21 0.07
22 0.06
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.18
29 0.2
30 0.21
31 0.17
32 0.2
33 0.19
34 0.2
35 0.19
36 0.16
37 0.14
38 0.12
39 0.1
40 0.07
41 0.09
42 0.13
43 0.2
44 0.27
45 0.34
46 0.45
47 0.56
48 0.66
49 0.76
50 0.81
51 0.85
52 0.88
53 0.93
54 0.94
55 0.94
56 0.93
57 0.93
58 0.91
59 0.85
60 0.85
61 0.8
62 0.79
63 0.76
64 0.76
65 0.76
66 0.74
67 0.71
68 0.65
69 0.65
70 0.57
71 0.5
72 0.41
73 0.33
74 0.32
75 0.32
76 0.3
77 0.25
78 0.24
79 0.22
80 0.25
81 0.23
82 0.23
83 0.22
84 0.25
85 0.26
86 0.28
87 0.28
88 0.24
89 0.26
90 0.2
91 0.2
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.12
98 0.1
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.09
113 0.12
114 0.19
115 0.21
116 0.22
117 0.24
118 0.25
119 0.31
120 0.31
121 0.3
122 0.25
123 0.28
124 0.31
125 0.38
126 0.39
127 0.37
128 0.44
129 0.44
130 0.51
131 0.52
132 0.55
133 0.51
134 0.51
135 0.5
136 0.48
137 0.48
138 0.43
139 0.46
140 0.42
141 0.45
142 0.43
143 0.42
144 0.4
145 0.41
146 0.42
147 0.42
148 0.42
149 0.44
150 0.44
151 0.5
152 0.5
153 0.48
154 0.43
155 0.41
156 0.41
157 0.33
158 0.38
159 0.36
160 0.36
161 0.38
162 0.41
163 0.38
164 0.37
165 0.38
166 0.37
167 0.36
168 0.32
169 0.3
170 0.33
171 0.31
172 0.31
173 0.3
174 0.27
175 0.28
176 0.29
177 0.31
178 0.29
179 0.28
180 0.32
181 0.33
182 0.39
183 0.42
184 0.43
185 0.43
186 0.43
187 0.4
188 0.4
189 0.38
190 0.33
191 0.25
192 0.21
193 0.17
194 0.13
195 0.13
196 0.09
197 0.08
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.1
224 0.11
225 0.1
226 0.12
227 0.16
228 0.15
229 0.17
230 0.21
231 0.22
232 0.28
233 0.33
234 0.38
235 0.34
236 0.34
237 0.4
238 0.4
239 0.44
240 0.44
241 0.49
242 0.47
243 0.55
244 0.62
245 0.6
246 0.6
247 0.53
248 0.49
249 0.44
250 0.49
251 0.42
252 0.41
253 0.38
254 0.35
255 0.39
256 0.38
257 0.38
258 0.31
259 0.35
260 0.36
261 0.37
262 0.39
263 0.43
264 0.47
265 0.45
266 0.46
267 0.42
268 0.37
269 0.37
270 0.33
271 0.26
272 0.23
273 0.21
274 0.18
275 0.16
276 0.16
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.11
288 0.14
289 0.15
290 0.21
291 0.25
292 0.26
293 0.26
294 0.28
295 0.29
296 0.31
297 0.34
298 0.3
299 0.27
300 0.25
301 0.23
302 0.2
303 0.18
304 0.13
305 0.1
306 0.07
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.02
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.15
361 0.14
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.12
367 0.11
368 0.08
369 0.09
370 0.11
371 0.12
372 0.14
373 0.19
374 0.2
375 0.21
376 0.29
377 0.33
378 0.31
379 0.36
380 0.38
381 0.35
382 0.39
383 0.47
384 0.48
385 0.53
386 0.54
387 0.54
388 0.58
389 0.62
390 0.61
391 0.58
392 0.58
393 0.59
394 0.66
395 0.71
396 0.74
397 0.73
398 0.73
399 0.72
400 0.64
401 0.56
402 0.5
403 0.42
404 0.34
405 0.34
406 0.32
407 0.31
408 0.29
409 0.27
410 0.24
411 0.23
412 0.22
413 0.19
414 0.18
415 0.15
416 0.17
417 0.18
418 0.17
419 0.15
420 0.19
421 0.22
422 0.21
423 0.25
424 0.3
425 0.32
426 0.38