FuNGI

A0A5E8C072

Protein Details

Accession

A0A5E8C072

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
529-548	LRQLAKKCIHIRNKITTGKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR023251 Brr1 IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0030532 C:small nuclear ribonucleoprotein complex GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MANSANKKLFIVNDPREQTLGFVSENAHAGHKSLIAAQEGSTASHPVAVAAGSTNVTNSNATRESPILVTPQADLPNNQESEPALMSSTLLTAVNNDKGNGTNNGYDDESDGDYQPTVKKFPCVLENPDVHQSTHALAKVGYGEPAADAGKPSANRLKRSITAGDGGDFHHKENDEAATAEPDPKRLKLLINTLYSDEDESDNDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEIDENNKHDEIGEDQEIMANDNNTNEEEEEEEADNDEEEEEDQDQEEQKPTYTAGPIDKETGQRAAFPIPALDPSLLRSMASGTPPVSALEYLARVRHEASTRPSFMHTIRSQPIAPHSLLNSSQTTQPLLRDTRQTLQPYSLPKPTHLPQAQPHNPFVVIPQTSPTDQPKDTADPHPLKSSFSYNCEILDLDRKWNDEFLKSFAQSRRILQTTIDALDPQTTSTSLPSSPLPETFDQWKKFLLQGSTTQPSPALLNHLDIVIATQLLDYACRCASSKVPPPMARWTYAILLKYPDTVDADATAVLRQLAKKCIHIRNKITTGKKISTETRLWLDSTVAIVAQLYGQRDLINLID

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.52
3	0.5
4	0.46
5	0.39
6	0.32
7	0.28
8	0.19
9	0.17
10	0.17
11	0.18
12	0.2
13	0.19
14	0.18
15	0.16
16	0.16
17	0.17
18	0.16
19	0.15
20	0.16
21	0.17
22	0.17
23	0.18
24	0.17
25	0.2
26	0.19
27	0.19
28	0.18
29	0.16
30	0.14
31	0.15
32	0.15
33	0.1
34	0.1
35	0.09
36	0.08
37	0.08
38	0.09
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.09
43	0.1
44	0.12
45	0.11
46	0.16
47	0.17
48	0.19
49	0.21
50	0.21
51	0.22
52	0.21
53	0.22
54	0.19
55	0.19
56	0.19
57	0.17
58	0.2
59	0.22
60	0.22
61	0.22
62	0.23
63	0.29
64	0.29
65	0.28
66	0.25
67	0.21
68	0.23
69	0.23
70	0.18
71	0.12
72	0.11
73	0.11
74	0.1
75	0.1
76	0.08
77	0.07
78	0.07
79	0.09
80	0.13
81	0.17
82	0.18
83	0.18
84	0.18
85	0.19
86	0.23
87	0.24
88	0.24
89	0.22
90	0.22
91	0.24
92	0.23
93	0.22
94	0.2
95	0.18
96	0.16
97	0.15
98	0.15
99	0.13
100	0.12
101	0.14
102	0.17
103	0.17
104	0.19
105	0.19
106	0.22
107	0.25
108	0.28
109	0.34
110	0.35
111	0.39
112	0.43
113	0.45
114	0.44
115	0.48
116	0.46
117	0.38
118	0.34
119	0.29
120	0.23
121	0.24
122	0.21
123	0.15
124	0.13
125	0.14
126	0.16
127	0.15
128	0.14
129	0.1
130	0.09
131	0.08
132	0.1
133	0.09
134	0.07
135	0.07
136	0.08
137	0.11
138	0.11
139	0.15
140	0.22
141	0.27
142	0.31
143	0.34
144	0.38
145	0.38
146	0.43
147	0.41
148	0.35
149	0.33
150	0.3
151	0.27
152	0.23
153	0.21
154	0.23
155	0.21
156	0.19
157	0.19
158	0.19
159	0.18
160	0.19
161	0.19
162	0.13
163	0.13
164	0.13
165	0.12
166	0.12
167	0.17
168	0.16
169	0.19
170	0.2
171	0.2
172	0.22
173	0.21
174	0.24
175	0.24
176	0.32
177	0.34
178	0.35
179	0.35
180	0.34
181	0.33
182	0.3
183	0.26
184	0.19
185	0.13
186	0.1
187	0.11
188	0.11
189	0.1
190	0.1
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.07
196	0.07
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.08
220	0.09
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.13
226	0.13
227	0.13
228	0.11
229	0.08
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.06
246	0.06
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.07
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.11
265	0.13
266	0.14
267	0.16
268	0.17
269	0.17
270	0.17
271	0.18
272	0.16
273	0.14
274	0.15
275	0.14
276	0.13
277	0.11
278	0.11
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.08
283	0.07
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.11
307	0.13
308	0.14
309	0.16
310	0.21
311	0.26
312	0.26
313	0.27
314	0.27
315	0.26
316	0.25
317	0.3
318	0.25
319	0.25
320	0.26
321	0.28
322	0.27
323	0.26
324	0.28
325	0.23
326	0.23
327	0.18
328	0.17
329	0.17
330	0.17
331	0.19
332	0.17
333	0.15
334	0.16
335	0.16
336	0.17
337	0.15
338	0.16
339	0.18
340	0.2
341	0.21
342	0.23
343	0.25
344	0.29
345	0.34
346	0.36
347	0.32
348	0.32
349	0.33
350	0.34
351	0.35
352	0.36
353	0.31
354	0.29
355	0.34
356	0.33
357	0.4
358	0.36
359	0.37
360	0.36
361	0.46
362	0.52
363	0.5
364	0.48
365	0.4
366	0.38
367	0.33
368	0.29
369	0.25
370	0.18
371	0.15
372	0.16
373	0.17
374	0.18
375	0.21
376	0.24
377	0.23
378	0.22
379	0.23
380	0.25
381	0.27
382	0.3
383	0.3
384	0.35
385	0.34
386	0.36
387	0.41
388	0.38
389	0.35
390	0.34
391	0.37
392	0.31
393	0.31
394	0.32
395	0.26
396	0.26
397	0.25
398	0.23
399	0.18
400	0.23
401	0.2
402	0.22
403	0.24
404	0.25
405	0.25
406	0.28
407	0.28
408	0.24
409	0.25
410	0.24
411	0.28
412	0.27
413	0.33
414	0.32
415	0.38
416	0.36
417	0.38
418	0.41
419	0.37
420	0.37
421	0.31
422	0.32
423	0.28
424	0.27
425	0.24
426	0.17
427	0.15
428	0.17
429	0.16
430	0.12
431	0.1
432	0.09
433	0.1
434	0.11
435	0.12
436	0.1
437	0.12
438	0.13
439	0.15
440	0.16
441	0.17
442	0.21
443	0.2
444	0.23
445	0.3
446	0.37
447	0.36
448	0.36
449	0.36
450	0.33
451	0.35
452	0.36
453	0.31
454	0.26
455	0.29
456	0.35
457	0.37
458	0.35
459	0.33
460	0.28
461	0.26
462	0.24
463	0.19
464	0.18
465	0.15
466	0.16
467	0.16
468	0.16
469	0.15
470	0.14
471	0.13
472	0.08
473	0.07
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.07
480	0.09
481	0.09
482	0.11
483	0.12
484	0.14
485	0.18
486	0.26
487	0.35
488	0.41
489	0.5
490	0.52
491	0.55
492	0.63
493	0.62
494	0.56
495	0.48
496	0.42
497	0.38
498	0.38
499	0.36
500	0.27
501	0.27
502	0.25
503	0.26
504	0.23
505	0.21
506	0.2
507	0.19
508	0.18
509	0.16
510	0.16
511	0.14
512	0.14
513	0.12
514	0.1
515	0.1
516	0.12
517	0.15
518	0.18
519	0.25
520	0.27
521	0.35
522	0.44
523	0.53
524	0.6
525	0.66
526	0.7
527	0.73
528	0.8
529	0.8
530	0.78
531	0.77
532	0.75
533	0.7
534	0.67
535	0.63
536	0.6
537	0.59
538	0.56
539	0.53
540	0.5
541	0.47
542	0.43
543	0.38
544	0.33
545	0.26
546	0.24
547	0.18
548	0.12
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.1
553	0.11
554	0.12
555	0.13
556	0.14
557	0.14
558	0.14

A0A5E8C072

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer