FuNGI

A0A5E8C0Q1

Protein Details

Accession

A0A5E8C0Q1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
102-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRTARESRINA	Hydrophilic
894-919	ETIVRQKISERRNRHNNNNNYNNNNN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
407-418	RKRRRLDDEKRK
520-528	KLKAEKKAK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 6, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAFFRWLSRKYPKTVSPVLEEPDVEIDGVKYPPNYGNPNPNDELDNLYLDMNGIVHPCTHPEGREAPKNEDEMMLEVFKYTDRVLTMARPRKILMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRTARESRINAEAKEQAINEAEARGETIDDAIKGKTHWDSNVITPGTPFMDTLAISLRYWIAYKLNSDPGWSDLKIIISDASIPGEGEHKIMEFIRSQRADPSHDPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQQNKPQSGPNKNFGLTEEDKQKLELDAQIEKSHKKPFIWLHVDILRQYLEIELTVPNLPFAYDFERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRSNSIDMLTDMWRRNLGKLKGFITCDGHVDLDRAEVLLRSLGQQEDNIFRSKIRVEEDRKRRRLDDEKRKEQKEMDPKMLKEMLQKQEHNYSPAQQLEETILDQKVPQPEISKNRTGDRAPVHPLDNIPLYSPSGESVGAVHMSNSELVARRNEITMSNIANKAAADVLKAKLKAEKKAKNFKGASAEKELENEEEKEQQDDEEAEEAEKAEENGETEETEETEETEDTEETEDSEAPKAPPVKIGVKRGHDGFERRDDMDQYADPVRLGEPGYRDRYYTLKFDAPEDNQAKRRDVVERYIEGVCWVLLYYYQGCPSWNWYFPYHYAPFAVDFINLSKIEIKFNKGEPFAPYEQLMSVLPASSGHTLPEVFRPLMSDPKSEIIDFYPEDFRIDLNGKKFEWQGVAILPFIDEKRLLTAVRAKYDQLTPQEVARNARKNEILIVSGKNVIFEQAMKKVYAPNADEYSRFNFRAYQTKGLTGTISKDPAFENKQIFNFPLSEGHMPDVPIEGNVMFLTYDMPVSSFPNKSMLLRGVKLRDPVFTQTEETIVRQKISERRNRHNNNNNYNNNNNPNNGLGRNEPLKVAGRIGGFVNFIGLEKTGQLPGSDLQARQGIRGSFIGNGGNYYNNNSNNNNNNNGGGYNGNNNNYRGNPYNGGGYNNGPRNGGNNGYQRSGSYNNNGGRQYNNNGRQQGGSYQKRDNNNGYGGDGSSQGYNQYQNYGQQHYAPTSNQPFANNVFGSVGTNNEYENASSSNNSGNNNYRGNNNYNGGRGGGYRGNNNRNNRYNSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.65
3	0.68
4	0.71
5	0.66
6	0.63
7	0.61
8	0.58
9	0.52
10	0.45
11	0.38
12	0.32
13	0.28
14	0.21
15	0.16
16	0.13
17	0.13
18	0.14
19	0.15
20	0.13
21	0.15
22	0.2
23	0.26
24	0.32
25	0.35
26	0.45
27	0.47
28	0.54
29	0.54
30	0.51
31	0.47
32	0.41
33	0.41
34	0.32
35	0.29
36	0.23
37	0.2
38	0.18
39	0.16
40	0.15
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.12
48	0.17
49	0.19
50	0.19
51	0.23
52	0.31
53	0.37
54	0.46
55	0.48
56	0.5
57	0.52
58	0.53
59	0.49
60	0.42
61	0.36
62	0.29
63	0.28
64	0.21
65	0.17
66	0.15
67	0.14
68	0.13
69	0.13
70	0.11
71	0.11
72	0.11
73	0.13
74	0.15
75	0.23
76	0.33
77	0.4
78	0.43
79	0.42
80	0.43
81	0.44
82	0.44
83	0.4
84	0.32
85	0.28
86	0.26
87	0.24
88	0.25
89	0.21
90	0.21
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.2
96	0.26
97	0.37
98	0.46
99	0.55
100	0.66
101	0.75
102	0.8
103	0.84
104	0.82
105	0.8
106	0.81
107	0.82
108	0.82
109	0.83
110	0.78
111	0.72
112	0.74
113	0.7
114	0.6
115	0.54
116	0.47
117	0.38
118	0.36
119	0.33
120	0.26
121	0.23
122	0.23
123	0.19
124	0.16
125	0.15
126	0.11
127	0.12
128	0.1
129	0.08
130	0.07
131	0.08
132	0.09
133	0.09
134	0.11
135	0.1
136	0.11
137	0.11
138	0.14
139	0.17
140	0.19
141	0.2
142	0.23
143	0.25
144	0.28
145	0.36
146	0.34
147	0.29
148	0.27
149	0.27
150	0.24
151	0.21
152	0.17
153	0.1
154	0.11
155	0.11
156	0.12
157	0.14
158	0.14
159	0.14
160	0.15
161	0.14
162	0.13
163	0.14
164	0.15
165	0.14
166	0.15
167	0.18
168	0.22
169	0.28
170	0.27
171	0.28
172	0.27
173	0.27
174	0.3
175	0.27
176	0.24
177	0.19
178	0.2
179	0.18
180	0.18
181	0.15
182	0.11
183	0.11
184	0.1
185	0.1
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.1
190	0.1
191	0.09
192	0.09
193	0.08
194	0.1
195	0.1
196	0.12
197	0.14
198	0.16
199	0.25
200	0.26
201	0.26
202	0.31
203	0.34
204	0.38
205	0.39
206	0.44
207	0.42
208	0.43
209	0.44
210	0.4
211	0.44
212	0.39
213	0.34
214	0.27
215	0.21
216	0.19
217	0.19
218	0.18
219	0.12
220	0.1
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.06
230	0.07
231	0.09
232	0.09
233	0.12
234	0.15
235	0.16
236	0.19
237	0.22
238	0.24
239	0.26
240	0.28
241	0.3
242	0.37
243	0.38
244	0.36
245	0.35
246	0.38
247	0.36
248	0.34
249	0.35
250	0.35
251	0.42
252	0.46
253	0.49
254	0.47
255	0.47
256	0.46
257	0.42
258	0.42
259	0.35
260	0.35
261	0.35
262	0.33
263	0.33
264	0.33
265	0.32
266	0.25
267	0.23
268	0.21
269	0.17
270	0.19
271	0.21
272	0.24
273	0.26
274	0.28
275	0.3
276	0.34
277	0.34
278	0.3
279	0.36
280	0.39
281	0.46
282	0.5
283	0.47
284	0.46
285	0.46
286	0.47
287	0.4
288	0.35
289	0.25
290	0.19
291	0.18
292	0.12
293	0.09
294	0.07
295	0.08
296	0.07
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.14
309	0.15
310	0.16
311	0.17
312	0.15
313	0.11
314	0.1
315	0.1
316	0.09
317	0.08
318	0.09
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.12
326	0.12
327	0.13
328	0.14
329	0.13
330	0.12
331	0.12
332	0.15
333	0.19
334	0.19
335	0.19
336	0.21
337	0.2
338	0.2
339	0.19
340	0.15
341	0.1
342	0.11
343	0.13
344	0.16
345	0.16
346	0.17
347	0.2
348	0.21
349	0.25
350	0.31
351	0.32
352	0.33
353	0.36
354	0.38
355	0.39
356	0.39
357	0.37
358	0.33
359	0.29
360	0.25
361	0.22
362	0.2
363	0.16
364	0.16
365	0.13
366	0.1
367	0.09
368	0.07
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.09
379	0.11
380	0.14
381	0.16
382	0.17
383	0.16
384	0.16
385	0.17
386	0.18
387	0.19
388	0.19
389	0.26
390	0.31
391	0.41
392	0.52
393	0.61
394	0.66
395	0.66
396	0.65
397	0.65
398	0.68
399	0.69
400	0.69
401	0.69
402	0.74
403	0.8
404	0.8
405	0.74
406	0.67
407	0.65
408	0.64
409	0.59
410	0.57
411	0.53
412	0.52
413	0.54
414	0.51
415	0.43
416	0.4
417	0.43
418	0.41
419	0.42
420	0.43
421	0.41
422	0.47
423	0.47
424	0.43
425	0.36
426	0.31
427	0.29
428	0.29
429	0.27
430	0.19
431	0.18
432	0.17
433	0.17
434	0.14
435	0.12
436	0.1
437	0.09
438	0.09
439	0.12
440	0.14
441	0.14
442	0.14
443	0.15
444	0.21
445	0.3
446	0.35
447	0.37
448	0.36
449	0.38
450	0.41
451	0.39
452	0.38
453	0.34
454	0.33
455	0.31
456	0.32
457	0.3
458	0.27
459	0.27
460	0.23
461	0.21
462	0.17
463	0.13
464	0.12
465	0.11
466	0.1
467	0.1
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.06
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.1
486	0.11
487	0.11
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.13
492	0.14
493	0.16
494	0.15
495	0.15
496	0.15
497	0.14
498	0.12
499	0.1
500	0.08
501	0.06
502	0.08
503	0.1
504	0.12
505	0.13
506	0.13
507	0.18
508	0.21
509	0.28
510	0.36
511	0.42
512	0.47
513	0.58
514	0.61
515	0.64
516	0.62
517	0.57
518	0.57
519	0.52
520	0.47
521	0.41
522	0.39
523	0.3
524	0.3
525	0.28
526	0.2
527	0.19
528	0.17
529	0.12
530	0.15
531	0.15
532	0.15
533	0.14
534	0.13
535	0.12
536	0.1
537	0.1
538	0.07
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.05
546	0.04
547	0.04
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.05
557	0.05
558	0.06
559	0.06
560	0.05
561	0.06
562	0.06
563	0.05
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.11
574	0.12
575	0.12
576	0.14
577	0.16
578	0.23
579	0.27
580	0.34
581	0.36
582	0.38
583	0.4
584	0.39
585	0.38
586	0.33
587	0.33
588	0.29
589	0.29
590	0.29
591	0.28
592	0.28
593	0.26
594	0.24
595	0.22
596	0.19
597	0.15
598	0.14
599	0.13
600	0.12
601	0.11
602	0.1
603	0.09
604	0.1
605	0.09
606	0.11
607	0.15
608	0.2
609	0.2
610	0.21
611	0.21
612	0.25
613	0.25
614	0.25
615	0.23
616	0.21
617	0.21
618	0.24
619	0.27
620	0.24
621	0.3
622	0.3
623	0.31
624	0.34
625	0.36
626	0.35
627	0.32
628	0.32
629	0.29
630	0.29
631	0.31
632	0.29
633	0.28
634	0.29
635	0.28
636	0.26
637	0.21
638	0.19
639	0.13
640	0.08
641	0.07
642	0.04
643	0.04
644	0.05
645	0.07
646	0.07
647	0.09
648	0.09
649	0.1
650	0.1
651	0.16
652	0.18
653	0.19
654	0.21
655	0.22
656	0.24
657	0.25
658	0.32
659	0.27
660	0.24
661	0.22
662	0.2
663	0.19
664	0.17
665	0.16
666	0.09
667	0.08
668	0.09
669	0.11
670	0.11
671	0.1
672	0.13
673	0.13
674	0.18
675	0.19
676	0.22
677	0.21
678	0.25
679	0.29
680	0.26
681	0.27
682	0.24
683	0.29
684	0.27
685	0.25
686	0.22
687	0.18
688	0.17
689	0.17
690	0.15
691	0.09
692	0.08
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.08
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.09
701	0.09
702	0.1
703	0.13
704	0.14
705	0.13
706	0.12
707	0.14
708	0.15
709	0.22
710	0.23
711	0.21
712	0.2
713	0.23
714	0.24
715	0.22
716	0.21
717	0.15
718	0.16
719	0.15
720	0.16
721	0.15
722	0.14
723	0.15
724	0.14
725	0.13
726	0.13
727	0.16
728	0.17
729	0.18
730	0.21
731	0.2
732	0.23
733	0.24
734	0.22
735	0.21
736	0.18
737	0.15
738	0.14
739	0.15
740	0.12
741	0.12
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.09
746	0.08
747	0.07
748	0.09
749	0.11
750	0.11
751	0.12
752	0.2
753	0.22
754	0.25
755	0.26
756	0.25
757	0.26
758	0.28
759	0.3
760	0.26
761	0.27
762	0.24
763	0.26
764	0.31
765	0.3
766	0.33
767	0.36
768	0.4
769	0.37
770	0.4
771	0.39
772	0.34
773	0.36
774	0.32
775	0.26
776	0.21
777	0.21
778	0.18
779	0.2
780	0.2
781	0.17
782	0.15
783	0.14
784	0.12
785	0.12
786	0.14
787	0.16
788	0.17
789	0.17
790	0.18
791	0.2
792	0.23
793	0.26
794	0.25
795	0.25
796	0.27
797	0.28
798	0.28
799	0.28
800	0.3
801	0.3
802	0.28
803	0.24
804	0.25
805	0.26
806	0.35
807	0.37
808	0.39
809	0.36
810	0.39
811	0.39
812	0.36
813	0.34
814	0.25
815	0.25
816	0.2
817	0.21
818	0.18
819	0.18
820	0.19
821	0.24
822	0.28
823	0.28
824	0.29
825	0.3
826	0.32
827	0.33
828	0.33
829	0.28
830	0.24
831	0.21
832	0.19
833	0.19
834	0.19
835	0.18
836	0.18
837	0.18
838	0.17
839	0.16
840	0.15
841	0.11
842	0.1
843	0.1
844	0.08
845	0.07
846	0.07
847	0.07
848	0.05
849	0.05
850	0.06
851	0.05
852	0.06
853	0.05
854	0.06
855	0.06
856	0.1
857	0.14
858	0.14
859	0.15
860	0.19
861	0.2
862	0.2
863	0.23
864	0.26
865	0.27
866	0.28
867	0.33
868	0.33
869	0.36
870	0.4
871	0.37
872	0.33
873	0.32
874	0.34
875	0.32
876	0.29
877	0.28
878	0.24
879	0.25
880	0.24
881	0.23
882	0.25
883	0.23
884	0.22
885	0.2
886	0.26
887	0.31
888	0.4
889	0.47
890	0.49
891	0.58
892	0.69
893	0.77
894	0.82
895	0.84
896	0.85
897	0.86
898	0.88
899	0.85
900	0.8
901	0.76
902	0.73
903	0.7
904	0.63
905	0.54
906	0.45
907	0.41
908	0.38
909	0.34
910	0.29
911	0.24
912	0.26
913	0.27
914	0.26
915	0.24
916	0.23
917	0.26
918	0.24
919	0.23
920	0.22
921	0.19
922	0.19
923	0.2
924	0.18
925	0.15
926	0.13
927	0.13
928	0.09
929	0.09
930	0.08
931	0.08
932	0.07
933	0.08
934	0.09
935	0.1
936	0.1
937	0.1
938	0.12
939	0.12
940	0.17
941	0.19
942	0.18
943	0.19
944	0.23
945	0.24
946	0.23
947	0.26
948	0.21
949	0.2
950	0.22
951	0.2
952	0.17
953	0.18
954	0.19
955	0.15
956	0.16
957	0.14
958	0.15
959	0.15
960	0.19
961	0.23
962	0.25
963	0.29
964	0.3
965	0.37
966	0.43
967	0.47
968	0.47
969	0.42
970	0.39
971	0.36
972	0.33
973	0.28
974	0.21
975	0.18
976	0.21
977	0.24
978	0.27
979	0.29
980	0.3
981	0.32
982	0.32
983	0.36
984	0.33
985	0.34
986	0.33
987	0.31
988	0.37
989	0.35
990	0.35
991	0.32
992	0.31
993	0.34
994	0.37
995	0.37
996	0.31
997	0.29
998	0.3
999	0.32
1000	0.31
1001	0.3
1002	0.33
1003	0.35
1004	0.36
1005	0.37
1006	0.34
1007	0.35
1008	0.37
1009	0.34
1010	0.32
1011	0.37
1012	0.39
1013	0.44
1014	0.45
1015	0.42
1016	0.41
1017	0.42
1018	0.44
1019	0.47
1020	0.5
1021	0.52
1022	0.53
1023	0.52
1024	0.5
1025	0.47
1026	0.47
1027	0.47
1028	0.48
1029	0.46
1030	0.52
1031	0.57
1032	0.62
1033	0.66
1034	0.64
1035	0.59
1036	0.56
1037	0.52
1038	0.45
1039	0.4
1040	0.33
1041	0.28
1042	0.22
1043	0.18
1044	0.14
1045	0.13
1046	0.13
1047	0.14
1048	0.16
1049	0.16
1050	0.19
1051	0.2
1052	0.27
1053	0.31
1054	0.34
1055	0.33
1056	0.34
1057	0.37
1058	0.36
1059	0.38
1060	0.32
1061	0.37
1062	0.38
1063	0.41
1064	0.39
1065	0.37
1066	0.37
1067	0.36
1068	0.41
1069	0.32
1070	0.27
1071	0.24
1072	0.22
1073	0.22
1074	0.2
1075	0.18
1076	0.15
1077	0.15
1078	0.14
1079	0.15
1080	0.15
1081	0.14
1082	0.16
1083	0.16
1084	0.15
1085	0.15
1086	0.17
1087	0.21
1088	0.24
1089	0.25
1090	0.28
1091	0.34
1092	0.38
1093	0.42
1094	0.42
1095	0.42
1096	0.45
1097	0.47
1098	0.48
1099	0.46
1100	0.44
1101	0.41
1102	0.41
1103	0.36
1104	0.31
1105	0.27
1106	0.27
1107	0.27
1108	0.27
1109	0.33
1110	0.41
1111	0.5
1112	0.56
1113	0.64
1114	0.69
1115	0.72

A0A5E8C0Q1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer