Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E8B2T2

Protein Details
Accession A0A5E8B2T2    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-309PPPPSAKSKGGKKSKNKDSGDBasic
389-415QQQQLKDDGKKKRRRRGKGKKEEDGGSBasic
546-572GGLNAGDKKKRRSRNRKEKKEGDGEPGBasic
719-741KEGNGPRASNRPRGPRRNGSDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-334PPSAKSKGGKKSKNKDSGDGKNKGSNEEQPKKKKILERPSSAKR
397-409GKKKRRRRGKGKK
552-567DKKKRRSRNRKEKKEG
719-735KEGNGPRASNRPRGPRR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11, cyto 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MDRLQSQRQPGAPIATRSSVLGSILPVHQRNNISNNAINSTLPVGNAGSDKLKLVIRLLPPDIDEKWLMALLRGVANDDTLQSYYFVQGHVSRKSLLKQYKFSSKPVVYSRLYLNMRSPAAVAALVKEYHTSVLLSIMLKIEQDLDDATDDLPGSSSLKSESGFSTPSGQSKRHIVKPIIEYAPLQLKLKASKGHPLEGTIDTDEDYLKFVDECEAEKKDKEQSLEESKKDAEEDEEKESKESGENEKVIKLDPKAPTLVSMETLKAVKAKLGTSATLTGNGVEEAPSPPPPSAKSKGGKKSKNKDSGDGKNKGSNEEQPKKKKILERPSSAKRGNNNGSGGNNKNNNSNNNNDNNNNNNNSNGNKEKEKGEASANGEPSIPKDPASQQQQQLKDDGKKKRRRRGKGKKEEDGGSGSGLGSTGANGADTGKPEGENDGTSKNRSKQQQQQQQQQQGGGGGSNKSKKTDEKTSSGGVNAGASFSGDGVSKKTVDGVAGMMEKPVALPKGPASISSGGNNNNNSNNAHNNVHSNVHSNAHNNANNGGGGLNAGDKKKRRSRNRKEKKEGDGEPGGGGSNGRNDYAASGLSLPSSRAAAAAAATASSSSSNVGDLHVVPLPVSTPNAPGSKHDGPRRGPRERGMTRDKGAFSSSSSSSPSFSSTVIATGSVGPSGLVIPSGPGGGGNGNGNGNNNGNNNGKSNGKFRVSSRSSGPNNGGGAKEGNGPRASNRPRGPRRNGSDGGPGNNGNGNGNGNTNTNTNTNTNTNVNGNTNGNANSSSSSSSSISGSTKASN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.38
4 0.34
5 0.33
6 0.26
7 0.21
8 0.18
9 0.14
10 0.15
11 0.19
12 0.24
13 0.25
14 0.26
15 0.31
16 0.35
17 0.39
18 0.41
19 0.43
20 0.41
21 0.43
22 0.43
23 0.41
24 0.37
25 0.32
26 0.28
27 0.27
28 0.22
29 0.18
30 0.16
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.18
40 0.17
41 0.19
42 0.23
43 0.26
44 0.31
45 0.32
46 0.3
47 0.3
48 0.33
49 0.32
50 0.29
51 0.25
52 0.2
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.14
57 0.15
58 0.13
59 0.15
60 0.14
61 0.15
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.15
75 0.2
76 0.25
77 0.28
78 0.29
79 0.29
80 0.32
81 0.37
82 0.44
83 0.47
84 0.48
85 0.52
86 0.57
87 0.65
88 0.65
89 0.64
90 0.64
91 0.57
92 0.57
93 0.56
94 0.57
95 0.47
96 0.48
97 0.46
98 0.46
99 0.45
100 0.4
101 0.38
102 0.37
103 0.36
104 0.33
105 0.3
106 0.21
107 0.2
108 0.19
109 0.15
110 0.1
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.12
118 0.1
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.2
153 0.2
154 0.27
155 0.29
156 0.28
157 0.29
158 0.37
159 0.43
160 0.44
161 0.51
162 0.47
163 0.5
164 0.54
165 0.59
166 0.51
167 0.44
168 0.38
169 0.33
170 0.37
171 0.32
172 0.28
173 0.23
174 0.24
175 0.26
176 0.3
177 0.32
178 0.26
179 0.33
180 0.35
181 0.38
182 0.36
183 0.34
184 0.34
185 0.31
186 0.31
187 0.23
188 0.21
189 0.16
190 0.16
191 0.14
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.15
202 0.19
203 0.2
204 0.21
205 0.23
206 0.27
207 0.3
208 0.3
209 0.28
210 0.32
211 0.41
212 0.46
213 0.45
214 0.41
215 0.38
216 0.37
217 0.34
218 0.27
219 0.21
220 0.19
221 0.21
222 0.25
223 0.27
224 0.27
225 0.27
226 0.27
227 0.23
228 0.21
229 0.22
230 0.21
231 0.24
232 0.26
233 0.26
234 0.27
235 0.27
236 0.26
237 0.26
238 0.22
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.25
243 0.25
244 0.25
245 0.23
246 0.22
247 0.17
248 0.16
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.19
263 0.18
264 0.17
265 0.17
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.2
280 0.24
281 0.3
282 0.36
283 0.44
284 0.54
285 0.63
286 0.69
287 0.73
288 0.78
289 0.8
290 0.83
291 0.76
292 0.75
293 0.73
294 0.75
295 0.73
296 0.68
297 0.6
298 0.54
299 0.53
300 0.48
301 0.42
302 0.39
303 0.4
304 0.44
305 0.51
306 0.55
307 0.59
308 0.6
309 0.63
310 0.63
311 0.62
312 0.64
313 0.64
314 0.64
315 0.68
316 0.71
317 0.74
318 0.7
319 0.64
320 0.57
321 0.58
322 0.54
323 0.49
324 0.44
325 0.38
326 0.36
327 0.37
328 0.35
329 0.31
330 0.31
331 0.27
332 0.31
333 0.33
334 0.36
335 0.34
336 0.36
337 0.36
338 0.37
339 0.39
340 0.36
341 0.36
342 0.36
343 0.37
344 0.35
345 0.3
346 0.26
347 0.25
348 0.24
349 0.25
350 0.24
351 0.23
352 0.22
353 0.23
354 0.24
355 0.25
356 0.25
357 0.22
358 0.21
359 0.22
360 0.24
361 0.26
362 0.25
363 0.22
364 0.21
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.14
369 0.11
370 0.12
371 0.14
372 0.21
373 0.27
374 0.3
375 0.33
376 0.39
377 0.41
378 0.4
379 0.41
380 0.38
381 0.38
382 0.41
383 0.45
384 0.5
385 0.57
386 0.65
387 0.72
388 0.78
389 0.82
390 0.85
391 0.87
392 0.89
393 0.9
394 0.9
395 0.87
396 0.82
397 0.73
398 0.63
399 0.54
400 0.43
401 0.32
402 0.23
403 0.16
404 0.11
405 0.08
406 0.07
407 0.04
408 0.03
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.13
425 0.14
426 0.16
427 0.2
428 0.23
429 0.28
430 0.32
431 0.38
432 0.44
433 0.54
434 0.61
435 0.66
436 0.72
437 0.75
438 0.76
439 0.7
440 0.61
441 0.5
442 0.41
443 0.33
444 0.23
445 0.16
446 0.11
447 0.13
448 0.17
449 0.17
450 0.19
451 0.21
452 0.24
453 0.29
454 0.38
455 0.39
456 0.39
457 0.42
458 0.42
459 0.4
460 0.36
461 0.3
462 0.2
463 0.16
464 0.12
465 0.08
466 0.06
467 0.05
468 0.05
469 0.04
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.08
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.09
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.07
493 0.08
494 0.13
495 0.13
496 0.13
497 0.15
498 0.18
499 0.19
500 0.2
501 0.22
502 0.2
503 0.24
504 0.25
505 0.23
506 0.22
507 0.23
508 0.22
509 0.22
510 0.22
511 0.23
512 0.23
513 0.21
514 0.22
515 0.23
516 0.24
517 0.22
518 0.22
519 0.2
520 0.21
521 0.22
522 0.21
523 0.22
524 0.27
525 0.29
526 0.26
527 0.25
528 0.23
529 0.21
530 0.19
531 0.16
532 0.08
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.09
537 0.1
538 0.15
539 0.2
540 0.29
541 0.38
542 0.48
543 0.57
544 0.66
545 0.77
546 0.84
547 0.91
548 0.93
549 0.95
550 0.94
551 0.91
552 0.89
553 0.81
554 0.76
555 0.68
556 0.57
557 0.46
558 0.37
559 0.29
560 0.19
561 0.16
562 0.09
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.12
570 0.11
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.08
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.07
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.06
594 0.07
595 0.07
596 0.08
597 0.09
598 0.09
599 0.11
600 0.11
601 0.11
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.1
606 0.11
607 0.1
608 0.11
609 0.15
610 0.18
611 0.18
612 0.2
613 0.28
614 0.34
615 0.4
616 0.45
617 0.48
618 0.52
619 0.63
620 0.68
621 0.67
622 0.64
623 0.63
624 0.67
625 0.65
626 0.67
627 0.65
628 0.63
629 0.6
630 0.61
631 0.55
632 0.46
633 0.43
634 0.35
635 0.29
636 0.27
637 0.25
638 0.21
639 0.22
640 0.21
641 0.21
642 0.21
643 0.21
644 0.18
645 0.16
646 0.16
647 0.13
648 0.14
649 0.13
650 0.12
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.08
655 0.08
656 0.06
657 0.06
658 0.07
659 0.06
660 0.05
661 0.04
662 0.05
663 0.05
664 0.06
665 0.05
666 0.05
667 0.06
668 0.06
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.1
673 0.11
674 0.13
675 0.15
676 0.15
677 0.17
678 0.18
679 0.21
680 0.24
681 0.25
682 0.26
683 0.27
684 0.3
685 0.3
686 0.34
687 0.37
688 0.37
689 0.38
690 0.38
691 0.46
692 0.45
693 0.46
694 0.47
695 0.49
696 0.49
697 0.51
698 0.52
699 0.46
700 0.44
701 0.43
702 0.38
703 0.29
704 0.27
705 0.23
706 0.27
707 0.23
708 0.26
709 0.26
710 0.26
711 0.28
712 0.37
713 0.42
714 0.44
715 0.5
716 0.56
717 0.65
718 0.75
719 0.81
720 0.81
721 0.83
722 0.82
723 0.77
724 0.7
725 0.7
726 0.64
727 0.58
728 0.51
729 0.44
730 0.37
731 0.37
732 0.33
733 0.24
734 0.22
735 0.2
736 0.17
737 0.19
738 0.19
739 0.18
740 0.19
741 0.2
742 0.21
743 0.2
744 0.23
745 0.23
746 0.25
747 0.26
748 0.29
749 0.3
750 0.3
751 0.31
752 0.31
753 0.32
754 0.32
755 0.31
756 0.28
757 0.29
758 0.27
759 0.25
760 0.22
761 0.2
762 0.19
763 0.18
764 0.19
765 0.17
766 0.19
767 0.19
768 0.19
769 0.19
770 0.2
771 0.2
772 0.2