Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VLM9

Protein Details
Accession H1VLM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
484-505AGGSRPKKRLRLNRSKHHKITFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
486-500GSRPKKRLRLNRSKH
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 13, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026849  ATG2  
IPR015412  Atg2/VPS13_C  
IPR026885  ATG2_mid_RBG  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0034045  C:phagophore assembly site membrane  
GO:0006914  P:autophagy  
GO:0006869  P:lipid transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF13329  ATG2_CAD  
PF09333  ATG_C  
Amino Acid Sequences MRDVTIDYRVPTIMDVLGLADDATPQDFEASLAASVANFGEQAHTALAGKKSQTTTRLPDPARPNSKPMTVDLVLRDCLIGLNPLNLPSKLLIALTDARFQVVLPKDVDTTASLDLNKASILLIDDVANVGASSTVNRRQSADMSSQQVSRLVSQGFVSICYISSAKAVVKVSETPEDGEKHVDIELRDDLLVLETCADSTQTLITLANALTPPTPPSKENKYRTSVVPVQDLLASISEEAFGKAEGDYDFDKDFELAQELGGSDEYDVASDSSPLQIDSRYYGDAGGPSEPLFDAEGSITSNATTTQDTHDGVLLTSFNASASHHSDDSSDLVIHEHFFDKGPETDGRAQVWNSSKNSYDRAPKELVRRSPLRVSVRDVHVIWNLFDGYDWERTRDVISKAVQDVENKAYERRRRSDRAVFEDDAEEDETVIGDFLFNSIYIGISTKQDPRELAQMVNQELNDNATETESLATTAFTTTTSRAGGSRPKKRLRLNRSKHHKITFELQGVNVDLIAFPPESGETQSSIDVRIQTLDVFDHVPTSTWKKFATYDQDAGEREMGTSMVHLELLNVKPQLDLAASEMVLRVTVLPLRLHVDQDALDFITRFFEFKDDSAPVHSSTSDVPFLQRVEVHDIPVKLDFKPKRVDYAGLKSGRTTEFMNFIILDEARMTLRHTIIYGVSGFDRMGKILNDIWMPDVKGTQLAGVLAGLAPVRGIVNIGSGFKELIEVPMREYKKDGRIVRSIGKGAAAFARTTGTEMVKFGAKLAIGTQYALQGAEGLLNKPQADNTWEEADLDPEEKKQISLYAEQPTGVIQGLRGGYSSLTRDLNMARDAIIAVPGEVMDSQSAQGLAKAVWKRAPTIIFRPAIGATKVIGQTLMGATNSLDPQNRRRAEEKYKRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.09
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.06
25 0.05
26 0.05
27 0.07
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.16
34 0.18
35 0.2
36 0.21
37 0.25
38 0.29
39 0.33
40 0.38
41 0.4
42 0.44
43 0.5
44 0.58
45 0.54
46 0.59
47 0.63
48 0.67
49 0.7
50 0.66
51 0.63
52 0.58
53 0.62
54 0.55
55 0.5
56 0.47
57 0.39
58 0.4
59 0.38
60 0.37
61 0.32
62 0.3
63 0.27
64 0.19
65 0.18
66 0.15
67 0.14
68 0.11
69 0.14
70 0.14
71 0.18
72 0.21
73 0.2
74 0.21
75 0.18
76 0.19
77 0.17
78 0.16
79 0.13
80 0.13
81 0.19
82 0.2
83 0.23
84 0.21
85 0.21
86 0.21
87 0.2
88 0.25
89 0.22
90 0.24
91 0.21
92 0.23
93 0.24
94 0.24
95 0.25
96 0.19
97 0.18
98 0.16
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.13
105 0.1
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.07
121 0.11
122 0.18
123 0.22
124 0.24
125 0.26
126 0.29
127 0.32
128 0.34
129 0.36
130 0.35
131 0.36
132 0.37
133 0.36
134 0.34
135 0.34
136 0.3
137 0.24
138 0.23
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.18
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.12
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.17
158 0.19
159 0.22
160 0.24
161 0.24
162 0.21
163 0.24
164 0.25
165 0.24
166 0.24
167 0.21
168 0.18
169 0.18
170 0.19
171 0.15
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.15
202 0.18
203 0.18
204 0.24
205 0.34
206 0.44
207 0.51
208 0.55
209 0.56
210 0.58
211 0.59
212 0.61
213 0.56
214 0.49
215 0.45
216 0.38
217 0.33
218 0.3
219 0.27
220 0.19
221 0.14
222 0.11
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.11
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.1
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.05
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.1
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.09
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.08
310 0.11
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.16
317 0.14
318 0.11
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.13
331 0.13
332 0.17
333 0.21
334 0.22
335 0.23
336 0.22
337 0.22
338 0.23
339 0.27
340 0.28
341 0.25
342 0.25
343 0.26
344 0.27
345 0.29
346 0.29
347 0.33
348 0.3
349 0.33
350 0.35
351 0.37
352 0.43
353 0.47
354 0.47
355 0.45
356 0.45
357 0.44
358 0.45
359 0.49
360 0.46
361 0.41
362 0.42
363 0.42
364 0.41
365 0.41
366 0.37
367 0.32
368 0.29
369 0.27
370 0.22
371 0.17
372 0.14
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.15
378 0.15
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.18
383 0.21
384 0.2
385 0.18
386 0.19
387 0.2
388 0.21
389 0.22
390 0.22
391 0.18
392 0.2
393 0.17
394 0.18
395 0.17
396 0.19
397 0.24
398 0.29
399 0.34
400 0.38
401 0.43
402 0.46
403 0.53
404 0.58
405 0.58
406 0.6
407 0.6
408 0.54
409 0.47
410 0.42
411 0.35
412 0.28
413 0.22
414 0.14
415 0.08
416 0.07
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.03
421 0.02
422 0.02
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.05
432 0.06
433 0.08
434 0.12
435 0.13
436 0.14
437 0.15
438 0.15
439 0.19
440 0.19
441 0.18
442 0.17
443 0.19
444 0.18
445 0.19
446 0.18
447 0.13
448 0.12
449 0.12
450 0.09
451 0.07
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.11
472 0.19
473 0.27
474 0.35
475 0.43
476 0.49
477 0.56
478 0.64
479 0.73
480 0.75
481 0.77
482 0.78
483 0.8
484 0.84
485 0.86
486 0.84
487 0.79
488 0.71
489 0.62
490 0.59
491 0.55
492 0.48
493 0.39
494 0.32
495 0.27
496 0.25
497 0.22
498 0.15
499 0.09
500 0.05
501 0.04
502 0.06
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.05
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.11
516 0.1
517 0.1
518 0.09
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.1
530 0.16
531 0.16
532 0.17
533 0.18
534 0.18
535 0.2
536 0.25
537 0.31
538 0.3
539 0.31
540 0.31
541 0.34
542 0.32
543 0.32
544 0.27
545 0.19
546 0.14
547 0.11
548 0.1
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.09
557 0.1
558 0.13
559 0.12
560 0.12
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.09
565 0.08
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.05
575 0.04
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.09
580 0.12
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.11
586 0.12
587 0.12
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.09
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.1
598 0.11
599 0.15
600 0.13
601 0.14
602 0.17
603 0.18
604 0.17
605 0.17
606 0.16
607 0.13
608 0.14
609 0.16
610 0.14
611 0.13
612 0.13
613 0.14
614 0.14
615 0.14
616 0.14
617 0.14
618 0.21
619 0.21
620 0.22
621 0.24
622 0.24
623 0.24
624 0.27
625 0.26
626 0.18
627 0.27
628 0.27
629 0.28
630 0.36
631 0.36
632 0.38
633 0.39
634 0.44
635 0.41
636 0.46
637 0.5
638 0.44
639 0.43
640 0.37
641 0.39
642 0.35
643 0.3
644 0.24
645 0.18
646 0.19
647 0.19
648 0.2
649 0.16
650 0.16
651 0.16
652 0.13
653 0.12
654 0.09
655 0.09
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.1
660 0.11
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.12
665 0.13
666 0.12
667 0.1
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.09
674 0.11
675 0.1
676 0.12
677 0.13
678 0.15
679 0.14
680 0.14
681 0.16
682 0.15
683 0.15
684 0.14
685 0.13
686 0.11
687 0.11
688 0.11
689 0.1
690 0.08
691 0.08
692 0.07
693 0.07
694 0.06
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.05
704 0.04
705 0.07
706 0.08
707 0.09
708 0.1
709 0.1
710 0.1
711 0.09
712 0.11
713 0.08
714 0.11
715 0.15
716 0.15
717 0.18
718 0.26
719 0.27
720 0.26
721 0.3
722 0.33
723 0.36
724 0.44
725 0.47
726 0.45
727 0.5
728 0.55
729 0.57
730 0.56
731 0.5
732 0.42
733 0.38
734 0.32
735 0.27
736 0.25
737 0.2
738 0.15
739 0.14
740 0.14
741 0.12
742 0.14
743 0.15
744 0.14
745 0.13
746 0.14
747 0.15
748 0.16
749 0.16
750 0.15
751 0.15
752 0.13
753 0.12
754 0.13
755 0.16
756 0.14
757 0.15
758 0.14
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.12
763 0.08
764 0.07
765 0.11
766 0.11
767 0.11
768 0.13
769 0.14
770 0.15
771 0.15
772 0.16
773 0.14
774 0.17
775 0.2
776 0.22
777 0.23
778 0.23
779 0.24
780 0.24
781 0.23
782 0.22
783 0.19
784 0.16
785 0.14
786 0.17
787 0.16
788 0.16
789 0.14
790 0.17
791 0.19
792 0.24
793 0.27
794 0.31
795 0.31
796 0.31
797 0.3
798 0.26
799 0.24
800 0.19
801 0.14
802 0.08
803 0.11
804 0.12
805 0.12
806 0.12
807 0.11
808 0.11
809 0.14
810 0.17
811 0.16
812 0.17
813 0.17
814 0.19
815 0.2
816 0.24
817 0.22
818 0.2
819 0.17
820 0.16
821 0.17
822 0.14
823 0.14
824 0.1
825 0.09
826 0.08
827 0.08
828 0.08
829 0.07
830 0.08
831 0.07
832 0.07
833 0.07
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.1
838 0.1
839 0.1
840 0.17
841 0.2
842 0.23
843 0.27
844 0.28
845 0.31
846 0.35
847 0.41
848 0.4
849 0.44
850 0.49
851 0.46
852 0.45
853 0.44
854 0.4
855 0.39
856 0.33
857 0.27
858 0.19
859 0.24
860 0.24
861 0.22
862 0.19
863 0.15
864 0.16
865 0.16
866 0.18
867 0.11
868 0.11
869 0.11
870 0.15
871 0.17
872 0.18
873 0.23
874 0.25
875 0.34
876 0.44
877 0.47
878 0.49
879 0.52
880 0.58
881 0.64