Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VCA0

Protein Details
Accession H1VCA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50HKSFRNASWRPNQRRNKNIKTILGHydrophilic
90-112DERHLDARKRHRQRQRQSQPGTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-104HGGGRRRRRPLDERHLDARKRHRQRQ
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029525  INO80C/Ies6  
IPR013272  Vps72/YL1_C  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF08265  YL1_C  
Amino Acid Sequences MAAPKEATEAQIAHQALLDELDIHSIHKSFRNASWRPNQRRNKNIKTILGDASRREASALATPQQEEASAAATPTTDKHGGGRRRRRPLDERHLDARKRHRQRQRQSQPGTGLAHGGPGPSVTYTNIESAPSLAHTRRYCDITGLPAPYVDPKTRLRYHDKEVFGLIRTLPQGAAEQYLEARGAHTVLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.15
4 0.15
5 0.14
6 0.07
7 0.07
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.12
14 0.17
15 0.2
16 0.21
17 0.27
18 0.35
19 0.37
20 0.45
21 0.53
22 0.59
23 0.66
24 0.73
25 0.78
26 0.78
27 0.86
28 0.88
29 0.87
30 0.87
31 0.84
32 0.8
33 0.74
34 0.68
35 0.63
36 0.58
37 0.5
38 0.41
39 0.39
40 0.33
41 0.27
42 0.24
43 0.19
44 0.15
45 0.18
46 0.19
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.17
52 0.16
53 0.11
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.13
66 0.21
67 0.3
68 0.4
69 0.5
70 0.55
71 0.64
72 0.68
73 0.71
74 0.71
75 0.72
76 0.73
77 0.7
78 0.66
79 0.63
80 0.66
81 0.62
82 0.6
83 0.6
84 0.59
85 0.61
86 0.65
87 0.68
88 0.72
89 0.79
90 0.85
91 0.85
92 0.85
93 0.81
94 0.77
95 0.7
96 0.64
97 0.55
98 0.44
99 0.34
100 0.24
101 0.2
102 0.15
103 0.12
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.08
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.12
120 0.11
121 0.18
122 0.19
123 0.23
124 0.26
125 0.29
126 0.27
127 0.27
128 0.28
129 0.26
130 0.29
131 0.26
132 0.23
133 0.2
134 0.2
135 0.22
136 0.24
137 0.2
138 0.21
139 0.25
140 0.33
141 0.39
142 0.44
143 0.49
144 0.52
145 0.58
146 0.62
147 0.59
148 0.53
149 0.51
150 0.48
151 0.4
152 0.35
153 0.27
154 0.22
155 0.2
156 0.19
157 0.15
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.16
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.09