FuNGI

H1VPF6

Protein Details

Accession

H1VPF6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
125-149	PPTTDYLRRHGRQRRALRQPEHTNA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009401 Med13_C
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06333 Med13_C

Amino Acid Sequences

MMXPTARKPSTSKXPVFAKPELKHARSTLLDEGKQKSNADKSAGAKRASSPFDPDTVYKRVRASLADIRSAPQETPTRKGSIFDSVDFDPVLPLVNKKYEQGGRFGCPPIFHGQSQDASKQPGAQWPPTTDYLRRHGRQRRALRQPEHTNALIRTITGNLENSSLVASPGKGDDLASDADDISLVSDQDDSSVSEDEPTSPFKSSIRRINLDDDVASHVTSLREIESMEDSDPTLALDLPKLAKTESSEILIPKYFEDAESLPIHLSLPDEDTITIAQIVTEQAATGILRIRDVHANTLNTAIVADTRRQLSYLGRTALQALREVIPPCLGEFNICNFKSVVEVPDVPLIGPPNRLHPRPVNPRDAAEPPKPNNLFQIPAPHMELRRAEARLSVLPASVQFWESLGLGPAQGTKDVNVVCVFPHWDGMSDIAASFLDRMRNVYELLKLGSFERLPPSSKVTDGLMPFEADKIATSPGTVSPHIVAGLGDRMEALNQALISANATEKNFLIYFVYPPDHPGSIVEACTAFQQLFEMHRRSLTDRRQSPTNELVLQLVPLDFLTSSTGIVEPTPSDVIRLAIETYDRCTLFGGPMPSPAIMLEQSLPRGIDFKLSNTSSSSLMHENTCIHIAYAQSIDERWITAAWTDNRGCQQMTASYNLGRKGKPLSTSLNDVYHEIWETTHDLISKWKVHWRVIISKCGYMDAQEIGFWQGLAQTESIATVSLTLISVDTNPSMQLVPPPIKVQATASSAFYTTPVSTPQASIVSPEQSGTPVTPMKENNPATAATPGGTPVDGNADPAEGDAILLDVTDQTWGAVLAHRLSNSSSLGEMNSALVSGYLVKRGGTKLEDPPVVMEVNIVHADNNPRMYEPLMREMLTYFRGLGTLARARGIVDRGTDVRPWHIAAAEKGVRALYLLM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.7
3	0.71
4	0.62
5	0.67
6	0.7
7	0.65
8	0.61
9	0.55
10	0.55
11	0.48
12	0.51
13	0.49
14	0.47
15	0.49
16	0.49
17	0.52
18	0.52
19	0.52
20	0.49
21	0.47
22	0.47
23	0.46
24	0.45
25	0.46
26	0.45
27	0.52
28	0.56
29	0.51
30	0.45
31	0.47
32	0.5
33	0.49
34	0.46
35	0.43
36	0.38
37	0.4
38	0.41
39	0.39
40	0.36
41	0.39
42	0.4
43	0.37
44	0.37
45	0.38
46	0.37
47	0.36
48	0.38
49	0.38
50	0.4
51	0.41
52	0.39
53	0.37
54	0.38
55	0.38
56	0.31
57	0.29
58	0.33
59	0.32
60	0.36
61	0.39
62	0.4
63	0.39
64	0.4
65	0.37
66	0.38
67	0.37
68	0.34
69	0.34
70	0.31
71	0.31
72	0.29
73	0.27
74	0.17
75	0.14
76	0.15
77	0.11
78	0.13
79	0.16
80	0.21
81	0.22
82	0.23
83	0.32
84	0.35
85	0.36
86	0.41
87	0.42
88	0.4
89	0.44
90	0.46
91	0.39
92	0.33
93	0.35
94	0.34
95	0.33
96	0.3
97	0.3
98	0.3
99	0.33
100	0.36
101	0.37
102	0.33
103	0.32
104	0.32
105	0.32
106	0.3
107	0.33
108	0.34
109	0.36
110	0.37
111	0.37
112	0.41
113	0.42
114	0.45
115	0.42
116	0.43
117	0.46
118	0.52
119	0.53
120	0.58
121	0.63
122	0.69
123	0.74
124	0.79
125	0.81
126	0.82
127	0.88
128	0.85
129	0.85
130	0.84
131	0.8
132	0.75
133	0.66
134	0.59
135	0.5
136	0.47
137	0.37
138	0.28
139	0.23
140	0.18
141	0.18
142	0.16
143	0.17
144	0.13
145	0.14
146	0.14
147	0.13
148	0.12
149	0.11
150	0.1
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.09
155	0.1
156	0.09
157	0.09
158	0.08
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.08
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.07
174	0.08
175	0.07
176	0.09
177	0.1
178	0.1
179	0.11
180	0.11
181	0.12
182	0.13
183	0.16
184	0.16
185	0.16
186	0.17
187	0.19
188	0.26
189	0.31
190	0.39
191	0.43
192	0.46
193	0.47
194	0.52
195	0.52
196	0.46
197	0.39
198	0.31
199	0.27
200	0.24
201	0.21
202	0.15
203	0.14
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.1
211	0.11
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.09
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.08
224	0.09
225	0.11
226	0.12
227	0.11
228	0.12
229	0.15
230	0.19
231	0.18
232	0.19
233	0.19
234	0.2
235	0.22
236	0.22
237	0.19
238	0.15
239	0.16
240	0.14
241	0.12
242	0.14
243	0.12
244	0.15
245	0.15
246	0.16
247	0.14
248	0.14
249	0.14
250	0.11
251	0.11
252	0.07
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.11
277	0.16
278	0.17
279	0.21
280	0.22
281	0.23
282	0.23
283	0.24
284	0.22
285	0.16
286	0.16
287	0.1
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.15
296	0.16
297	0.21
298	0.24
299	0.23
300	0.22
301	0.22
302	0.25
303	0.25
304	0.23
305	0.18
306	0.14
307	0.14
308	0.17
309	0.18
310	0.16
311	0.15
312	0.14
313	0.13
314	0.13
315	0.11
316	0.09
317	0.09
318	0.13
319	0.21
320	0.21
321	0.21
322	0.2
323	0.2
324	0.21
325	0.21
326	0.18
327	0.12
328	0.13
329	0.13
330	0.14
331	0.14
332	0.12
333	0.12
334	0.13
335	0.11
336	0.14
337	0.13
338	0.21
339	0.26
340	0.27
341	0.3
342	0.34
343	0.43
344	0.5
345	0.56
346	0.54
347	0.5
348	0.51
349	0.51
350	0.5
351	0.46
352	0.41
353	0.43
354	0.38
355	0.45
356	0.45
357	0.41
358	0.4
359	0.36
360	0.31
361	0.25
362	0.3
363	0.23
364	0.24
365	0.26
366	0.24
367	0.23
368	0.24
369	0.24
370	0.19
371	0.21
372	0.2
373	0.17
374	0.17
375	0.18
376	0.16
377	0.17
378	0.15
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.09
384	0.08
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.08
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.06
423	0.08
424	0.08
425	0.09
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.11
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.11
438	0.12
439	0.14
440	0.15
441	0.19
442	0.17
443	0.18
444	0.18
445	0.16
446	0.18
447	0.16
448	0.16
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.11
453	0.1
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.08
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.09
466	0.1
467	0.1
468	0.09
469	0.07
470	0.05
471	0.07
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.07
488	0.07
489	0.08
490	0.07
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.1
495	0.09
496	0.09
497	0.11
498	0.12
499	0.1
500	0.12
501	0.14
502	0.12
503	0.12
504	0.11
505	0.13
506	0.12
507	0.13
508	0.11
509	0.09
510	0.09
511	0.1
512	0.1
513	0.06
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.09
518	0.14
519	0.16
520	0.16
521	0.17
522	0.19
523	0.23
524	0.3
525	0.35
526	0.4
527	0.43
528	0.47
529	0.51
530	0.52
531	0.53
532	0.49
533	0.44
534	0.35
535	0.3
536	0.27
537	0.22
538	0.2
539	0.14
540	0.09
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.04
545	0.04
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.07
556	0.08
557	0.07
558	0.08
559	0.08
560	0.09
561	0.09
562	0.09
563	0.07
564	0.07
565	0.08
566	0.08
567	0.1
568	0.13
569	0.13
570	0.12
571	0.13
572	0.13
573	0.13
574	0.16
575	0.16
576	0.13
577	0.15
578	0.15
579	0.14
580	0.14
581	0.13
582	0.11
583	0.08
584	0.09
585	0.09
586	0.09
587	0.09
588	0.1
589	0.1
590	0.09
591	0.1
592	0.1
593	0.14
594	0.13
595	0.15
596	0.21
597	0.21
598	0.22
599	0.22
600	0.23
601	0.19
602	0.19
603	0.2
604	0.16
605	0.16
606	0.16
607	0.16
608	0.15
609	0.15
610	0.16
611	0.13
612	0.11
613	0.11
614	0.1
615	0.11
616	0.11
617	0.1
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.09
622	0.09
623	0.08
624	0.07
625	0.07
626	0.07
627	0.14
628	0.14
629	0.2
630	0.2
631	0.23
632	0.25
633	0.26
634	0.26
635	0.19
636	0.19
637	0.19
638	0.2
639	0.21
640	0.2
641	0.22
642	0.25
643	0.29
644	0.31
645	0.26
646	0.26
647	0.28
648	0.3
649	0.29
650	0.3
651	0.33
652	0.32
653	0.38
654	0.39
655	0.36
656	0.34
657	0.32
658	0.28
659	0.23
660	0.2
661	0.15
662	0.12
663	0.11
664	0.12
665	0.12
666	0.13
667	0.12
668	0.12
669	0.16
670	0.21
671	0.23
672	0.23
673	0.29
674	0.31
675	0.34
676	0.39
677	0.4
678	0.45
679	0.45
680	0.52
681	0.48
682	0.46
683	0.44
684	0.4
685	0.34
686	0.25
687	0.23
688	0.16
689	0.13
690	0.11
691	0.11
692	0.11
693	0.11
694	0.09
695	0.08
696	0.08
697	0.08
698	0.09
699	0.09
700	0.07
701	0.07
702	0.08
703	0.08
704	0.07
705	0.05
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.06
714	0.07
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.08
719	0.08
720	0.09
721	0.12
722	0.16
723	0.19
724	0.2
725	0.22
726	0.23
727	0.24
728	0.24
729	0.23
730	0.23
731	0.24
732	0.23
733	0.23
734	0.22
735	0.21
736	0.21
737	0.19
738	0.15
739	0.12
740	0.12
741	0.13
742	0.15
743	0.16
744	0.16
745	0.18
746	0.17
747	0.16
748	0.18
749	0.19
750	0.18
751	0.17
752	0.17
753	0.15
754	0.14
755	0.15
756	0.13
757	0.14
758	0.15
759	0.16
760	0.21
761	0.23
762	0.26
763	0.34
764	0.35
765	0.33
766	0.32
767	0.31
768	0.28
769	0.27
770	0.24
771	0.15
772	0.14
773	0.13
774	0.11
775	0.11
776	0.09
777	0.08
778	0.13
779	0.12
780	0.13
781	0.12
782	0.12
783	0.12
784	0.12
785	0.12
786	0.06
787	0.06
788	0.05
789	0.05
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.03
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.04
798	0.04
799	0.05
800	0.06
801	0.08
802	0.1
803	0.13
804	0.15
805	0.15
806	0.16
807	0.17
808	0.19
809	0.18
810	0.17
811	0.15
812	0.14
813	0.14
814	0.14
815	0.13
816	0.11
817	0.09
818	0.08
819	0.07
820	0.06
821	0.06
822	0.09
823	0.1
824	0.12
825	0.12
826	0.13
827	0.16
828	0.18
829	0.22
830	0.23
831	0.27
832	0.31
833	0.39
834	0.39
835	0.37
836	0.37
837	0.35
838	0.31
839	0.25
840	0.19
841	0.12
842	0.14
843	0.14
844	0.13
845	0.11
846	0.14
847	0.2
848	0.23
849	0.25
850	0.23
851	0.23
852	0.24
853	0.26
854	0.3
855	0.29
856	0.33
857	0.33
858	0.32
859	0.31
860	0.31
861	0.33
862	0.27
863	0.24
864	0.17
865	0.14
866	0.14
867	0.14
868	0.14
869	0.17
870	0.21
871	0.21
872	0.22
873	0.22
874	0.23
875	0.27
876	0.28
877	0.24
878	0.2
879	0.24
880	0.26
881	0.28
882	0.3
883	0.28
884	0.29
885	0.29
886	0.29
887	0.25
888	0.25
889	0.27
890	0.26
891	0.33
892	0.32
893	0.3
894	0.3
895	0.28
896	0.25

H1VPF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer