FuNGI

A0A5E8C6R2

Protein Details

Accession

A0A5E8C6R2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MSSRQKRTEEYRGRDNRYDR	Hydrophilic
25-54	EYRGRGRPDEYRSRRDHRRSVSPDDRLRRD	Basic
72-106	DRNYGDKRDSPRPRSRERSRERRKSPVRTERASSK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
78-112	KRDSPRPRSRERSRERRKSPVRTERASSKDHAEKK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 9.5, plas 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040752 HSM3_C IPR041335 HSM3_N IPR013957 SNRNP27
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
Pfam	View protein in Pfam PF18794 HSM3_C PF18795 HSM3_N PF08648 SNRNP27

Amino Acid Sequences

MSSRQKRTEEYRGRDNRYDRYDRDEYRGRGRPDEYRSRRDHRRSVSPDDRLRRDDRYAYRRDYEREPSSWRDRNYGDKRDSPRPRSRERSRERRKSPVRTERASSKDHAEKKPEDSKEPLKYSKDEDESEDPELLMQKMMGFGSFGTTKGKKVSGANVGGVAKEKASNFRQYMNRSGGFNRELSPPPEERRKHRLEAVISGDDLDVNIVNSMTDKLRFDASVLAAGDGVVLALLPPAIGVLKYSATEHVDGLDGVVELIEALLSRKSFTEVLTLIPLDDLLTAAATVLVPSLQVVAIQQLSKVSTEDLIQHKEILQTLVEQLADPETKSIKAFESCLVKLAQGEAGLRQLESGNTYAVLKKMHNSNNSVLIGRVLEVAKGLVAIDPVAEFTSLIQFDPEIFNPAHWDVLLVSTIITYYREILSNSNVVRALENELYTIAYVYSKRSEEPEVRMFLQSDIVGLFGTLSRHYPEEFHAIDAKYKIVEDSLTDQEDRVRVLTMLGPKYLLQYHKSALKTIKYDAKDVSALRNLLSDQESFEFMAPTQAQILQLNEYDDKMFILSGVLKTEAGLHALLSTWPGVMNEIVHPTSAVSNPQSLDLRREVLEILVDAKPSDLGVWYGPVREAYRELIFGKNSGNAPQVAIAHKSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.78
3	0.76
4	0.75
5	0.76
6	0.67
7	0.66
8	0.68
9	0.63
10	0.65
11	0.65
12	0.61
13	0.62
14	0.68
15	0.63
16	0.6
17	0.61
18	0.61
19	0.61
20	0.67
21	0.66
22	0.67
23	0.71
24	0.74
25	0.8
26	0.81
27	0.82
28	0.79
29	0.82
30	0.8
31	0.82
32	0.82
33	0.81
34	0.81
35	0.81
36	0.79
37	0.74
38	0.72
39	0.67
40	0.63
41	0.63
42	0.63
43	0.63
44	0.64
45	0.65
46	0.68
47	0.68
48	0.66
49	0.64
50	0.63
51	0.6
52	0.57
53	0.56
54	0.57
55	0.61
56	0.63
57	0.59
58	0.56
59	0.53
60	0.6
61	0.63
62	0.65
63	0.62
64	0.63
65	0.67
66	0.71
67	0.78
68	0.77
69	0.77
70	0.76
71	0.8
72	0.82
73	0.86
74	0.86
75	0.87
76	0.89
77	0.9
78	0.92
79	0.9
80	0.9
81	0.9
82	0.9
83	0.9
84	0.9
85	0.87
86	0.82
87	0.8
88	0.79
89	0.74
90	0.67
91	0.59
92	0.56
93	0.56
94	0.59
95	0.59
96	0.57
97	0.56
98	0.59
99	0.65
100	0.61
101	0.57
102	0.56
103	0.58
104	0.6
105	0.63
106	0.61
107	0.56
108	0.55
109	0.55
110	0.56
111	0.52
112	0.45
113	0.44
114	0.43
115	0.42
116	0.41
117	0.36
118	0.27
119	0.23
120	0.24
121	0.18
122	0.13
123	0.1
124	0.08
125	0.09
126	0.09
127	0.08
128	0.06
129	0.06
130	0.09
131	0.1
132	0.1
133	0.15
134	0.16
135	0.18
136	0.21
137	0.22
138	0.22
139	0.25
140	0.3
141	0.32
142	0.33
143	0.32
144	0.33
145	0.31
146	0.28
147	0.27
148	0.21
149	0.14
150	0.14
151	0.14
152	0.17
153	0.21
154	0.28
155	0.27
156	0.34
157	0.4
158	0.42
159	0.48
160	0.48
161	0.46
162	0.41
163	0.42
164	0.4
165	0.35
166	0.32
167	0.28
168	0.26
169	0.27
170	0.27
171	0.3
172	0.29
173	0.33
174	0.41
175	0.43
176	0.46
177	0.53
178	0.57
179	0.56
180	0.58
181	0.59
182	0.52
183	0.54
184	0.52
185	0.43
186	0.37
187	0.33
188	0.27
189	0.2
190	0.17
191	0.11
192	0.06
193	0.04
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.06
199	0.07
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.13
207	0.13
208	0.14
209	0.14
210	0.13
211	0.11
212	0.11
213	0.1
214	0.07
215	0.06
216	0.02
217	0.02
218	0.02
219	0.02
220	0.02
221	0.02
222	0.02
223	0.02
224	0.02
225	0.02
226	0.03
227	0.04
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.08
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.08
239	0.07
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.02
247	0.02
248	0.03
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.12
257	0.11
258	0.12
259	0.13
260	0.12
261	0.1
262	0.1
263	0.09
264	0.06
265	0.05
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.02
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.11
294	0.14
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.17
300	0.17
301	0.12
302	0.09
303	0.07
304	0.08
305	0.08
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.08
318	0.09
319	0.11
320	0.13
321	0.17
322	0.16
323	0.18
324	0.17
325	0.16
326	0.15
327	0.14
328	0.12
329	0.08
330	0.08
331	0.06
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.08
339	0.08
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.08
344	0.09
345	0.1
346	0.09
347	0.12
348	0.19
349	0.24
350	0.27
351	0.3
352	0.31
353	0.35
354	0.36
355	0.33
356	0.25
357	0.2
358	0.17
359	0.13
360	0.13
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.07
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.12
390	0.13
391	0.12
392	0.1
393	0.1
394	0.07
395	0.08
396	0.09
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.05
404	0.06
405	0.07
406	0.08
407	0.09
408	0.11
409	0.13
410	0.17
411	0.17
412	0.17
413	0.17
414	0.16
415	0.16
416	0.15
417	0.17
418	0.14
419	0.14
420	0.12
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.09
429	0.12
430	0.12
431	0.13
432	0.16
433	0.21
434	0.24
435	0.3
436	0.33
437	0.33
438	0.34
439	0.34
440	0.32
441	0.27
442	0.25
443	0.18
444	0.13
445	0.1
446	0.08
447	0.07
448	0.06
449	0.06
450	0.05
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.09
455	0.1
456	0.11
457	0.12
458	0.14
459	0.19
460	0.19
461	0.2
462	0.23
463	0.23
464	0.25
465	0.25
466	0.23
467	0.17
468	0.16
469	0.15
470	0.1
471	0.1
472	0.09
473	0.14
474	0.16
475	0.18
476	0.18
477	0.18
478	0.19
479	0.2
480	0.19
481	0.14
482	0.12
483	0.1
484	0.11
485	0.15
486	0.19
487	0.2
488	0.19
489	0.19
490	0.19
491	0.21
492	0.24
493	0.23
494	0.2
495	0.21
496	0.24
497	0.3
498	0.31
499	0.33
500	0.34
501	0.37
502	0.37
503	0.39
504	0.44
505	0.39
506	0.42
507	0.38
508	0.36
509	0.35
510	0.33
511	0.33
512	0.3
513	0.28
514	0.25
515	0.25
516	0.22
517	0.21
518	0.22
519	0.17
520	0.14
521	0.15
522	0.16
523	0.16
524	0.16
525	0.14
526	0.12
527	0.17
528	0.15
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.15
533	0.16
534	0.18
535	0.14
536	0.15
537	0.18
538	0.17
539	0.17
540	0.16
541	0.14
542	0.13
543	0.11
544	0.1
545	0.07
546	0.08
547	0.1
548	0.1
549	0.12
550	0.12
551	0.12
552	0.12
553	0.14
554	0.13
555	0.12
556	0.11
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.08
567	0.09
568	0.1
569	0.11
570	0.15
571	0.15
572	0.15
573	0.15
574	0.14
575	0.16
576	0.16
577	0.18
578	0.16
579	0.19
580	0.2
581	0.24
582	0.27
583	0.26
584	0.3
585	0.29
586	0.3
587	0.28
588	0.29
589	0.25
590	0.21
591	0.21
592	0.16
593	0.16
594	0.14
595	0.14
596	0.13
597	0.13
598	0.12
599	0.11
600	0.11
601	0.08
602	0.08
603	0.09
604	0.13
605	0.14
606	0.15
607	0.16
608	0.19
609	0.19
610	0.21
611	0.23
612	0.23
613	0.24
614	0.26
615	0.28
616	0.29
617	0.29
618	0.28
619	0.27
620	0.28
621	0.27
622	0.28
623	0.29
624	0.24
625	0.24
626	0.25
627	0.26
628	0.24

A0A5E8C6R2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer