FuNGI

A0A5E8C5L8

Protein Details

Accession

A0A5E8C5L8

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-36	IQPKRRFARNADPLRRPSRPLIKKPGTGKPI	Hydrophilic
104-126	VGTFTKPIRLHRKDPRNMQNQLT	Hydrophilic
499-535	ANGEEKPKKKLKDKKLKEKKKKKNSKKHHDLPHGMVI	Basic
566-588	EEHGLKHKTKKLKVKDKSNAGGA	Basic
690-710	LAVFKNRLKRHPENLKLLKLH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-34	KRRFARNADPLRRPSRPLIKKPGTGK
504-526	KPKKKLKDKKLKEKKKKKNSKKH
571-582	KHKTKKLKVKDK

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSNPLIQPKRRFARNADPLRRPSRPLIKKPGTGKPIVTKTKPLLNSQPSTSVLASAIAAEPDSSKSSDKTQYREYNLNACNEDDIKDLRYHLMRFHSKSEVDPVGTFTKPIRLHRKDPRNMQNQLTLAELEERNKRLGITTPIPKHLLAEPTATEEKVTGEEPVKTENEESKTSDTANGKDDAKQKGKTPSEEADMSLIAPDGGARRGKSHLFQKKTKQVVLGDTNARKLRYEEYYPWILEDFDGKNTWVGNYEAGQTDAYVLFVFDNDGFKMVPAEKWYKMTPRNKYATLTSEEAEKQMEKGELPNRWVMKYFGNEEDSANKRPTNMRRRFRTTDSSTVDEMRRDDDGNDIDFDEEFADDEEAPIMEGNEDEVKEVENKIKKEHQSAKISALFNENENEEEEEEEDRKVDKQGKHMIKYLRSREKNINYETDDDSNPYATEESSDEEEEIDNPASLGGALKGANGTEVKKEPGTEAAQTEGVTVKTEEGTEGTPAALANGEEKPKKKLKDKKLKEKKKKKNSKKHHDLPHGMVILNLPAAKLAQFQPDLWNPGLKRRRAELSDDEEHGLKHKTKKLKVKDKSNAGGANKGSGTAVQTSVKSANPSVNISTAATAAASNGAAANPSAANGQPTSSGNKPSTSLAVSTPAEGSSSNSSSGSSAVSNGADLITEEEVKQVVRSQRLNAKEILAVFKNRLKRHPENLKLLKLHLKRLVRLHEGYLVLRDNI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.79
3	0.79
4	0.78
5	0.8
6	0.83
7	0.79
8	0.73
9	0.72
10	0.71
11	0.72
12	0.73
13	0.76
14	0.76
15	0.79
16	0.82
17	0.82
18	0.77
19	0.71
20	0.66
21	0.65
22	0.66
23	0.67
24	0.63
25	0.61
26	0.59
27	0.64
28	0.62
29	0.59
30	0.59
31	0.58
32	0.59
33	0.55
34	0.55
35	0.49
36	0.49
37	0.42
38	0.33
39	0.25
40	0.21
41	0.18
42	0.14
43	0.13
44	0.09
45	0.09
46	0.08
47	0.09
48	0.1
49	0.13
50	0.13
51	0.15
52	0.17
53	0.23
54	0.32
55	0.36
56	0.4
57	0.48
58	0.54
59	0.58
60	0.63
61	0.61
62	0.61
63	0.6
64	0.59
65	0.5
66	0.42
67	0.39
68	0.33
69	0.31
70	0.24
71	0.23
72	0.2
73	0.2
74	0.21
75	0.22
76	0.26
77	0.26
78	0.27
79	0.35
80	0.41
81	0.43
82	0.46
83	0.47
84	0.44
85	0.45
86	0.47
87	0.41
88	0.35
89	0.32
90	0.31
91	0.29
92	0.28
93	0.27
94	0.2
95	0.25
96	0.28
97	0.36
98	0.43
99	0.47
100	0.56
101	0.66
102	0.76
103	0.77
104	0.83
105	0.84
106	0.83
107	0.81
108	0.75
109	0.71
110	0.62
111	0.54
112	0.45
113	0.34
114	0.26
115	0.26
116	0.23
117	0.2
118	0.25
119	0.25
120	0.25
121	0.26
122	0.25
123	0.21
124	0.26
125	0.29
126	0.3
127	0.38
128	0.41
129	0.44
130	0.46
131	0.44
132	0.41
133	0.38
134	0.34
135	0.26
136	0.25
137	0.21
138	0.25
139	0.27
140	0.24
141	0.21
142	0.17
143	0.16
144	0.15
145	0.15
146	0.12
147	0.12
148	0.14
149	0.15
150	0.18
151	0.18
152	0.18
153	0.19
154	0.23
155	0.25
156	0.25
157	0.27
158	0.27
159	0.27
160	0.27
161	0.3
162	0.27
163	0.25
164	0.26
165	0.26
166	0.24
167	0.29
168	0.34
169	0.37
170	0.4
171	0.4
172	0.42
173	0.49
174	0.53
175	0.51
176	0.5
177	0.46
178	0.45
179	0.43
180	0.38
181	0.3
182	0.25
183	0.21
184	0.16
185	0.12
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.08
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.17
195	0.19
196	0.24
197	0.33
198	0.4
199	0.45
200	0.52
201	0.6
202	0.66
203	0.7
204	0.66
205	0.61
206	0.54
207	0.53
208	0.51
209	0.46
210	0.44
211	0.39
212	0.43
213	0.41
214	0.39
215	0.32
216	0.29
217	0.28
218	0.27
219	0.31
220	0.29
221	0.31
222	0.35
223	0.34
224	0.33
225	0.29
226	0.24
227	0.18
228	0.18
229	0.14
230	0.12
231	0.13
232	0.12
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.11
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.11
241	0.11
242	0.12
243	0.11
244	0.09
245	0.1
246	0.09
247	0.08
248	0.06
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.09
260	0.08
261	0.09
262	0.12
263	0.16
264	0.16
265	0.19
266	0.22
267	0.27
268	0.35
269	0.42
270	0.46
271	0.5
272	0.54
273	0.53
274	0.53
275	0.49
276	0.45
277	0.41
278	0.35
279	0.27
280	0.25
281	0.23
282	0.22
283	0.2
284	0.16
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.09
289	0.13
290	0.18
291	0.19
292	0.21
293	0.25
294	0.24
295	0.24
296	0.25
297	0.22
298	0.21
299	0.21
300	0.22
301	0.21
302	0.22
303	0.22
304	0.21
305	0.25
306	0.26
307	0.26
308	0.24
309	0.22
310	0.21
311	0.28
312	0.37
313	0.42
314	0.48
315	0.54
316	0.61
317	0.69
318	0.72
319	0.71
320	0.7
321	0.65
322	0.64
323	0.59
324	0.54
325	0.46
326	0.44
327	0.4
328	0.32
329	0.26
330	0.19
331	0.16
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.13
336	0.12
337	0.12
338	0.11
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.07
343	0.05
344	0.05
345	0.04
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.12
365	0.16
366	0.16
367	0.2
368	0.26
369	0.28
370	0.36
371	0.44
372	0.47
373	0.49
374	0.5
375	0.51
376	0.51
377	0.49
378	0.41
379	0.36
380	0.28
381	0.23
382	0.22
383	0.17
384	0.12
385	0.12
386	0.12
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.12
397	0.18
398	0.19
399	0.25
400	0.35
401	0.41
402	0.43
403	0.48
404	0.5
405	0.5
406	0.56
407	0.58
408	0.59
409	0.56
410	0.58
411	0.61
412	0.64
413	0.64
414	0.59
415	0.54
416	0.46
417	0.46
418	0.44
419	0.37
420	0.29
421	0.24
422	0.21
423	0.17
424	0.15
425	0.12
426	0.1
427	0.07
428	0.08
429	0.07
430	0.09
431	0.1
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.1
438	0.09
439	0.07
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.05
445	0.04
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.08
454	0.1
455	0.12
456	0.14
457	0.14
458	0.15
459	0.14
460	0.18
461	0.19
462	0.17
463	0.16
464	0.16
465	0.16
466	0.16
467	0.16
468	0.12
469	0.11
470	0.1
471	0.09
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.06
485	0.05
486	0.07
487	0.09
488	0.14
489	0.17
490	0.19
491	0.25
492	0.32
493	0.38
494	0.46
495	0.54
496	0.61
497	0.69
498	0.79
499	0.83
500	0.88
501	0.93
502	0.95
503	0.96
504	0.96
505	0.95
506	0.96
507	0.96
508	0.96
509	0.96
510	0.96
511	0.96
512	0.94
513	0.94
514	0.92
515	0.87
516	0.8
517	0.76
518	0.66
519	0.55
520	0.45
521	0.35
522	0.25
523	0.2
524	0.15
525	0.07
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.08
530	0.1
531	0.13
532	0.15
533	0.15
534	0.21
535	0.24
536	0.27
537	0.26
538	0.29
539	0.25
540	0.34
541	0.41
542	0.39
543	0.4
544	0.41
545	0.47
546	0.45
547	0.51
548	0.49
549	0.49
550	0.5
551	0.48
552	0.45
553	0.38
554	0.35
555	0.31
556	0.28
557	0.25
558	0.28
559	0.33
560	0.41
561	0.49
562	0.6
563	0.68
564	0.75
565	0.79
566	0.83
567	0.85
568	0.86
569	0.82
570	0.78
571	0.74
572	0.65
573	0.61
574	0.5
575	0.44
576	0.34
577	0.3
578	0.23
579	0.17
580	0.17
581	0.13
582	0.15
583	0.14
584	0.14
585	0.16
586	0.18
587	0.19
588	0.2
589	0.19
590	0.21
591	0.22
592	0.24
593	0.23
594	0.23
595	0.22
596	0.21
597	0.2
598	0.16
599	0.13
600	0.1
601	0.09
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.05
606	0.06
607	0.05
608	0.06
609	0.06
610	0.07
611	0.06
612	0.07
613	0.08
614	0.08
615	0.1
616	0.1
617	0.11
618	0.12
619	0.14
620	0.19
621	0.21
622	0.27
623	0.27
624	0.28
625	0.29
626	0.28
627	0.3
628	0.26
629	0.24
630	0.2
631	0.24
632	0.23
633	0.22
634	0.21
635	0.18
636	0.17
637	0.15
638	0.17
639	0.17
640	0.18
641	0.18
642	0.17
643	0.18
644	0.18
645	0.18
646	0.16
647	0.11
648	0.11
649	0.11
650	0.11
651	0.11
652	0.1
653	0.1
654	0.08
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.1
660	0.1
661	0.11
662	0.11
663	0.12
664	0.16
665	0.21
666	0.27
667	0.3
668	0.37
669	0.44
670	0.49
671	0.52
672	0.48
673	0.44
674	0.4
675	0.39
676	0.38
677	0.34
678	0.32
679	0.33
680	0.37
681	0.43
682	0.44
683	0.5
684	0.53
685	0.58
686	0.66
687	0.72
688	0.76
689	0.78
690	0.82
691	0.83
692	0.76
693	0.72
694	0.72
695	0.65
696	0.64
697	0.61
698	0.59
699	0.57
700	0.62
701	0.65
702	0.63
703	0.61
704	0.56
705	0.53
706	0.5
707	0.45
708	0.41

A0A5E8C5L8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer