Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VHE4

Protein Details
Accession H1VHE4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22SETKPAKPTKAVKTDKPAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-35KPTKAVKTDKPAKADKADKSDKSKVHK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11, cyto 7, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003511  HORMA_dom  
IPR036570  HORMA_dom_sf  
IPR045091  Mad2-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF02301  HORMA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50815  HORMA  
Amino Acid Sequences MASETKPAKPTKAVKTDKPAKADKADKSDKSKVHKLALKGSAKLVAEFFQYSIHTILFQRGVYPAEDFSAVKKYGLNMLVSSDDQVRAYIKKIMGQLDRWMLRGKISKLVIVITDKDTGEHVERWQFDVEIFGKAAKSSKSTKSASKPSSSADQENDAVTEADADAAAAAPEKTEQEIQSEIAAIFRQITASVTFLPQLSGDCTFNVLVYADADSEVPVEWGDSDAKEIANGERVQLRGFSTSNHRVDTLVSYRLAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.74
3 0.8
4 0.78
5 0.76
6 0.72
7 0.68
8 0.7
9 0.69
10 0.66
11 0.65
12 0.68
13 0.67
14 0.69
15 0.71
16 0.68
17 0.69
18 0.7
19 0.66
20 0.66
21 0.65
22 0.61
23 0.62
24 0.65
25 0.61
26 0.53
27 0.49
28 0.45
29 0.4
30 0.37
31 0.29
32 0.21
33 0.18
34 0.17
35 0.16
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.14
48 0.15
49 0.14
50 0.15
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.19
62 0.2
63 0.19
64 0.14
65 0.15
66 0.17
67 0.16
68 0.16
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.12
76 0.15
77 0.14
78 0.18
79 0.2
80 0.25
81 0.26
82 0.26
83 0.28
84 0.3
85 0.3
86 0.28
87 0.27
88 0.21
89 0.23
90 0.27
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.24
95 0.23
96 0.23
97 0.21
98 0.17
99 0.17
100 0.12
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.14
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.15
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.11
123 0.08
124 0.11
125 0.14
126 0.19
127 0.25
128 0.27
129 0.33
130 0.39
131 0.47
132 0.47
133 0.46
134 0.43
135 0.39
136 0.43
137 0.4
138 0.35
139 0.28
140 0.27
141 0.24
142 0.23
143 0.21
144 0.15
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.12
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.17
218 0.17
219 0.17
220 0.2
221 0.21
222 0.22
223 0.22
224 0.22
225 0.2
226 0.2
227 0.21
228 0.27
229 0.35
230 0.38
231 0.38
232 0.37
233 0.33
234 0.35
235 0.38
236 0.34
237 0.28