Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E8BE38

Protein Details
Accession A0A5E8BE38    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1025-1050DEEAKRRQAKRTGKTGKQNGNAHRDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1030-1037RRQAKRTG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0098588  C:bounding membrane of organelle  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MPPPHSQEIPKAHAASNPQTTTNTRANHAQAASTSSQQQLQQQQQQQRPTDLDLVKAVLPQRILGLPSGERAKISALRAYSDKLLVGLTSGTLLVYSIDDPLASGRPRVTLIKTIRDFAPKGGVDRLGVLRDAGVLVALCDNVVSVYDLETLAFDETLSKTRGATTFAITFGVKPDDSDDDSSSLDKPPPPLTTVSRLVVACKRRLVCYEWRDSEFSEFREINMPDRAKSLEFLNPDRLVCGLGSGDYCTVDIPTAEISSIALPEPSSAGTHTHSFASVGISAYIGLGSRSPFPHATALPDDHTAFLAKDTASQFVDEHGHILDRPAIADWTAPPEALGYLYPYLLCVLPKHIELRNPYTTSLLQTVEIPGVKALTCGKFTCVATQNQVFRFQPVDLRTTVQALADKALLEEAISLLEHVDSAYISNREDLLRKFKTLKAIDMLKKKKFEPALALFSSVSADPKTVVELFPAQISGSGEDLIRYTDSVPNSRMLQSRTLSSSSSSSISSKSQIKGGKRTVGMPGTRQLSHTDSLGPPSSPSESVSSPTSSSSASSGDNSWSEKELSVALRALVNFLADTRRKIALITTADDPVDSSGQRLTAETYGGDLDKTASLVDTTMFKCYVIQSPALIGPLLRIHNHCDPAIVRPVLSHYGKWKDLIDFYFGKAFHREALELLRELSKPSTTTTAVTATPDYLKGPEPTVRYLQRLDNKYLDLIFEFAKWPLEFNATFGEDIFLEDSSESESLDREKVLAYLEDTSRALTIKYLEHVIFDKKEQNNAFHTALAINYIKSLSDTDNFDKLVSFLKPPDSKYKLSKVLLSLPAKNSDCTPQQLEIKAILYGKQGDARTALMIYTFELKDDAKAHAFCGEVYDADAELGRRALHTLISLYLTPPESVGGSEKQRLDLALDLLATQGSRMSVVEIINRLPEDTKIHDIAVFLTSQIRGLRAAWNGAQVDAALRKVHLVKVQEELLATQQKHTTTITSLRTCRICLKRLGHSVISVFPDGTAIHYGCARIYQEQLDEEAKRRQAKRTGKTGKQNGNAHRDSISKASS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.47
3 0.48
4 0.44
5 0.4
6 0.41
7 0.43
8 0.45
9 0.46
10 0.41
11 0.36
12 0.4
13 0.42
14 0.45
15 0.42
16 0.38
17 0.32
18 0.35
19 0.34
20 0.3
21 0.29
22 0.25
23 0.28
24 0.28
25 0.34
26 0.37
27 0.44
28 0.51
29 0.56
30 0.63
31 0.67
32 0.73
33 0.7
34 0.66
35 0.6
36 0.55
37 0.55
38 0.47
39 0.43
40 0.36
41 0.34
42 0.3
43 0.3
44 0.28
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.17
54 0.22
55 0.25
56 0.23
57 0.21
58 0.21
59 0.24
60 0.25
61 0.27
62 0.27
63 0.24
64 0.27
65 0.29
66 0.31
67 0.29
68 0.26
69 0.23
70 0.19
71 0.18
72 0.14
73 0.13
74 0.1
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.06
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.14
90 0.13
91 0.15
92 0.15
93 0.17
94 0.2
95 0.24
96 0.25
97 0.29
98 0.34
99 0.42
100 0.43
101 0.45
102 0.46
103 0.48
104 0.46
105 0.39
106 0.42
107 0.34
108 0.34
109 0.35
110 0.32
111 0.26
112 0.29
113 0.29
114 0.22
115 0.21
116 0.18
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.09
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.05
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.13
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.18
149 0.19
150 0.21
151 0.21
152 0.21
153 0.21
154 0.22
155 0.23
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.19
160 0.15
161 0.14
162 0.16
163 0.18
164 0.21
165 0.24
166 0.23
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.21
171 0.19
172 0.2
173 0.19
174 0.21
175 0.23
176 0.24
177 0.26
178 0.29
179 0.31
180 0.34
181 0.37
182 0.35
183 0.35
184 0.33
185 0.34
186 0.37
187 0.38
188 0.35
189 0.37
190 0.38
191 0.37
192 0.4
193 0.41
194 0.44
195 0.46
196 0.52
197 0.5
198 0.52
199 0.51
200 0.49
201 0.51
202 0.43
203 0.37
204 0.34
205 0.29
206 0.27
207 0.32
208 0.32
209 0.28
210 0.33
211 0.33
212 0.27
213 0.29
214 0.3
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.2
219 0.23
220 0.26
221 0.3
222 0.3
223 0.29
224 0.28
225 0.26
226 0.22
227 0.17
228 0.15
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.11
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.06
276 0.09
277 0.1
278 0.13
279 0.14
280 0.16
281 0.2
282 0.19
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.23
287 0.24
288 0.23
289 0.19
290 0.19
291 0.16
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.08
296 0.12
297 0.13
298 0.15
299 0.14
300 0.15
301 0.14
302 0.15
303 0.17
304 0.13
305 0.13
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.17
339 0.18
340 0.22
341 0.26
342 0.33
343 0.35
344 0.35
345 0.34
346 0.33
347 0.32
348 0.29
349 0.27
350 0.21
351 0.15
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.11
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.18
367 0.18
368 0.23
369 0.24
370 0.24
371 0.27
372 0.31
373 0.34
374 0.32
375 0.36
376 0.3
377 0.27
378 0.27
379 0.23
380 0.23
381 0.2
382 0.22
383 0.18
384 0.2
385 0.19
386 0.19
387 0.18
388 0.14
389 0.14
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.08
395 0.08
396 0.07
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.04
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.13
417 0.15
418 0.21
419 0.22
420 0.24
421 0.27
422 0.28
423 0.36
424 0.34
425 0.35
426 0.31
427 0.38
428 0.41
429 0.48
430 0.53
431 0.49
432 0.5
433 0.48
434 0.49
435 0.44
436 0.4
437 0.37
438 0.36
439 0.37
440 0.34
441 0.35
442 0.28
443 0.26
444 0.25
445 0.17
446 0.13
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.06
472 0.09
473 0.1
474 0.12
475 0.13
476 0.15
477 0.16
478 0.19
479 0.2
480 0.19
481 0.22
482 0.21
483 0.21
484 0.22
485 0.21
486 0.19
487 0.17
488 0.17
489 0.14
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.12
494 0.13
495 0.15
496 0.18
497 0.17
498 0.21
499 0.25
500 0.27
501 0.33
502 0.36
503 0.37
504 0.34
505 0.34
506 0.33
507 0.33
508 0.3
509 0.24
510 0.25
511 0.23
512 0.23
513 0.22
514 0.21
515 0.19
516 0.19
517 0.18
518 0.16
519 0.13
520 0.15
521 0.15
522 0.13
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.1
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.13
531 0.14
532 0.14
533 0.13
534 0.13
535 0.12
536 0.1
537 0.1
538 0.09
539 0.09
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.1
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.07
560 0.07
561 0.05
562 0.06
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.13
567 0.14
568 0.14
569 0.14
570 0.15
571 0.16
572 0.17
573 0.19
574 0.17
575 0.17
576 0.17
577 0.17
578 0.16
579 0.11
580 0.1
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.07
591 0.08
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.05
596 0.06
597 0.05
598 0.06
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.05
604 0.08
605 0.08
606 0.1
607 0.1
608 0.1
609 0.1
610 0.12
611 0.15
612 0.14
613 0.14
614 0.12
615 0.13
616 0.14
617 0.14
618 0.12
619 0.08
620 0.07
621 0.1
622 0.11
623 0.11
624 0.12
625 0.16
626 0.2
627 0.22
628 0.21
629 0.2
630 0.19
631 0.21
632 0.26
633 0.21
634 0.17
635 0.15
636 0.18
637 0.22
638 0.22
639 0.2
640 0.2
641 0.25
642 0.26
643 0.27
644 0.26
645 0.23
646 0.25
647 0.24
648 0.23
649 0.19
650 0.19
651 0.21
652 0.2
653 0.2
654 0.19
655 0.18
656 0.16
657 0.16
658 0.15
659 0.12
660 0.16
661 0.16
662 0.14
663 0.15
664 0.15
665 0.14
666 0.15
667 0.15
668 0.13
669 0.12
670 0.13
671 0.16
672 0.14
673 0.15
674 0.16
675 0.17
676 0.16
677 0.16
678 0.15
679 0.13
680 0.12
681 0.12
682 0.11
683 0.1
684 0.12
685 0.12
686 0.14
687 0.17
688 0.19
689 0.21
690 0.27
691 0.28
692 0.29
693 0.3
694 0.35
695 0.39
696 0.4
697 0.41
698 0.38
699 0.36
700 0.35
701 0.32
702 0.26
703 0.18
704 0.15
705 0.12
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.12
710 0.11
711 0.12
712 0.11
713 0.15
714 0.14
715 0.14
716 0.17
717 0.15
718 0.15
719 0.15
720 0.14
721 0.1
722 0.11
723 0.1
724 0.07
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.06
732 0.07
733 0.09
734 0.1
735 0.09
736 0.08
737 0.08
738 0.09
739 0.1
740 0.1
741 0.09
742 0.12
743 0.12
744 0.14
745 0.14
746 0.13
747 0.13
748 0.12
749 0.11
750 0.09
751 0.11
752 0.1
753 0.11
754 0.14
755 0.14
756 0.15
757 0.17
758 0.2
759 0.2
760 0.21
761 0.27
762 0.26
763 0.33
764 0.34
765 0.35
766 0.35
767 0.39
768 0.37
769 0.29
770 0.28
771 0.22
772 0.19
773 0.19
774 0.16
775 0.11
776 0.1
777 0.1
778 0.09
779 0.1
780 0.11
781 0.1
782 0.13
783 0.18
784 0.21
785 0.23
786 0.24
787 0.23
788 0.21
789 0.2
790 0.2
791 0.17
792 0.15
793 0.15
794 0.22
795 0.25
796 0.29
797 0.38
798 0.39
799 0.43
800 0.48
801 0.54
802 0.54
803 0.53
804 0.54
805 0.47
806 0.5
807 0.53
808 0.5
809 0.47
810 0.41
811 0.47
812 0.44
813 0.41
814 0.35
815 0.32
816 0.31
817 0.31
818 0.32
819 0.3
820 0.33
821 0.34
822 0.34
823 0.3
824 0.28
825 0.25
826 0.22
827 0.19
828 0.17
829 0.17
830 0.17
831 0.2
832 0.2
833 0.19
834 0.19
835 0.19
836 0.17
837 0.16
838 0.14
839 0.09
840 0.09
841 0.09
842 0.13
843 0.12
844 0.11
845 0.13
846 0.13
847 0.15
848 0.17
849 0.19
850 0.18
851 0.19
852 0.19
853 0.2
854 0.2
855 0.17
856 0.19
857 0.16
858 0.12
859 0.13
860 0.13
861 0.1
862 0.1
863 0.11
864 0.08
865 0.08
866 0.09
867 0.08
868 0.08
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.1
873 0.1
874 0.11
875 0.13
876 0.13
877 0.12
878 0.14
879 0.15
880 0.14
881 0.13
882 0.12
883 0.11
884 0.11
885 0.14
886 0.16
887 0.19
888 0.25
889 0.25
890 0.26
891 0.27
892 0.26
893 0.25
894 0.22
895 0.19
896 0.15
897 0.14
898 0.12
899 0.12
900 0.12
901 0.09
902 0.07
903 0.06
904 0.05
905 0.06
906 0.06
907 0.07
908 0.1
909 0.11
910 0.15
911 0.16
912 0.16
913 0.18
914 0.18
915 0.18
916 0.16
917 0.18
918 0.18
919 0.22
920 0.26
921 0.25
922 0.25
923 0.25
924 0.25
925 0.24
926 0.21
927 0.16
928 0.11
929 0.12
930 0.11
931 0.13
932 0.14
933 0.13
934 0.13
935 0.14
936 0.19
937 0.19
938 0.23
939 0.21
940 0.25
941 0.25
942 0.24
943 0.23
944 0.17
945 0.18
946 0.16
947 0.17
948 0.13
949 0.12
950 0.16
951 0.18
952 0.21
953 0.23
954 0.25
955 0.26
956 0.3
957 0.31
958 0.29
959 0.27
960 0.24
961 0.26
962 0.29
963 0.28
964 0.26
965 0.28
966 0.27
967 0.29
968 0.29
969 0.25
970 0.23
971 0.3
972 0.35
973 0.39
974 0.41
975 0.46
976 0.47
977 0.47
978 0.52
979 0.52
980 0.5
981 0.51
982 0.55
983 0.58
984 0.64
985 0.68
986 0.6
987 0.55
988 0.52
989 0.47
990 0.44
991 0.36
992 0.27
993 0.21
994 0.2
995 0.17
996 0.17
997 0.17
998 0.14
999 0.14
1000 0.15
1001 0.16
1002 0.15
1003 0.18
1004 0.18
1005 0.17
1006 0.2
1007 0.22
1008 0.23
1009 0.24
1010 0.27
1011 0.29
1012 0.29
1013 0.31
1014 0.36
1015 0.39
1016 0.45
1017 0.48
1018 0.53
1019 0.58
1020 0.66
1021 0.7
1022 0.74
1023 0.78
1024 0.79
1025 0.86
1026 0.88
1027 0.88
1028 0.86
1029 0.86
1030 0.84
1031 0.83
1032 0.75
1033 0.67
1034 0.59
1035 0.52
1036 0.46