Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VTF5

Protein Details
Accession H1VTF5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-39RNGSLPTPDSKRQRRAPEPGPEYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 12, nucl 11, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR010285  DNA_helicase_pif1-like  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR009027  Ribosomal_L9/RNase_H1_N  
IPR011320  RNase_H1_N  
IPR037056  RNase_H1_N_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
Pfam View protein in Pfam  
PF01693  Cauli_VI  
PF05970  PIF1  
Amino Acid Sequences MLAANIPVTPDKRGHARNGSLPTPDSKRQRRAPEPGPEYISLVSGDEEEYTSPNYRATPHNGSCSAYFPQEATPSSSAADAADRVSDRVDRLMADYTRNIPRQLYGKKAKYYVVWKGHQCGIFLDWSTCQAQVTGFKGNKYQSTTTYEAAVAILRQGLYERLEQSHEALRHHLRDETPYETPKEPLYEMRNEVRNEPCEPPKQMRNEPSNKPPYEPRNGIPNEPRNEPTYEPTYGPTYEPPKGPSQESPLYEPPKELRNEPRNETRVEILTPEPSRHAQDPSPPPPELTPPATNAAVAAPPTPTTSPEAGKAELPREPVLCKEQQNALDLAVQGRNLFITGSGGCGKSVLVKAIHKKLLAMDKVVHILAPTGQAALNIGGRTIFNYAAWVPEYMRKSLNDFIKASRRKRTWERLIKTQVLIIDEISMVENQVFERLSRIMAHIRCEADEGSSAPFGGVQIIVVGDFWTAPTGIWYTCPGEDDHGVFREEDKWAFKAPEWNRCNFIYVQLTKIHRQQDEEFVRILQKCRLGEDLEAADRRLLLQHPSEVENGTRLYCLRDAVKDYNEEEFARLKGRVREYWALDQFRYRYLYGSGEEARGEIEDVSDPPRDMITEDEFEKHTIYKDPTGRAPTSRKELKSLEDHRYHHCLALKLHMPVILLSNVRLPTPLPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.49
3 0.53
4 0.58
5 0.62
6 0.61
7 0.55
8 0.52
9 0.5
10 0.49
11 0.51
12 0.54
13 0.57
14 0.64
15 0.69
16 0.78
17 0.8
18 0.83
19 0.83
20 0.84
21 0.79
22 0.76
23 0.72
24 0.62
25 0.55
26 0.46
27 0.38
28 0.27
29 0.22
30 0.16
31 0.12
32 0.11
33 0.09
34 0.1
35 0.09
36 0.1
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.2
43 0.25
44 0.31
45 0.38
46 0.39
47 0.46
48 0.46
49 0.47
50 0.45
51 0.44
52 0.38
53 0.3
54 0.27
55 0.21
56 0.22
57 0.24
58 0.24
59 0.26
60 0.24
61 0.23
62 0.23
63 0.22
64 0.19
65 0.15
66 0.15
67 0.1
68 0.09
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.14
78 0.16
79 0.22
80 0.22
81 0.23
82 0.25
83 0.28
84 0.35
85 0.37
86 0.36
87 0.3
88 0.33
89 0.38
90 0.41
91 0.46
92 0.48
93 0.53
94 0.57
95 0.59
96 0.58
97 0.55
98 0.57
99 0.57
100 0.55
101 0.55
102 0.53
103 0.55
104 0.58
105 0.54
106 0.47
107 0.39
108 0.32
109 0.27
110 0.25
111 0.22
112 0.16
113 0.17
114 0.17
115 0.16
116 0.14
117 0.12
118 0.13
119 0.16
120 0.18
121 0.23
122 0.24
123 0.25
124 0.29
125 0.32
126 0.35
127 0.36
128 0.36
129 0.31
130 0.37
131 0.39
132 0.35
133 0.34
134 0.3
135 0.24
136 0.22
137 0.19
138 0.11
139 0.08
140 0.09
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.1
146 0.13
147 0.15
148 0.15
149 0.18
150 0.18
151 0.2
152 0.25
153 0.25
154 0.23
155 0.27
156 0.29
157 0.3
158 0.31
159 0.32
160 0.27
161 0.29
162 0.31
163 0.31
164 0.3
165 0.3
166 0.33
167 0.31
168 0.31
169 0.28
170 0.27
171 0.24
172 0.25
173 0.27
174 0.28
175 0.31
176 0.35
177 0.4
178 0.39
179 0.42
180 0.41
181 0.39
182 0.38
183 0.39
184 0.39
185 0.38
186 0.42
187 0.43
188 0.45
189 0.49
190 0.53
191 0.57
192 0.6
193 0.63
194 0.65
195 0.69
196 0.71
197 0.65
198 0.6
199 0.6
200 0.57
201 0.58
202 0.55
203 0.47
204 0.48
205 0.48
206 0.5
207 0.51
208 0.53
209 0.48
210 0.47
211 0.47
212 0.4
213 0.41
214 0.38
215 0.33
216 0.3
217 0.28
218 0.25
219 0.25
220 0.25
221 0.23
222 0.22
223 0.22
224 0.23
225 0.24
226 0.25
227 0.26
228 0.29
229 0.3
230 0.31
231 0.29
232 0.32
233 0.34
234 0.34
235 0.37
236 0.38
237 0.39
238 0.37
239 0.36
240 0.31
241 0.32
242 0.32
243 0.31
244 0.34
245 0.4
246 0.45
247 0.48
248 0.55
249 0.52
250 0.52
251 0.49
252 0.41
253 0.33
254 0.29
255 0.25
256 0.17
257 0.2
258 0.19
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.2
263 0.2
264 0.22
265 0.18
266 0.26
267 0.33
268 0.37
269 0.4
270 0.37
271 0.36
272 0.34
273 0.36
274 0.31
275 0.28
276 0.23
277 0.21
278 0.24
279 0.23
280 0.22
281 0.18
282 0.15
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.06
287 0.06
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.18
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.16
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.18
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.23
311 0.24
312 0.25
313 0.24
314 0.2
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.11
319 0.1
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.06
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.13
339 0.19
340 0.24
341 0.26
342 0.24
343 0.24
344 0.26
345 0.3
346 0.28
347 0.24
348 0.2
349 0.19
350 0.2
351 0.19
352 0.16
353 0.09
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.05
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.14
379 0.15
380 0.16
381 0.17
382 0.17
383 0.2
384 0.25
385 0.29
386 0.27
387 0.27
388 0.3
389 0.38
390 0.45
391 0.46
392 0.49
393 0.48
394 0.51
395 0.59
396 0.66
397 0.67
398 0.7
399 0.71
400 0.71
401 0.76
402 0.71
403 0.62
404 0.53
405 0.44
406 0.34
407 0.29
408 0.19
409 0.13
410 0.1
411 0.09
412 0.08
413 0.07
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.1
425 0.12
426 0.17
427 0.19
428 0.22
429 0.24
430 0.24
431 0.23
432 0.24
433 0.22
434 0.16
435 0.15
436 0.13
437 0.11
438 0.1
439 0.1
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.06
459 0.07
460 0.08
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.12
466 0.14
467 0.15
468 0.16
469 0.17
470 0.17
471 0.17
472 0.16
473 0.17
474 0.16
475 0.16
476 0.17
477 0.16
478 0.17
479 0.18
480 0.2
481 0.2
482 0.27
483 0.31
484 0.39
485 0.4
486 0.41
487 0.43
488 0.42
489 0.44
490 0.35
491 0.35
492 0.33
493 0.3
494 0.31
495 0.33
496 0.36
497 0.36
498 0.42
499 0.43
500 0.36
501 0.4
502 0.4
503 0.45
504 0.46
505 0.44
506 0.39
507 0.33
508 0.37
509 0.34
510 0.34
511 0.28
512 0.28
513 0.26
514 0.28
515 0.3
516 0.26
517 0.25
518 0.26
519 0.25
520 0.25
521 0.25
522 0.23
523 0.2
524 0.18
525 0.18
526 0.16
527 0.15
528 0.14
529 0.16
530 0.19
531 0.21
532 0.23
533 0.24
534 0.23
535 0.22
536 0.2
537 0.19
538 0.16
539 0.15
540 0.13
541 0.15
542 0.15
543 0.17
544 0.18
545 0.2
546 0.26
547 0.3
548 0.33
549 0.33
550 0.33
551 0.34
552 0.33
553 0.3
554 0.26
555 0.23
556 0.22
557 0.22
558 0.22
559 0.23
560 0.28
561 0.33
562 0.36
563 0.41
564 0.47
565 0.49
566 0.57
567 0.59
568 0.56
569 0.51
570 0.53
571 0.47
572 0.44
573 0.42
574 0.33
575 0.27
576 0.26
577 0.28
578 0.23
579 0.27
580 0.25
581 0.23
582 0.23
583 0.21
584 0.19
585 0.16
586 0.15
587 0.1
588 0.09
589 0.09
590 0.1
591 0.13
592 0.14
593 0.14
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.13
598 0.16
599 0.18
600 0.2
601 0.21
602 0.23
603 0.24
604 0.25
605 0.25
606 0.23
607 0.2
608 0.23
609 0.26
610 0.32
611 0.36
612 0.4
613 0.45
614 0.51
615 0.52
616 0.53
617 0.56
618 0.55
619 0.59
620 0.63
621 0.59
622 0.59
623 0.59
624 0.58
625 0.61
626 0.61
627 0.61
628 0.61
629 0.61
630 0.61
631 0.65
632 0.59
633 0.54
634 0.52
635 0.47
636 0.41
637 0.47
638 0.46
639 0.4
640 0.4
641 0.37
642 0.32
643 0.28
644 0.29
645 0.24
646 0.19
647 0.18
648 0.22
649 0.21
650 0.21
651 0.21